B3_domain
B3 DNA結合ドメイン（DBD）は、他のドメイン（InterPro： IPR003340）と組み合わされた転写因子（≥40種）（Pfam PF02362）にのみ見られる高度に保存された ドメインです。それは、7つ含む、100-120残基からなるβ鎖二のαヘリックスDNA結合pseudobarrel形態倍タンパク質（SCOP 117343を）それはDNAの主要な溝と相互作用します。
B3DNA結合ドメイン
RAV1のB3DNA結合ドメイン
識別子
シンボル 3_domain Pfam F02362 InterPro PR003340 PROSITE S50863 SCOP2 1wid / SCOPe / SUPFAMCDD d10017
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要 PDB 1wid、 1yel
コンテンツ
1 B3ファミリー
2 関連タンパク質
3 も参照してください
4 参考文献
5 外部リンク
B3ファミリー
シロイヌナズナ、B3ドメインを含む転写因子の三つの主要なファミリーがある：
ARF（A uxin R esponse Fアクター）
ABI3（AB scisic酸 Iはnsensitive 3）
RAV（Rはに高揚A BI3 / V P1）
タンパク質 ARF1- B3 ABI3- B3 RAV1- B3
によって導出されたB3構造 分子モデル
分子モデル NMR B3認識配列 TGTCTC CATGCA CACCTG
PDB：1WID 及びPDB：1YEL は唯一知られているNMR結合ドメインB3のDNAの溶液相構造。
関連タンパク質
制限エンドヌクレアーゼEcoRIIのN末端ドメイン; 制限エンドヌクレアーゼBfiIのC末端ドメインは、同様のDNA結合疑似バレルタンパク質フォールドを持っています。
も参照してください
制限エンドヌクレアーゼEcoRII
オーキシン
アブシジン酸
参考文献
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外部リンク
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Transfacデータベースによる「転写因子」表での分類。
シロイヌナズナの転写因子のデータベース
B3 アーカイブで2019年10月17日ウェイバックマシン、RAV、およびARF アーカイブで2019年10月17日ウェイバックマシンで家族PlantTFDB：植物転写因子データベース