C-DNA
cDNAとしても知られる相補的DNA
と混同しないでください C-DNAとしても知られ、C状DNAは、多くの可能なの一つであるダブルヘリカル 配座のDNA。DNAは、比較的低いような特定の条件では、この形を取るように誘導することができ、湿度及び一定の存在イオンLi等、+又はMg 2+が、C型DNAは非常に安定ではなく、生きている生物に天然に存在しません。1961年に、それはマーヴィンによって発見されました。彼がLi塩について繰り返しようとしたとき、Na塩のより高い含水量パターン。マーヴィンが見つけたのは半結晶性C-DNAです。「半結晶性」は、結晶性反射が低解像度で見られるが、高解像度で連続的に変形する回折パターンを表します。
コンテンツ
1 構造
2 最も一般的なDNAフォームの比較ジオメトリ
3 も参照してください
4 参考文献
構造
C-DNAはわずかに可変の寸法の非一体型らせんであり、平均値は単位上昇で3.32Å、単位ねじれで38.60°であり、1回転あたり10単位ではなく約91/3になります。何年にもわたって提案されたC-DNAのいくつかの異なるモデルが2000年、van DamとLevittは、C-DNAとB-DNAの両方が2つの異なるヌクレオチドコンフォメーション、BIとB-IIで構成されていることを発見しました。C-DNAのB-IIコンフォメーションの比率は40％以上ですが、B-DNAの比率は約10％にすぎません。繊維状DNAのBからCへの移行は、BIおよびB-IIのコンフォメーション変化の観点から解釈できます。その論文の図は、それらによって公開されたこれら2つのコンフォメーションの理想的なモーダルを示しています。
実験では、塩基性条件下での第一級アミドなどの対イオンを使用して、DNAのB型とC型の関係を示しています。DNAの全体的な形状および向きは、その上に大きく依存している一次配列ならびに水素結合安定化二重らせんコンフォメーションを維持し、その塩基対の間です。C-DNAは、水の非存在下でそのコンフォメーションを保持することが示され、脱水時に形成することができました。塩基性条件下および低湿度下の一部のアミドは、C型コンフォメーションを保持することが示されましたが、湿度が高くなるとB型DNAにスムーズに移行しました。これは、C型とB型DNAの間に強い相関関係があることを示唆している可能性が 、これも低湿度でリチウム塩を使用して見られました。
最も一般的なDNAフォームの比較ジオメトリ
ジオメトリ属性
Aフォーム Bフォーム C型 Z型
らせん感覚 右利き 右利き 右利き 左利き
繰り返し単位 1 bp 1bp 1bp 2bp
回転/ bp 32.7° 34.3° 38.6° 60°/ 2
平均血圧/ターン 11 10 9.33 12
軸に沿った上昇/ bp 2.6Å 3.4Å 3.3Å 3.6-3.8Å
も参照してくださいB-DNA A-DNA Z-DNA
DNAの機械的性質
DNA
参考文献
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