B3/B4_tRNA-binding_domain
B3 / B4ドメインは、tRNAシンテターゼベータサブユニット、および一部の非tRNAシンテターゼタンパク質に見られます。 B3_4 trnaおよびフェニルアラニル-アデニル酸類似体と複合体を形成したサーマスサーモフィルス由来のフェニルアラニル-trnaシンテターゼ
識別子
シンボル3_4 Pfam F03483
Pfam氏族L0383 InterPro PR005146 SCOP2
1pys / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
関数
アミノアシルtRNAシンテターゼは、編集反応を触媒して、アミノ酸の活性化およびtRNAのエステル化中に生成されたエラーを修正し、誤ったアミノ酸がtRNAに付着するのを防ぎます。ベータサブユニットのB3 / B4ドメインには、アルファサブユニットの活性部位の近くにある編集部位が含まれています。このサイトの破壊により、遺伝暗号の忠実な翻訳に不可欠なプロセスであるtRNA編集が廃止されました。
構造
このドメインは3層構造であり、異常なトポロジーのベータサンドイッチ フォールドを含み、推定上のtRNA結合構造モチーフを含みます。において、サーマス・サーモは、両方の触媒アルファ及び非触媒ベータサブユニットは、特性含ん倍クラスII活性部位のドメイン。存在RNA U1Aのと同様の結合性ドメイン、スプライセオソームtRNA合成酵素のβサブユニット中のタンパク質は、示し構造RNA結合性の異なるファミリー間の関係タンパク質。
参考文献
^ Roy H、Ling J、Irnov M、Ibba M。「フェニルアラニル-tRNAシンテターゼのベータサブユニットによるinvitroおよびinvivoでの転移後編集」。EMBOJ。23（23）：4639–48。土井：10.1038 /sj.emboj.7600474。PMC 533057。PMID 15526031。
^ Mosyak L、Reshetnikova L、Goldgur Y、Delarue M、Safro MG（1995年7月）。「Thermusthermophilusからのフェニルアラニル-tRNAシンテターゼの構造」。ナット。構造体。Biol。2（7）：537–47。土井：10.1038 / nsb0795-537。PMID 7664121。S2CID 13042127。
には、パブリックドメインのPfamと
InterProからのテキストが組み込まれています ： IPR005146