BOP1


BOP1
リボソーム生合成タンパク質BOP1は、ヒトではBOP1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 BOP1 識別子
エイリアス
BOP1、増殖ブロック1、BOP1リボソーム生合成因子
外部ID
OMIM:610596 MGI:1334460 HomoloGene:6612 GeneCards:BOP1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 8番染色体(ヒト)
バンド 8q24.3 始める
144,262,045 bp
終わり
144,291,438 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 15番染色体(マウス)
バンド
15 D3 | 15 35.91 cM
始める
76,452,989 bp
終わり
76,477,277 bp
RNA発現パターン
その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
• リボヌクレオタンパク質複合体結合• GO:0001948タンパク質結合• RNA結合
細胞成分
• 核小体• 核• PeBoW複合体• 核質• プレリボソーム、大サブユニット前駆体• リボ核タンパク質複合体
生物学的プロセス
• リボソームラージサブユニット生合成• トリシストロン性rRNA転写産物(SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA)の5.8SrRNAとLSU-rRNA間のITS2の切断• 細胞集団増殖• リボソーム生合成• 細胞サイクルの調節• rRNAプロセシング• トリシストロン性rRNA転写産物からのLSU-rRNAの成熟(SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA)• リボソームラージサブユニットアセンブリ• p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節• トリシストロン性rRNA転写産物からの5.8S rRNAの成熟(SSU-rRNA 、5.8S rRNA、LSU-rRNA)
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみ Entrez23246 12181 Ensembl ENSG00000261236 ENSG00000285301 ENSMUSG00000022557 UniProt Q14137 P97452
RefSeq(mRNA)NM_015201 NM_013481
RefSeq(タンパク質)NP_056016 NP_038509
場所(UCSC)
Chr 8:144.26 – 144.29 Mb
15番染色体:76.45 – 76.48 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/

コンテンツ
1 関数
2 構造
3 参考文献
4 外部リンク
5 参考文献

関数
これは、rRNAプロセッシングに関与するWD40リピート含有核小体タンパク質であり、それによって細胞周期を制御します。 25Sおよび5.8SリボソームRNAの成熟に必要です。これは、pre-rRNAのスペーサー領域のプロセシングを調整するリボソーム形成の必須因子として役立つ可能性がPes1-Bop1複合体には、BOP1、GRWD1、PES1、ORC6L、およびRPL3のいくつかのコンポーネントがあり、リボソーム生合成と染色体分離の変化に関与しています。BOP1の過剰発現は、ヒト細胞における多極紡錘体の割合を増加させます。BOP1経路の規制緩和は、ヒトの結腸直腸腫瘍形成に寄与する可能性が Bop1のレベルが上昇すると、Bop1 / WDR12およびBop1 / Pes1サブコンプレックスが誘導され、PeBoWコンプレックスのアセンブリと整合性はBop1タンパク質レベルの変化に非常に敏感です。
Nop7p- Erb1p -Ytm1pは、酵母に見られる、潜在的にある相同それはリボソーム生合成の制御に関与しているようPES1-BOP1-WDR12の複合S期エントリー。PeBoW複合体の完全性は、哺乳類 細胞におけるリボソーム生合成と細胞増殖に必要です。ジアルジアでは、種特異的な細胞骨格タンパク質であるベータジャルダンがBop1と相互作用します。

構造 BOP1NT 識別子
シンボルOP1NT Pfam F08145 InterPro PR012953
利用可能なタンパク質構造:
Pfam  
構造/ ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
BOP1には、保存されたN末端ドメインBOP1NTが含まれています。

参考文献
^ ENSG00000285301 GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000261236、ENSG00000285301 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000022557 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 長瀬T、関N、田中A、石川K、野村N(1996年3月)。「未確認のヒト遺伝子のコード配列の予測。IV。ヒト細胞株KG-1からのcDNAクローンの分析によって推定された40の新しい遺伝子(KIAA0121-KIAA0160)のコード配列」。DNA解像度。2(4):167–74、199–210。土井:10.1093 / dnares /2.4.167。PMID 8590280。   ^ 「Entrez遺伝子:増殖のBOP1ブロック1」。
^ Kim J、Goo SY、Chung HJ、Yang HW、Yong TS、Lee KH、Park SJ。「ランブル鞭毛虫におけるベータジャルジンとBop1タンパク質の相互作用」。パラシトール。解像度。98(2):138–44。土井:10.1007 / s00436-005-0040-8。PMID 16362343。S2CID 24519868。    ^ Killian A、Sarafan-Vasseur N、SesboüéR、Le Pessot F、Blanchard F、Lamy A、Laurent M、Flaman JM、FrébourgT。「8q24に位置するBOP1遺伝子の結腸直腸腫瘍形成への寄与」。遺伝子染色体がん。45(9):874–81。土井:10.1002 /gcc.20351。PMID 16804918。S2CID 38299400。    ^ Rohrmoser M、HölzelM、Grimm T、Malamoussi A、Harasim T、Orban M、Pfisterer I、Gruber-Eber A、Kremmer E、Eick D。「Pes1、Bop1、およびWDR12の相互依存性は、60Sリボソームサブユニットの成熟に必要な核小体の局在化とPeBoW複合体の集合を制御します」。モル。細胞。Biol。27(10):3682–94。土井:10.1128 /MCB.00172-07。PMC 1899993。PMID 17353269。    ^ HölzelM、Rohrmoser M、Schlee M、Grimm T、Harasim T、Malamoussi A、Gruber-Eber A、Kremmer E、Hiddemann W、Bornkamm GW、Eick D。「哺乳類のWDR12はPes1-Bop1複合体の新規メンバーであり、リボソーム生合成と細胞増殖に必要です」。J. CellBiol。170(3):367–78。土井:10.1083 /jcb.200501141。PMC 2171466。PMID 16043514。   

外部リンク
UCSC GenomeBrowserのヒトBOP1ゲノム位置とBOP1遺伝子詳細ページ。

参考文献
Zhang Y、Koushik S、Dai R、Mivechi NF(1999)。「ネズミ熱ショック転写因子-1遺伝子の構造的構成とプロモーター分析」。J.Biol。化学。273(49):32514–21。土井:10.1074 /jbc.273.49.32514。PMID  9829985。
中津良T、千住S、山田K、城塚T、小川M、西村Y(2001)。「膵臓癌で過剰発現する免疫原性抗原の遺伝子クローニング」。生化学。生物物理学。解像度 コミュン。281(4):936–44。土井:10.1006 /bbrc.2001.4377。PMID  11237751。
Pestov DG、Strezoska Z、Lau LF(2001)。「リボソーム生合成と細胞周期の間のp53依存性クロストークの証拠:G(1)/ S遷移に対する核小体タンパク質Bop1の影響」。モル。細胞。Biol。21(13):4246–55。土井:10.1128 /MCB.21.13.4246-4255.2001。PMC  87085。PMID  11390653。
Pestov DG、Stockelman MG、Strezoska Z、Lau LF(2001)。「哺乳類Bop1の酵母ホモログであるERB1は、25Sおよび5.8SリボソームRNAの成熟に必要な必須遺伝子です」。核酸解像度。29(17):3621–30。土井:10.1093 / nar /29.17.3621。PMC  55883。PMID  11522832。
Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、Leung AK、Lam YW、Steen H、Mann M、Lamond AI(2002)。「ヒト核小体の指示されたプロテオミクス分析」。Curr。Biol。12(1):1–11。土井:10.1016 / S0960-9822(01)00650-9。PMID  11790298。S2CID  14132033。
Strezoska Z、Pestov DG、Lau LF(2002)。「マウス核小体タンパク質Bop1の機能的不活性化は、プレrRNAプロセシングの複数のステップを阻害し、細胞周期の進行をブロックします」。J.Biol。化学。277(33):29617–25。土井:10.1074 /jbc.M204381​​200。PMID  12048210。
Scherl A、CoutéY、DéonC、CalléA、Kindbeiter K、Sanchez JC、Greco A、Hochstrasser D、Diaz JJ(2003)「ヒト核小体の機能的プロテオミクス分析」。モル。Biol。セル。13(11):4100–9。土井:10.1091 /mbc.E02-05-0271。PMC  133617。PMID  12429849。
Lapik YR、Fernandes CJ、Lau LF、Pestov DG(2004)。「哺乳類のリボソーム生合成におけるPes1とBop1の間の物理的および機能的相互作用」。モル。セル。15(1):17–29。土井:10.1016 /j.molcel.2004.05.020。PMID  15225545。
Andersen JS、Lam YW、Leung AK、Ong SE、Lyon CE、Lamond AI、Mann M(2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。自然。433(7021):77–83。Bibcode:2005Natur.433 … 77A。土井:10.1038 / nature03207。PMID  15635413。S2CID  4344740。
Nousiainen M、SilljéHH、Sauer G、Nigg EA、KörnerR(2006)。「ヒト有糸分裂紡錘体のホスホプロテオーム分析」。手順 国立 Acad。科学 アメリカ。103(14):5391–6。Bibcode:2006PNAS..103.5391N。土井:10.1073 /pnas.0507066103。PMC  1459365。PMID  16565220。
Beausoleil SA、VillénJ、Gerber SA、Rush J、Gygi SP(2006)。「高スループットのタンパク質リン酸化分析と部位局在化のための確率ベースのアプローチ」。ナット。バイオテクノロジー。24(10):1285–92。土井:10.1038 / nbt1240。PMID  16964243。S2CID  14294292。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M(2006)。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、インビボ、および部位特異的リン酸化ダイナミクス」。セル。127(3):635–48。土井:10.1016 /j.cell.2006.09.026。PMID  17081983。S2CID  7827573。
Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O’Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D(2007)。「質量分析によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。モル。システム。Biol。3(1):89 DOI:10.1038 / msb4100134。PMC  1847948。PMID  17353931。
には、パブリックドメインのPfamと
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  ヒト8番染色体上の遺伝子に関するこ