C11orf54
11番染色体のオープンリーディングフレーム54（C11orf54）は、ヒトではC11orf54遺伝子によってコードされるタンパク質です。「ホモサピエンス」遺伝子であるC11orf54は、PTD012およびPTOD12としても知られています。C11orf54は、p-ニトロフェニルアセテートに対して加水分解酵素活性を示し、エステル結合に作用しますが、全体的な機能はまだ科学界によって完全には理解されタンパク質は高度に保存されており、バクテリアに見られる最も遠いホモログが C11orf54 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 1XCR 識別子
エイリアス
C11orf54、PTD012、PTOD012、11番染色体オープンリーディングフレーム54
外部ID
OMIM：615810 MGI：1918234 HomoloGene：8531 GeneCards：C11orf54
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 11番染色体（ヒト）
バンド 11q21 始める
93，741，591 bp
終わり
93，764，749 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 9番染色体（マウス）
バンド
9 | 9 A2
始める
15，283，337 bp
終わり
15，306，448 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
肝臓
腎皮質
肝臓
腎髄質
大腿四頭筋
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
亜鉛イオン結合
GO：0001948タンパク質結合
加水分解酵素活性
エステル結合に作用するヒドロラーゼ活性
金属イオン結合
細胞成分
細胞外エクソソーム 核 核質
核体
生物学的プロセス
代謝
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez28970 70984 Ensembl ENSG00000182919 ENSMUSG00000031938 UniProt Q9H0W9 Q91V76
RefSeq（mRNA）
NM_001286067 NM_001286068 NM_001286069 NM_001286070 NM_001286071
NM_014039 NM_001351985 NM_001351986 NM_001351988 NM_001351989 NM_001351990 NM_001351991 NM_001351992 NM_001351993 NM_001351987 NM_001369406
NM_001199484 NM_001199485 NM_133732 NM_001359258
RefSeq（タンパク質）
NP_001272996 NP_001272997 NP_001272998 NP_001272999 NP_001273000
NP_054758 NP_001338914 NP_001338915 NP_001338916 NP_001338917 NP_001338918 NP_001338919 NP_001338920 NP_001338921 NP_001338922 NP_001356335
NP_001186413 NP_001186414 NP_598493 NP_001346187
場所（UCSC）
Chr 11：93.74 – 93.76 Mb
Chr 9：15.28 – 15.31 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/編集
コンテンツ
1 遺伝子 2 mRNA 3 タンパク質
3.1 一次配列 3.2 二次構造 3.3 細胞内局在 3.43.4 表現と翻訳後修飾
4 相同性
4.1 パラログ 4.2 オーソログ
5 関数
5.1 相互作用するタンパク質
6 参考文献
7 参考文献
8 外部リンク
遺伝子
C11orf54は11番染色体の11q21に遺伝子の一般的なエイリアスはPTD012とPT0D12です。この遺伝子は13個のエクソンで構成され、23730bpにまたがっています。C11orf54には、TAF1DとMED17が隣接しています。
mRNA
タンパク質エステル加水分解酵素c11orf54はモノマーとして存在し、315個のアミノ酸で構成されています。C11orf54には6つのアイソフォームが表1を参照して – 変異体
アイソフォーム
長さ（bp）
受入番号 1 エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームa2726 NM_001286067.1 2
エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームa2589 NM_001286068.1 3
エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームa2594 NM_001286069.1 4
エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームb2444 NM_014039.3 5
エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームc2442 NM_001286070.1 6
エステル加水分解酵素C11orf54アイソフォームd2417 NM_001286071.1
アミノ酸配列には、未知の機能1907のドメインが含まれています。この転写産物には、加水分解酵素活性に関与する亜鉛イオンを調整するHxHxxxxxxxxxHモチーフが含まれています。アンLRの巣モチーフはlys262およびArg263で発見されました。LRネストモチーフは、NH基とアニオンの間に水素結合を形成します。アセテートアニオンはLRネストと協調しています。
タンパク質編集
一次配列
表2は、ヒトおよび他のオルソログ全体のタンパク質配列のさまざまな特性を示しています。
生命体
分子量（キロダルトン）
等電点
高バイアスアミノ酸
繰り返す
人間35.1 5.9 F AEFS
ねずみ35.0 5.9 H
なし
13ジュウサンセンジリス35.1 6.0 F、H PAEF
ジャイアントパンダ35.2 6.5 F
PAEF
二次構造
C11orf54のタンパク質は、溶液中にモノマーとして存在します。このタンパク質は、20個のベータストランドと4個のアルファヘリックスの球状形状をとり、ベータスクリュー領域を形成する9個の逆平行ベータストランドを含みます。C11orf54のβスクリュー領域は、プロテインキナーゼAの調節サブユニットのサイクリックアデノシン3 ‘、5’-一リン酸（cAMP）結合ドメインと構造的に類似しています。亜鉛イオンは、配列にあるHxHxxxxxxxxxHモチーフに結合しています。
細胞内局在
C11orf54は、細胞質に60.9％、核に21.7％、ミトコンドリアに13.0％、ゴルジ装置に4.3％局在すると予測されています。
表現と翻訳後修飾
画像1：C11orf54タンパク質の転写後修飾
画像1を参照して このタンパク質は腎臓で高度に発現しており、副腎、結腸、肝臓、精巣、甲状腺で中程度に発現しています。
相同性
パラログ
C11orf54のパラログはありません。
オーソログ
タンパク質EsterHydrolase C11orf54には多くのオルソログがあります（表を参照）。哺乳類、爬虫類、鳥、魚で高度に保存されています（60-100％の同一性）。このタンパク質は、無脊椎動物、ふしぎの国アン、刺胞動物、軟体動物、真菌、細菌で適度に保存されています（30〜59.99％の同一性）。古細菌では保存され最も遠いオルソログはバクテリアです。図2は、C11orf54のいくつかのオルソログの根のない系統樹を示しています。
種族 一般名 クラス
受入番号
パーセントアイデンティティ
発散（MYA中央値） Microtus ochrogaster プレーリーハタネズミ
哺乳類XP_005346877.1 87.0 88
アオウミガメ
アオウミガメ
爬虫類XP_007069537.1 72.8 320
ネッタイツメガエル
ビルマニシキヘビ
爬虫類XP_007434894.1 70.9 320
ビルマニシキヘビ
セキショクヤケイ
アベニューNP_001264206.1 73.4 320
ヤケイ
カッコウ
アベニューXP_009564677.1 72.5 320
カッコウ
サザンプラティフィッシュ
条鰭綱XP_005800827.1 65.2 432 Xiphophorus maculatus
ゼブラフィッシュ
条鰭綱NP_997781.1 62.4 432
ダニオレリオ
腸鰓類
腸鰓類XP_002738479.1 55.6 627 Saccoglossus kowalevskii
大西洋カブトガニ
節口綱XP_013785734.1 56.6 758
カブトガニ
ネッタイツメガエル
ふしぎの国アンXP_012812415.1 55.1 353
マガキ
パシフィックオイスター
二枚貝XP_011412414.1 50.0 758
コクヌストモドキ
コクヌストモドキ
昆虫XP_968861.1 49.0 758
ショウジョウバエbipectinata
ショウジョウバエ
昆虫XP_017103988.1 46.0 758
ハキリバチrotundata
アルファルファハキリバチ
昆虫XP_003702672.1 44.8 758 Zymoseptoria brevis
菌類
クロイボタケ類KJX93246.1 36.5 1150 Cladophialophora carrionii
菌類
クロイボタケ類OCT48531.1 35.8 1150
アルテルナリアアルテルナタ
菌類
クロイボタケ類XP_018384285.1 36.2 1150
Candidatus Pelagibacter ubique
バクテリア
バクテリアWP_075504325.1 34.5 4090
Pelagibacteraceae細菌
バクテリア
バクテリアOCW82973.1 34.1
4090
関数
3つのヒスチジンおよび酢酸アニオンを介した亜鉛イオンとのC11orf54の配位は、エステル加水分解酵素としての酵素反応であるタンパク質の機能を示している可能性がタンパク質と反応させたときに高い代謝回転数を有するPニトロフェニルアセテート（0.042秒-1）1秒-1代謝回転速度に比べてと反応する別の酵素（ウシ炭酸脱水酵素II）において見出さPニトロフェニルアセテート。
相互作用するタンパク質
タンパク質名 ユビキチンC UBC コラーゲン、タイプIV、アルファ3 COL4A3 甲状腺ホルモン受容体インターアクター13 TRIP13 DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）ボックスポリペプチド60様 DDX60L グルタミン-フルクトース-6-リン酸トランスアミナーゼ2 GFPT2 スーパーキラー殺ウイルス活性2-like（S。cerevisiae） SKIV2L OTUドメイン、ユビキチンアルデヒド結合1 OTUB1
参考文献
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外部リンク
UCSC GenomeBrowserのヒトC11orf54ゲノム位置とC11orf54遺伝子詳細ページ。
UniProtのPDBで利用可能なすべての構造情報の概要：PDBe-KBのQ9H0W9（エステル加水分解酵素C11orf54）。”