BPTF
ヌクレオソームリモデリング因子サブユニットBPTFは、ヒトではBPTF遺伝子によってコードされるタンパク質です。 BPTF 利用可能な構造 PDB Human UniProt検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
2F6J、2F6N、2FSA、2FUI、2FUU、2RI7、3QZS、3QZT、3QZV、3UV2
識別子
エイリアス
BPTF、FAC1、FALZ、NURF301、ブロモドメインPHDフィンガー転写因子、NEDDFL
外部ID
OMIM：601819 MGI：2444008 HomoloGene：114397 GeneCards：BPTF
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 17番染色体（ヒト）
バンド 17q24.2 始める
67，825，503 bp
終わり
67，984，378 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 11番染色体（マウス）
バンド
11 | 11 E1
始める
107，033，081 bp
終わり
107，132，127 bp
RNA発現パターン
その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
• 配列特異的DNA結合• ATPase、DNAに作用• 転写因子結合• 金属イオン結合• GO：0001948タンパク質結合• メチル化ヒストン結合
細胞成分
• 細胞質• 細胞体• 核質• 樹状突起• NURF複合体• 細胞質の核周辺領域• ニューロン投射• 細胞外エクソソーム• 核• Set1C / COMPASS複合体
生物学的プロセス
• クロマチンリモデリング• 神経成長因子刺激に対する細胞応答• 内胚葉の発達• 転写の調節、DNAテンプレート• 胚性胎盤の発達• RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節• 転写、DNAテンプレート• 転写の正の調節、DNAテンプレート• 脳の発達• 創傷に応答• 前/後のパターンは、本明細書• 共有クロマチン修飾• クロマチン組織• RNAによる転写の調節は、ポリメラーゼII • RNAによる転写の正の調節は、IIのポリメラーゼ
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez2186 207165 Ensembl ENSG00000171634 ENSMUSG00000040481 UniProt Q12830
該当なし
RefSeq（mRNA） NM_004459 NM_182641 NM_001080832 NM_176850 NM_001359590
RefSeq（タンパク質） NP_004450 NP_872579 該当なし
場所（UCSC）
Chr 17：67.83 – 67.98 Mb
Chr 11：107.03 – 107.13 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
この遺伝子は、アルツハイマー病患者の脳ホモジネートに対して調製されたモノクローナル抗体に対するそのコードされたタンパク質の反応性によって同定されました。DNA結合ドメインとジンクフィンガーモチーフを含む810aaタンパク質として同定された元のタンパク質（胎児Alz-50反応性クローン1、またはFAC1）の分析は、それが転写の調節に役割を果たす可能性があることを示唆しました。高レベルのFAC1は、胎児の脳と神経変性疾患の患者で検出されました。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、実際には当初考えられていたよりもはるかに大きく、増殖中に転写を調節するタンパク質に特徴的なC末端のブロモドメインも含んでいます。コードされたタンパク質は、ショウジョウバエNURF（ヌクレオソームリモデリング因子）複合体の最大のサブユニットと非常によく似ています。ショウジョウバエでは、DNA上を滑るヌクレオソームを触媒し、配列特異的な転写因子と相互作用するNURF複合体が、転写に必要なクロマチンリモデリングに必要です。異なるアイソフォームをコードする2つの代替転写物が完全に説明されています。
コンテンツ
1 相互作用
2 参考文献
3 外部リンク
4 参考文献
相互作用
BPTFはMAZと相互作用することが示されています。
参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000171634 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000040481 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス：」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Bowser R（1997年3月）。「蛍光insituハイブリダイゼーションによる染色体17q24へのヒトFAC1遺伝子の割り当て」。ゲノミクス。38（3）：455–7。土井：10.1006 /geno.1996.0657。PMID 8975731。 ^ ジョーンズMH、ハマナN、島根M。「新規ブロモドメイン転写因子であるBPTFの同定と特性評価」。ゲノミクス。63（1）：35–9。土井：10.1006 /geno.1999.6070。PMID 10662542。 ^ Wysocka J、Swigut T、Xiao H、Milne TA、Kwon SY、Landry J、Kauer M、Tackett AJ、Chait BT、Badenhorst P、Wu C、Allis CD。「NURFのPHDフィンガーは、ヒストンH3リジン4トリメチル化とクロマチンリモデリングを結びつけます」。自然。442（7098）：86–90。Bibcode：2006Natur.442 … 86W。土井：10.1038 / nature04815。PMID 16728976。S2CID 4389087。 ^ 「Entrez遺伝子：BPTFブロモドメインPHDフィンガー転写因子」。
^ ヨルダン-Sciutto、KL; Dragich JM; カルタガロンJ; ホールDJ; クッパR。「胎児Alz-50クローン1（FAC1）タンパク質は、Myc関連ジンクフィンガータンパク質（ZF87 / MAZ）と相互作用し、その転写活性を変化させます」。生化学。アメリカ。39（12）：3206–15。土井：10.1021 / bi992211q。ISSN 0006から2960まで。PMC 3667205。PMID 10727212。
外部リンク
UCSC GenomeBrowserのヒトBPTFゲノム位置とBPTF遺伝子詳細ページ。
参考文献
Bowser R、Giambrone A、Davies P（1995）。「モノクローナル抗体Alz50で同定された新規遺伝子であるFAC1は、ヒトの脳で発生的に調節されています」。開発者 Neurosci。17（1）：20–37。土井：10.1159 / 000111270。PMID 7621746。
Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB（1997）。「正規化と減算：遺伝子発見を容易にする2つのアプローチ」。ゲノム解像度。6（9）：791–806。土井：10.1101 /gr.6.9.791。PMID 8889548。
Zhu P、Bowser R（1997）。「ヒトFAC1遺伝子の完全なcDNA配列の同定と分析」。Biochim。生物物理学。アクタ。1309（1–2）：5–8。土井：10.1016 / s0167-4781（96）00127-3。PMID 8950167。
Mu X、Springer JE、Bowser R（1997）。「発達中、成人、および筋萎縮性側索硬化症脊髄の運動ニューロンにおけるFAC1の発現と局在」。Exp。Neurol。146（1）：17–24。土井：10.1006 /exnr.1997.6508。PMID 9225734。S2CID 25924273。
Jordan-Sciutto KL、Dragich JM、Bowser R（1999）。「胎児のAlz-50クローン1（FAC1）タンパク質のDNA結合活性は、リン酸化によって増強されます」。生化学。生物物理学。解像度 コミュン。260（3）：785–9。土井：10.1006 /bbrc.1999.0986。PMID 10403843。
Jordan-Sciutto KL、Dragich JM、Rhodes JL、Bowser R（2000）。「新しいジンクフィンガータンパク質であるFetalAlz-50 clone 1は、特定のDNA配列に結合し、転写調節因子として機能します」。J.Biol。化学。274（49）：35262–8。土井：10.1074 /jbc.274.49.35262。PMC 3670955。PMID 10575013。
Jordan-Sciutto KL、Dragich JM、Caltagarone J、他 （2000）。「胎児Alz-50クローン1（FAC1）タンパク質は、Myc関連ジンクフィンガータンパク質（ZF87 / MAZ）と相互作用し、その転写活性を変化させます」。生化学。39（12）：3206–15。土井：10.1021 / bi992211q。PMC 3667205。PMID 10727212。
Jordan-Sciutto K、Rhodes J、Bowser R（2002）。「Abetaペプチドに応答して、そしてアルツハイマー病の間の転写調節因子の細胞内分布の変化」。メカ。エイジング開発。123（1）：11–20。土井：10.1016 / S0047-6374（01）00334-7。PMID 11640947。S2CID 34907508。
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。（2003）。「15，000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。手順 国立 Acad。科学 アメリカ。99（26）：16899–903。Bibcode：2002PNAS … 9916899M。土井：10.1073 /pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Rhodes J、Lutka FA、Jordan-Sciutto KL、Bowser R（2003）。「PC12細胞のNGF誘発神経突起伸長中のFAC1の発現と分布の変化」。NeuroReport。14（3）：449–52。土井：10.1097 / 00001756-200303030-00030。PMID 12634501。S2CID 28755165。
Barak O、Lazzaro MA、LaneWSなど。（2004）。「ヒトNURFの単離：エングレイルド遺伝子発現の調節因子」。EMBOJ。22（22）：6089–100。土井：10.1093 / emboj / cdg582。PMC 275440。PMID 14609955。
太田毅、鈴木悠、西川毅他 （2004）。「21，243個の完全長ヒトcDNAの完全な配列決定と特性評価」。ナット。ジェネット。36（1）：40–5。土井：10.1038 / ng1285。PMID 14702039。S2CID 21903526。
Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、他 （2004）。「HeLa細胞の核リンタンパク質の大規模な特性評価」。手順 国立 Acad。科学 アメリカ。101（33）：12130–5。Bibcode：2004PNAS..10112130B。土井：10.1073 /pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
Strachan GD、Morgan KL、OtisLLなど。（2004）。「胎児Alz-50クローン1は、ケルチ様Ech関連タンパク質のヒトオルソログと相互作用します」。生化学。43（38）：12113–22。土井：10.1021 / bi0494166。PMC 3670950。PMID 15379550。
Gerhard DS、Wagner L、FeingoldEAなど。（2004）。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」。ゲノム解像度。14（10B）：2121–7。土井：10.1101 /gr.2596504。PMC 528928。PMID 15489334。
Strachan GD、Ostrow LA、Jordan-Sciutto KL（2005）。「胎児のAlz-50クローン1タンパク質の発現はアポトーシス細胞死を誘発します」。生化学。生物物理学。解像度 コミュン。336（2）：490–5。土井：10.1016 /j.bbrc.2005.08.127。PMID 16137655。
Li H、Ilin S、Wang W、他 （2006）。「NURFのBPTFPHDフィンガーによるヒストンH3K4me3の部位特異的読み出しの分子基盤」。自然。442（7098）：91–5。Bibcode：2006Natur.442 … 91L。土井：10.1038 / nature04802。PMC 4690523。PMID 16728978。
人間の17番染色体上の遺伝子に関するこ
“