Bordetella_trematum
ボルデテラtrematumでの種であるグラム陰性10社の比較によって1996年に同定された細菌株のB.のtrematum他のウェルに対しては、特徴ボルデテラ及びアルカリゲネス種。トレマという用語は、貫通または貫通したもの、またはギャップを指します。「トレマタム」とは、物を開くことを指し、傷や体の他の露出部分に細菌が存在することを指します。 LMG 13506 T株は、この種の参照株です。 Bordetellatrematum 科学的分類
ドメイン： バクテリア
門： プロテオバクテリア
クラス： ベータプロテオバクテリア
注文： バークホルデリア目
家族： Alcaligenaceae
属： ボルデテラ
種族：
B.トレマタム
二名法 Bordetellatrematum Vandamme etal。1996株 LMG 13506T MG 14446 MG 14447 MG 14448 MG 14523MG 14991 MG 14992 MG 14993 MG 15543 MG 16652
コンテンツ
1 隔離2 特徴 3 代謝
4 分類法
5 ゲノミクス
6 病原性
7 参考文献
8 外部リンク
隔離
ボルデテラ種は通常、ヒトの気道に感染しますが、B。trematumはヒトまたは動物の気道から分離されたことはありません。人間の耳の感染症や手足の傷から分離されています。以下は、既知のB. trematum菌株、代替菌株の指定、およびそれらが最初に分離された日付と出典のリストです。
歪み
代替指定 日にち ソース
LMG 13506 T 1779 T わからない
慢性中耳炎、人間、ドイツLMG 14446 CCUG 13902 1980年
足の傷LMG 14447 CCUG 13905 1980年
足首の傷LMG 14448 CCUG 31299A
わからない
わからないLMG 14523 CCUG 24727 1983年
足の傷、アメリカ合衆国LMG 14991 CCUG 13903A 1980年
足の傷LMG 14992 CCUG 13903B 1980年
足の傷LMG 14993 CCUG 13904 1980年
腕の傷LMG 115543 CCUG 14939 1983年
アメリカLMG 16652 DMMZ 1733
わからない
31歳の男性、慢性中耳炎、スイス
特徴
ボルデテラtrematumは、グラム陰性であるカプセル、非胞子形成、ロッド広い0.5μm程度と1.0~1.8μmの長いが、長い2.4ミクロンほどのロッドが観察されています。それが成長好気的に25から42の範囲の温度で°C、35~37の範囲°Cの成長のための最適温度を有します。微好気性増殖は、最適な温度で観察される場合がそれは周毛性べん毛を介して運動性です。 B.trematumはカタラーゼ陽性です。ボルデテラの他のすべての種はオキシダーゼ陽性であるため、オキシダーゼ陰性であるという点で独特です。
Bordetella trematumは、馬の血液寒天培地、マッコンキー寒天培地、およびボルデー・ジャングー寒天培地で培養できます。ボルデテラ分離の標準寒天であるボルデー・ジャングー寒天培地で培養すると、コロニーは凸状、真珠様、滑らか、ほぼ透明、そして輝くようになり、溶血ゾーンに囲まれます。血液寒天培地で増殖させると、コロニーは灰色がかったクリーム色から白色、円形、凸状になります。
代謝
B. trematumは比較的新しく発見されたため、その代謝についてはほとんど知られすべてのBordetella種と同様に、B。trematumは化学有機栄養菌であり、呼吸代謝による成長のためにニコチンアミド、システインなどの有機硫黄、およびアミノ酸などの有機窒素を必要とします。その代謝は糖分解性ではありません。つまり、エネルギーにいかなる形の糖も使用しません。既知の10株のうち6株は、硝酸塩を亜硝酸塩に還元することができます。それは、インドール陰性およびウレアーゼ陰性。
分類法
DNA-のrRNAハイブリダイゼーションは、代わりに使用されたB. trematum 13506 LMG TファミリーAlcaligenaceaeに。増幅されたリボソームDNA制限分析により、B。trematum参照株とBordatella参照種であるB. pertussisの間に94％の類似性があることが明らかになりました。その後、属レベルでの配置を決定するための追加的な証拠から来たDNA-DNAハイブリダイゼーションのB.のtrematum他の基準株に対してLMG 13506及びLMG 14446菌株ボルデテラ及びアルカリゲネス種。結果は、B。trematum種がBordetella属のメンバーに最も類似していることを示しました。 全細胞タンパク質のSDS-PAGE分析により、ボルデテラが単系統ではないことを示す樹状図の作成が可能になりました。 DNA-rRNAハイブリダイゼーションと16SrRNA配列分析は、ボルデテラとアルカリゲネスの間に密接な関係があることを示しています。 2つの属を区別することはしばしば困難です。実際、属全体のいくつかの種は表現型が同一です。
BordetellatrematumとB.holmesiiは、気道にコロニーを形成しない唯一の種です。百日咳菌およびパラ百日咳菌が原因のその呼吸器病原体である百日咳。B.bronchisepticaとB.aviumは他の動物の呼吸器病原体です。B. hinziiは病原性がなく、鳥の気道にコロニーを形成します。B.holmesiiは人間の血液から分離されました。アルカリゲネス属のメンバーは人間にコロニーを形成しますが、気道、土壌、水にはコロニーを形成しません。
ゲノミクス
B.のtrematumの ゲノムはして配列決定され、2013年に、現在は行われて注釈を。ゲノムは、4，145のコード配列を持っていると推定されており、配列の大部分はアミノ酸、アミノ酸誘導体、および炭水化物経路をコードしています。約184個の遺伝子が膜輸送に関与すると予測されています。 GC含量は64〜65％です。全ゲノムサイズは現在不明です。
病原性
ボルデテラtrematumがある非病原性、 日和見生物その唯一の源分離の開いた、ヒトの創傷です。それは医学的介入なしで体から取り除くことができます。
ボルデテラ エンドトキシンは、属、種、および菌株に固有のものです。B. trematumは、単一のOユニットを含むセミラフリポ多糖を持つ唯一のBordetella種です。B. trematumの脂質Aユニットは、日和見細菌B. hinziiの脂質Aユニットと同じですが、他のBordetella種とは異なります。
参考文献
^ 「タクソノミーブラウザ：Bordatellatrematum」。NCBI 。
^ u v w x Vandamme、P; M Heyndrickx; M Vancanneyt; B Hoste; P De Vos; E Falsen; Kカースターズ; KH Hinz（1996年10月）。「Bordetellatrematumsp。nov。、ヒトの創傷および耳の感染症から分離された、およびAlcaligenes denitrificans Ruger and Tan1983の再評価」。系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル。46（4）：849–858。土井：10.1099 / 00207713-46-4-849。PMID 8863408。 ^ Daxboeck、F; Eゴリツィア; P Apfalter; M Nehr; Rクラウス。「糖尿病性下腿潰瘍からのBordetellatrematumの分離」。糖尿病治療薬。21（11）：1247–1248。土井：10.1111 /j.1464-5491.2004.01310.x。PMID 15498093。 ^ Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology、Second Edition、Volume 2、PartC。2005. doi：10.1007 / 0-387-29298-5。ISBN 978-0-387-24145-6。
^ Shah、NR; Mモスカ; Novikv; MBペリー; Mハースト; Mキャロフ; RCフェルナンデス（2013年9月〜10月）。「BordatellahinziiおよびBordetellatrematumのドラフトゲノム配列」。ゲノムアナウンス。1（5）：e00838–e00913。土井：10.1128 /genomeA.00838-13。PMC 3813182。PMID 24158552。 ^ Caroff、Martine; Laurent Aussel; Hassan Zarrouk; アデーレマーティン; ジェームズ・リチャーズ; Helene Therisod; マルコムペリー; ドリスカリビアン。「ボルデテラエンドトキシンの構造の変動性と独創性」。自然免疫。7（1）：63–68。土井：10.1177 / 09680519010070011101。PMID 11521085。
外部リンク
型株ボルデテラtrematumバクでダイブ細菌の多様性メタデータベース-