BOSS_(molecular_mechanics)
生化学的および有機シミュレーションシステム（BOSS）は、分子力学計算、メトロポリスモンテカルロ統計力学シミュレーション、および半経験的 オースチンモデル1（AM1）、PM3、およびPDDG / PM3量子力学計算を実行する汎用分子モデリングプログラムです。分子力学計算は、エネルギー最小化、ノーマルモード解析、および液体シミュレーションの最適化ポテンシャル（OPLS）力場を使用した配座探索を対象としています。BOSSは、イェール大学のWilliam L.Jorgensen教授によって開発されました。、Cemcomco、LLCおよびSchrödinger、Inc。によって商業的に配布されています。
生化学的および有機的シミュレーションシステム
原作者
ウィリアム・L・ジョーゲンセン
開発者
イェール大学ヨルゲンセン研究グループ
初回リリース
1987 ; 34年前 （1987）
安定リリース
4.9 / 2013年1月 ; 8年前 （2013-01）
で書かれている Fortran オペレーティング・システム
Unix、Linux、Windows
プラットホーム
x86、x86-64 タイプ
分子モデリング
ライセンス
専有
Webサイト
zarbi .chem .yale .edu / software .html
コンテンツ
1 主な機能
2 も参照してください
3 参考文献
4 外部リンク
主な機能
OPLS 力場発明者
形状の最適化
半経験的量子化学
純粋な液体、溶液、クラスター、または気相システムのMCシミュレーション
自由エネルギーは、統計的摂動（自由エネルギー摂動（FEP））理論から計算されます
TIP3P、TIP4P、およびTIP5P水モデル
も参照してください
分子モデリング
分子グラフィックス
分子エディタ
分子設計ソフトウェア
モンテカルロ分子モデリング用ソフトウェアのリスト
分子グラフィックスシステムのリスト
分子動力学モデリングのためのソフトウェアの比較
アワビ（分子力学）
アンバーscalaph Designer HARMM ROMACS DynaMix AMD
いじくり回し（ソフトウェア）
参考文献
^ ヨルゲンセン、WL; Tirado-Rives、J。（2005）。「BOSSとMCPROを使用した有機および生体分子システムの分子モデリング」。J.計算。化学。26（16）：1689–1700。土井：10.1002 /jcc.20297。PMID 16200637。
外部リンク
公式サイト