Bglg-cis-reg RNA


Bglg-cis-reg_RNA

bglGは、調節RNAは、CISのRNA深い配列決定により同定したClostridioidesディフィシル630 直ちにの上流に位置する遺伝子bglG2。BglG2は、ベータグルコシダーゼホスホトランスフェラーゼシステムの遺伝子の調節に関与する抗ターミネータータンパク質です。 C. difficileエレメントの相同体は、クロストリジウム菌や他のフィルミクテス菌全体で発見されました。。この要素は、ベータ-グルコシダーゼホスホトランスフェラーゼシステムの別の抗ターミネーターであるbglG2またはLicTの5 ‘に一貫して位置しており、これらのオペロンでのシス規則的な機能と一致しています。クロストリジウム菌の配列のみがシードアラインメントに含まれていました。シーケンスは、参考文献でS0591と名付けられています。
bglG-cis-reg
bglG / LicTオペロンのシス調節エレメントの
コンセンサス
二次構造と配列保存 識別子
シンボル
bglG-cis-regRfam F03530
その他のデータ
RNAタイプ Cis-reg それで SO:0005836 PDB構造
PDBe

参考文献
^ Soutourina OA、Monot M、Boudry P、Saujet L、Pichon C、Sismeiro O; etal。(2013)。「ヒト病原体クロストリジウム・ディフィシルにおける調節RNAのゲノムワイドな同定」。PLoSGenet。9(5):e1003493。土井:10.1371 /journal.pgen.1003493。PMC  3649979。PMID  23675309。
^ 田中Y、寺本H、犬井M、湯川H(2011)。「抗ターミネータータンパク質の翻訳効率は、Corynebacterium glutamicumRの2つのβ-グルコシドホスホトランスフェラーゼシステム遺伝子クラスターのグルコース抑制の違いの決定要因です。」Jバクテリオール。193(2):349–57。土井:10.1128 /JB.01123-10。PMC 3019825。PMID 21075922。
  

外部リンク
bglGシス調節RNAのためのページでRFAM