BRD4
ブロモドメインを含むタンパク質4は、ヒトではBRD4遺伝子によってコードされるタンパク質です。 BRD4 利用可能な構造 PDB Human UniProt検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
2I8N、2LSP、2MJV、2OSS、2OUO、2YEL、2YEM、3MXF、3P5O、3SVF、3SVG、3U5J、3U5K、3U5L、3UVW、3UVX、3UVY、3UW9、3ZYU、4A9L、4BJX、4BW1、4BW2、4BW3、4BW4、4C66、4C67、4CFK、4CFL、4CL9、4CLB、4DON、4E96、4F3I、4GPJ、4HBV、4HBW、4HBX、4HBY、4HXK、4HXL、4HXM、4HXN、4HXO、4HXP、4HXR、4HXS、4IOO、4IOQ、4IOR、4J0R、4J0S、4J3I、4KV1、4KV4、4LR6、4LRG、4LYI、4LYS、4LYW、4LZR、4LZS、4MEN、4MEO、4MEP、4MEQ、4MR3、4MR4、4NQM、4NR8、4NUC、4NUD、4NUE、4O70、4O71、4O72、4O74、4O75、4O76、4O77、4O78、4O7A、4O7B、4O7C、4O7E、4O7F、4OGI、4OGJ、4PCE、4PCI、4PS5、4QB3、4QR3、4QR4、4QR5、4QZS、4UIX、4UIZ、4UYD、4WIV、4XY9、4XYA、4Z1Q、4Z1S、4Z93、5A5S、5A85、5BT4、5D3T、5D3S、5D3H、5D3J、5CTL、4WHW、5D3R、4X2I、5CPE、5CRZ、4YH3、4ZC9、5EI4、5D3P、5CQT、5D3L、5EIS、5CRM、5D0C、5EGU、5CP5、5D25、5CY9、5COI、5D26、4YH4、5CS8、5ACY、5DX4、5D24、5HM0、5HLS、2N3K、5JWM、5DLX、2NCZ、2NNU、5DW2、2ND1、4ZW1、5CFW、2ND0、5DLZ
識別子
エイリアス
BRD4、CAP、HUNK1、HUNKI、MCAP、4を含むブロモドメイン
外部ID
OMIM：608749 HomoloGene：137685 GeneCards：BRD4
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 19番染色体（ヒト）
バンド 19p13.12 始める
15，235，519 bp
終わり
15，332，545 bp
RNA発現パターン
その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
• p53結合• クロマチン結合• GO：0001948タンパク質結合• リジンアセチル化ヒストン結合• RNAポリメラーゼII複合体結合• RNAポリメラーゼIICTDヘプタペプチドリピートキナーゼ活性• 酵素結合• RNAポリメラーゼIIC末端ドメイン結合• P-TEFb複合体バインディング
細胞成分
• 核質• 染色体• 凝縮した核染色体• 核• 細胞質ゾル
生物学的プロセス
• クロマチンリモデリング• 転写の調節、DNAテンプレート• DNA損傷チェックポイントの負の調節• 有糸分裂細胞サイクルのG1 / S遷移に関与する転写の調節• 転写、DNAテンプレート• DNA損傷刺激に対する細胞応答• 炎症反応の調節• I-kappaBキナーゼ/ NF-kappaBシグナル伝達の正の調節• 有糸分裂細胞サイクルのG2 / M遷移の正の調節• RNAポリメラーゼIIのC末端ドメインのリン酸化の調節• GO：0022415ウイルスプロセス• からの転写伸長の正の調節RNAポリメラーゼIIプロモーター• RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節• クロマチン組織• タンパク質リン酸化• 転写の正の調節、DNAテンプレート• ヒストンH3-K36トリメチル化の正の調節
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez 23476
該当なしEnsembl ENSG00000141867
該当なしUniProt O60885
該当なし
RefSeq（mRNA）
NM_014299 NM_058243 NM_001330384 NM_001379291 NM_001379292
該当なし
RefSeq（タンパク質）
NP_001317313 NP_055114 NP_490597 NP_001366220 NP_001366221
該当なし
場所（UCSC）
19番染色体：15.24 – 15.33 Mb
該当なし
PubMed検索
該当なし
ウィキデータ
人間の表示/
BRD4は、BET（ブロモドメインおよびエクストラターミナルドメイン）ファミリーのメンバーであり、BRD2、BRD3、およびBRDTも含まれます。 BRD4は、他のBETファミリーのメンバーと同様に、アセチル化されたリジン残基を認識する2つのブロモドメインを含んでいます。 BRD4には、他のBETファミリーメンバーとの配列相同性がほとんどない拡張C末端ドメインも
コンテンツ
1 構造
2 関数
3 がんにおける役割
4 相互作用
5 参考文献
6 外部リンク
7 参考文献
構造
BD1およびBD2と呼ばれるBRD4の2つのブロモドメインは、2つのループでリンクされた4つのアルファヘリックスで構成されています。 ETドメイン構造は、3つのアルファヘリックスと1つのループで構成されています。 BRD4のC末端ドメインは、転写伸長因子P-TEFbおよびRNAポリメラーゼIIとの相互作用を介して遺伝子転写を促進することに関係しています。
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、有糸分裂中に染色体と結合するマウスタンパク質MCAP、およびセリン/スレオニンキナーゼであるヒトBRD2（RING3）タンパク質と相同です。これらのタンパク質のそれぞれには、クロマチンターゲティングに関与している可能性のある保存された配列モチーフである2つのブロモドメインが含まれています。この遺伝子は、NUT正中癌を定義する転座t（15; 19）（q13; p13.1）の19番染色体標的として関係している。2つの選択的スプライシングされた転写変異体が記載されています。
がんにおける役割
NUT正中癌のほとんどの症例は、NUT遺伝子によるBRD4の転座を伴います。 BRD4は、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病などの血液がんにおけるMycおよびその他の「腫瘍駆動」癌遺伝子の発現に必要とされることがよく
BRD4はの主要な標的であるBET阻害剤、 現在、臨床試験で評価されている医薬品のクラス。
相互作用
注目すべきこと、とBRD4の相互作用P-TEFbそのP-TEFbの相互作用ドメインを介して（PID）、それによってそのキナーゼ活性を刺激するとのカルボキシ末端ドメイン（CTD）のそのリン酸化を刺激RNAはIIのポリメラーゼ。最近のレビュー。
BRD4は、GATA1、 JMJD6、 RFC2、 RFC3、 RFC1、 RFC4 およびRFC5と相互作用することが示されています。 BRD4は、ジアセチル化ツイストタンパク質との結合にも関与しており、この相互作用の破壊は、基底細胞様乳がんの腫瘍形成を抑制することが示されています。
BRD4は、MS417などのさまざまな阻害剤と相互作用することも示されています。MS417によるBRD4の阻害は、HIV関連腎疾患で見られるNF-κB活性をダウンレギュレートすることが示されています。 BRD4はアテローム性動脈硬化症および心血管疾患の治療について評価されているアパベタロン（RVX-208）とも相互作用します。
参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000141867 – Ensembl、2017年5月
^ 「HumanPubMedリファレンス：」。米国国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ y A、Ellenberg J、Farina A、Coleman AE、Maruyama T、Sciortino S、Lippincott-Schwartz J、Ozato K。「ブロモドメインタンパク質であるMCAPは、有糸分裂染色体と結合し、G（2）からMへの移行に影響を与えます」。分子生物学および細胞生物学。20（17）：6537–49。土井：10.1128 /MCB.20.17.6537-6549.2000。PMC 86127。PMID 10938129。
^ “Entrez Gene：4を含むBRD4ブロモドメイン”。
^ Zeng L、Zhou MM。「ブロモドメイン：アセチル-リジン結合ドメイン」。FEBSレター。513（1）：124–8。土井：10.1016 / s0014-5793（01）03309-9。PMID 11911891。S2CID 29706103。
^ Shi J、Vakoc CR。「BETブロモドメイン阻害の治療活性の背後にあるメカニズム」。分子細胞。54（5）：728–736。土井：10.1016 /j.molcel.2014.05.016。PMC 4236231。PMID 24905006。
^ vaiah BN、Singer DS「brd4の2つの面：有糸分裂ブックマークと転写リンチピン」。転写。4（1）：13–17。土井：10.4161 /trns.22542。PMC 3644036。PMID 23131666。
^ Wu SY、Chiang CM。「二重ブロモドメイン含有クロマチンアダプターBrd4と転写調節」。Journal of BiologicalChemistry。282（18）：13141–5。土井：10.1074 /jbc.r700001200。PMID 17329240。
^ Itzen、F; グライフェンベルク、AK; ベスケン、カリフォルニア; Geyer、M（2014）。「Brd4はRNAポリメラーゼIICTDリン酸化のためにP-TEFbを活性化します」。核酸研究。42（12）：7577–90。土井：10.1093 / nar / gku449。PMC 4081074。PMID 24860166。
^ ジョンカー、私; Lis、JT（2015）。「RNAポリメラーゼIIによる転写伸長に慣れる」。ネイチャーレビュー分子細胞生物学。16（3）：167–77。土井：10.1038 / nrm3953。PMC 4782187。PMID 25693130。
^ ヤン、Z; Yik、JH; チェン、R; 彼、N; チャン、MK; オザト、K; 周、Q（2005）。「ブロモドメインタンパク質Brd4による転写伸長の刺激のためのP-TEFbの募集」。分子細胞。19（4）：535–45。土井：10.1016 /j.molcel.2005.06.029。PMID 16109377。
^ フランスのCA。「NUT正中癌の謎解きされた分子病理学」。Journal of ClinicalPathology。63（6）：492–6。土井：10.1136 /jcp.2007.052902。PMID 18552174。S2CID 2200842。
^ Da Costa、D。; Agathanggelou、A。; ペリー、T。; Weston、V。; ピーターマン、E。; Zlatanou、A。; Oldreive、C。; 魏、W。; スチュワート、G。（2013-07-19）。「原発性小児B前駆体急性リンパ芽球性白血病における単一または併用治療アプローチとしてのBET阻害」。血液がんジャーナル。3（7）：e126。土井：10.1038 /bcj.2013.24。PMC 3730202。PMID 23872705。
^ Shi J、Vakoc CR。「BETブロモドメイン阻害の治療活性の背後にあるメカニズム」。分子細胞。54（5）：728–36。土井：10.1016 /j.molcel.2014.05.016。PMC 4236231。PMID 24905006。
^ Itzen F、Greifenberg AK、BöskenCA、Geyer M。「Brd4はRNAポリメラーゼIICTDリン酸化のためにP-TEFbを活性化します」。核酸研究。42（12）：7577–7590。土井：10.1093 / nar / gku449。PMC 4081074。PMID 24860166。
^ クアレスマ、AJ; ブガイA; バーボリックM.（2016）。「7SKsnRNPおよびP-TEFbによるRNAポリメラーゼII伸長の制御の解読」。核酸研究。44（8）：7527–7539。土井：10.1093 / nar / gkw585。PMC 5027500。PMID 27369380。
^ Lamonica JM、Deng W、Kadauke S、Campbell AE、Gamsjaeger R、Wang H、Cheng Y、Billin AN、Hardison RC、Mackay JP、Blobel GA。「ブロモドメインタンパク質Brd3はアセチル化GATA1と結合して、赤血球標的遺伝子でのクロマチン占有を促進します」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。108（22）：E159–68。土井：10.1073 /pnas.1102140108。PMC 3107332。PMID 21536911。
^ Liu W、Ma Q、Wong K、Li W、Ohgi K、Zhang J、Aggarwal AK、Rosenfeld MG。「転写休止放出の調節におけるBrd4およびJMJD6関連の一時停止防止エンハンサー」。セル。155（7）：1581–95。土井：10.1016 /j.cell.2013.10.056。PMC 3886918。PMID 24360279。
^ Maruyama T、Farina A、Dey A、Cheong J、Bermudez VP、Tamura T、Sciortino S、Shuman J、Hurwitz J、Ozato K。「哺乳類のブロモドメインタンパク質であるbrd4は、複製因子Cと相互作用し、S期への進行を阻害します」。分子生物学および細胞生物学。22（18）：6509–20。土井：10.1128 /MCB.22.18.6509-6520.2002。PMC 135621。PMID 12192049。
^ Shi J、Wang Y、Zeng L、Wu Y、Deng J、Zhang Q、Lin Y、Li J、Kang T、Tao M、Rusinova E、Zhang G、Wang C、Zhu H、Yao J、Zeng YX、Evers BM、周MM、周BP。「BRD4とジアセチル化ツイストとの相互作用を破壊すると、基底細胞様乳がんの腫瘍形成が抑制されます」。がん細胞。25（2）：210–225。土井：10.1016 /j.ccr.2014.01.028。PMC 4004960。PMID 24525235。
^ Zhang G、Liu R、Zhong Y、Plotnikov AN、Zhang W、Zeng L、Rusinova E、Gerona-Nevarro G、Moshkina N、Joshua J、Chuang PY、Ohlmeyer M、He JC、Zhou MM。「BRD4阻害によるHIV関連腎疾患におけるNF-κB転写活性のダウンレギュレーション」。Journal of BiologicalChemistry。287（34）：28840–28851。土井：10.1074 /jbc.M112.359505。PMC 3436579。PMID 22645123。
^ McLure KG、Gesner EM、Tsujikawa L、Kharenko OA、Attwell S、Campeau E、Wasiak S、Stein A、White A、Fontano E、Suto RK、Wong NC、Wagner GS、Hansen HC、Young PR（2013年12月31日） 。「ヒトにおけるApoA-Iの誘導因子であるRVX-208は、BETブロモドメインアンタゴニストです」。PLOSONE。8（12）：e83190。Bibcode：2013PLoSO … 883190M。土井：10.1371 /journal.pone.0083190。PMC 3877016。PMID 24391744。
外部リンク
UCSC GenomeBrowserのヒトBRD4ゲノム位置とBRD4遺伝子詳細ページ。
参考文献
フランスのCA、Miyoshi I、Aster JC、Kubonishi I、Kroll TG、Dal Cin P、Vargas SO、Perez-Atayde AR、Fletcher JA。「転座t（15; 19）を伴う進行性癌腫におけるBRD4ブロモドメイン遺伝子再構成」。病理学のアメリカジャーナル。159（6）：1987–92。土井：10.1016 / S0002-9440（10）63049-0。PMC 1850578。PMID 11733348。
Maruyama T、Farina A、Dey A、Cheong J、Bermudez VP、Tamura T、Sciortino S、Shuman J、Hurwitz J、Ozato K。「哺乳類のブロモドメインタンパク質であるbrd4は、複製因子Cと相互作用し、S期への進行を阻害します」。分子生物学および細胞生物学。22（18）：6509–20。土井：10.1128 /MCB.22.18.6509-6520.2002。PMC 135621。PMID 12192049。
フランスのCA、Miyoshi I、Kubonishi I、Grier HE、Perez-Atayde AR、Fletcher JA。「BRD4-NUT融合癌遺伝子：侵攻性癌における新しいメカニズム」。がん研究。63（2）：304–7。PMID 12543779。
You J、Croyle JL、Nishimura A、Ozato K、Howley PM。「ウシパピローマウイルスE2タンパク質とBrd4の相互作用は、ウイルスDNAを有糸分裂染色体をホストするようにつなぎとめます」。セル。117（3）：349–60。土井：10.1016 / S0092-8674（04）00402-7。PMID 15109495。S2CID 14781328。
Colland F、Jacq X、Trouplin V、Mougin C、Groizeleau C、Hamburger A、Meil A、Wojcik J、Legrain P、Gauthier JM。「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。ゲノム研究。14（7）：1324–32。土井：10.1101 /gr.2334104。PMC 442148。PMID 15231748。
Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、VillénJ、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP。「HeLa細胞の核リンタンパク質の大規模な特性評価」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。101（33）：12130–5。Bibcode：2004PNAS..10112130B。土井：10.1073 /pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
ファリーナA、服部M、秦J、中谷Y、湊N、尾里K。「ブロモドメインタンパク質Brd4はGTPase活性化SPA-1に結合し、その活性と細胞内局在を調節します」。分子生物学および細胞生物学。24（20）：9059–69。土井：10.1128 /MCB.24.20.9059-9069.2004。PMC 517877。PMID 15456879。
バクスターMK、マクフィリップスMG、オザトK、マクブライドAA。「パピローマウイルスE2タンパク質の有糸分裂染色体結合活性は、細胞染色体タンパク質であるBrd4との相互作用と相関しています」。Journal ofVirology。79（8）：4806–18。土井：10.1128 /JVI.79.8.4806-4818.2005。PMC 1069523。PMID 15795266。
Haruki N、Kawaguchi KS、Eichenberger S、Massion PP、Gonzalez A、Gazdar AF、Minna JD、Carbone DP、Dang TP。「まれなt（15; 19）（q13.2; p13.1）からのクローン融合産物はinvitroでS期を阻害します」。Journal of MedicalGenetics。42（7）：558–64。土井：10.1136 /jmg.2004.029686。PMC 1736105。PMID 15994877。
Schweiger MR、You J、Howley PM。「ブロモドメインタンパク質4はパピローマウイルスE2の転写活性化機能を仲介します」。Journal ofVirology。80（9）：4276–85。土井：10.1128 /JVI.80.9.4276-4285.2006。PMC 1472042。PMID 16611886。
Wu SY、Lee AY、Hou SY、Kemper JK、Erdjument-Bromage H、Tempst P、Chiang CM。「Brd4はクロマチンターゲティングをHPV転写サイレンシングにリンクします」。遺伝子と開発。20（17）：2383–96。土井：10.1101 /gad.1448206。PMC 1560413。PMID 16921027。
You J、Srinivasan V、Denis GV、Harrington WJ、Ballestas ME、Kaye KM、Howley PM。「カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス潜伏関連核抗原は、宿主の有糸分裂染色体上のブロモドメインタンパク質Brd4と相互作用します」。Journal ofVirology。80（18）：8909–19。土井：10.1128 /JVI.00502-06。PMC 1563901。PMID 16940503。
セネシャルH、ポイエーGG、クーロンベB、ライミンズLA、アルカンバルトJ。「パピローマウイルスE2の転写活性を特異的に損なうアミノ酸置換は、Brd4の長いアイソフォームへの結合に影響を及ぼします」。ウイルス学。358（1）：10–7。土井：10.1016 /j.virol.2006.08.035。PMID 17023018。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、インビボ、および部位特異的リン酸化ダイナミクス」。セル。127（3）：635–48。土井：10.1016 /j.cell.2006.09.026。PMID 17081983。S2CID 7827573。
Abbate EA、Voitenleitner C、Botchan MR。「パピローマウイルスDNAテザリング複合体E2：Brd4とHPV染色体結合を除去するペプチドの構造」。分子細胞。24（6）：877–89。土井：10.1016 /j.molcel.2006.11.002。PMID 17189190。
Schweiger MR、Ottinger M、You J、Howley PM。「パピローマウイルスe2タンパク質のBrd4非依存性転写抑制機能」。Journal ofVirology。81（18）：9612–22。土井：10.1128 /JVI.00447-07。PMC 2045424。PMID 17626100。
Bisgrove DA、Mahmoudi T、Henklein P、Verdin E。「BRD4の保存されたP-TEFb相互作用ドメインはHIV転写を阻害します」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。104（34）：13690–5。Bibcode：2007PNAS..10413690B。土井：10.1073 /pnas.0705053104。PMC 1959443。PMID 17690245。