Avsunviroidae
アブサンウイロイド科はのファミリーであるウイロイド。3つの属（Avsunviroid、Elaviroid、Pelamoviroid）には4つの種がそれらは、長さが246〜375ヌクレオチドのRNAゲノムで構成されています。それらは一本鎖共有結合円であり、分子内塩基対を持っています。すべてのメンバーは中央の保存された領域を欠いています。
アブサンウイロイド科
ウイルス分類（ランクなし）： ウイルス
レルム： incertae sedis 王国： incertae sedis
門： incertae sedis
クラス： incertae sedis
注文： incertae sedis
家族： アブサンウイロイド科属 Avsunviroid
エラビロイド
ペラモビロイド
コンテンツ
1 レプリケーション2 構造 3 分類 4 検出
5 参考文献
6 外部リンク
レプリケーション
複製は植物細胞の葉緑体で起こります。複製の主な機能には、ヘルパーウイルスが不要で、タンパク質がコード化されていないことが含まれます。他のウイロイド科とは異なり、ポスピウイロイド科、アブサンウイロイド科対称的なローリングメカニズムを介して複製すると考えられています。正のRNA鎖は、RNAポリメラーゼプラス3 IIと考えられる酵素の助けを借りて、負の鎖を形成するためのテンプレートとして機能すると考えられています。次に、マイナスRNA鎖はリボザイム活性によって切断され、環状化します。2番目のローリングサークルメカニズムはプラス鎖を形成し、これもリボザイム活性によって切断され、次に結紮されて環状になります。複製部位は不明ですが、葉緑体にあり、Mg2 +イオンの存在下にあると考えられています。
構造
構造の予測は、それらがいくつかのヘアピンループの形成を引き起こす塩基対の領域を有する棒状の分子として存在するか、または分岐した構成を有することを示唆している。
家族は保存されたヌクレオチドの4つのストレッチを持っています、 guuuc、 uc、 ucag、 交流5 ‘から3’に加えて、ループのもう一方の端にあるワトソン-クリックのペアリング。これはハンマーヘッド型リボザイムの一部です。それ以外の場合、家族の構造的な類似性はほとんどありません。ポスピウイロイド科からの分離を定義する特徴の1つである、保存されたCCH、TCR、またはTCHモチーフがありません。
分類
家族には3つの属があり、合計5つの種が
アブサンウイロイド科
属Avsunviroid ;
種：アボカドサンブロッチウイロイド（ASBVd、acc。J02020、gen。len。247nt）
属Elaviroid ;
種：ナス潜伏ウイロイド（ELVd、acc。AJ536613、gen。len。333nt）
属ペラモビロイド;
種：アップルハンマーヘッドウイロイド、Chrysanthemumクロロティックモットルウイロイド（CChMVd、acc。Y14700、gen。len。399nt）およびピーチ潜在モザイクウイロイド（PLMVd、acc。M83545、gen。len。337nt）
検出
中央に長く保存された領域がないため、アブサンウイロイド科はポスピウイロイド科よりも識別が困難です。それらを検出する方法は、それらの真円度を使用することです。コンピューターは、直線的に配置されたときに繰り返しを形成するように見える多くの重複する読み取りをつなぎ合わせることができます。
参考文献
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フローレス、リカルド; エルナンデス、カルメン; アルバ、A。エミリオマルティネスデ; ダロス、ホセ-アントニオ; セリオ、フランチェスコディ（2005）。「ウイロイドとウイロイド-宿主相互作用」。植物病理学の年次レビュー。年次レビュー。43（1）：117–139。土井：10.1146 /annurev.phyto.43.040204.140243。ISSN 0066から4286まで。PMID 16078879。
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^ p。 120、 “しかし、PLMVdとCChMVdは、シュードノット（10; S. Gago、M。DelaPeňa＆R。Flores、未発表）によって安定化された分岐二次構造（21、45、65）のため、1つの属にグループ化されています。結果）（図1b）、および2M LiCl（65）への不溶性。
外部リンク
ICTVオンライン（第10回）レポート; アブサンウイロイド科
MicrobiologyBytes：ウイロイドからアーカイブ、オリジナルの2007年2月24日には、取得した2007年3月16日を
植物ウイルスの説明-アブサンウイロイド科、2007年2月13日にオリジナルからアーカイブ、
研究に触媒RNA分子でRELEVANT TO THE RNAワールド仮説 （PDF）からアーカイブされ、元の （PDF） 2011-07-22に