Bsoft
Bsoftは、構造生物学における画像および分子処理用のソフトウェアを開発するためのプログラムとプラットフォームのコレクションです。構造生物学の問題は高度にモジュール化された設計でアプローチされ、ファイルI / Oなどの問題の負担なしに新しいアルゴリズムの迅速な開発を可能にします。簡単にアクセスできるインターフェイス、他のパッケージで使用できるリソース、および使用されているリソースを提供します。単粒子解析やトモグラフィーなどのいくつかのワークフローは、パラメーター交換、およびコンピューターの異種クラスター間で分散処理を実行する機能でサポートされています。
コンテンツ
1 技術的な詳細
2 出版物
3 も参照してください
4 外部リンク
技術的な詳細
バージョン：1.8.8
OSサポート：Unix（Mac OS X、IRIX、Linux、AIX、Solaris、Tru64）、OpenVMS
フォーマットのサポート：
画像：BioRad、Brix、CCP4、Digital Instruments、Digital Micrograph、DSN6、EM、Goodford、GRD、Imagic、JPEG、MFF、Image Magick、MRC、PIC、PIF、PNG、Spider、Suprim、TIFF、RAW
顕微鏡写真パラメーター：STAR（Bsoft辞書）、XML（Bsoftスキーマ）、EMX（EM交換フォーマットスキーマ）
シーケンス：EMBL、Fasta、Genbank、Phylip、PIR、STAR、Text
分子モデリング：Gromacs、PDB、STAR / mmCIF、Text、WAH
一般的なモデリング：キメラマーカーモデル、STAR（Bsoft辞書）、XML（Bsoftスキーマ）
出版物
Heymann JB（2001）Bsoft：電子顕微鏡における画像と分子の処理。Journal of Structural Biology 133（2/3）、156-169。
Heymann JB and Belnap DM（2007）Bsoft：電子顕微鏡用の画像処理と分子モデリング。Journal of Structural Biology 157（1）、3-18。
Heymann JB、Cardone G、Winkler DC、Steven AC（2008）Bsoftのクライオ電子線トモグラフィーの計算リソース。Journal of Structural Biology 161（3）、232 –242。
Heymann JB（2018）電子顕微鏡写真からの生体分子構造の高解像度再構成および検証にBsoftを使用するためのガイドライン。Protein Science 27（1）、159-171。
Heymann JB（2018）マップチャレンジにBsoftを使用した単粒子再構成と検証。Journal of Structural Biology 204（1）、90-95。
も参照してください
EMデータバンク
外部リンク
Bsoftホームページ
分子顕微鏡用のソフトウェアツール
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