C12orf66
C12orf66は、ヒトではC12orf66遺伝子によってコードされるタンパク質です。 C12orf66タンパク質は、KICSTORタンパク質複合体の4つのタンパク質の1つであり、ラパマイシン複合体1（mTORC1）シグナル伝達の機械的標的を負に調節します。
コンテンツ
1 遺伝子
1.1 表現
2 タンパク質
2.1 関数 2.2 臨床的な意義 2.3 タンパク質間相互作用 2.4 同族体
3 参考文献
遺伝子
ヒト
C12orf66転写変異体
C12orf66は、遺伝子座12q14.2のマイナス鎖に位置しています。 C12orf66バリアント1は、染色体12の塩基対64，186，312-64，222，296にまたがる36Mbpの長さです。合計3つのC12orf66転写バリアントがC12orf66バリアント1は、4つのエクソンを持つ最長のものです。C12orf66バリアント2は、バリアント1と比較してエクソン1が短縮されており、エクソン4が欠落しています。C12orf66バリアント3は、エクソン4が欠落しています。
GDS3834 NCBIGeoセットのさまざまな組織サンプルにわたるC12orf66の発現プロファイル
。赤いバーは個々の式の値を表しており、サンプル間の比較を行う場合は任意と見なす必要が青いボックスは、単一サンプル内の発現レベルのランクを表し、サンプル間の遺伝子の発現レベルを比較するために使用する必要が
表現
ヒトでは、C12orf66は、内分泌腺やリンパ組織や細胞などの多くの組織で平均よりも高い発現を示します。さらに、C12orf66の発現は、白血病、乳がん、子宮頸がん、および胃腸関連のがんを含む多くのがんで増加しています。 C12orf66の発現は、開発の初期段階で高くなっています。さまざまなヒト胚性幹細胞株、卵母細胞、および赤芽球を使用した多くの実験では、C12orf66の発現が発生の初期にこれらの細胞で増加し、これらの細胞がより分化するにつれて発現が減少することがわかりました。 さらに、発現C12orf66胎児の器官中でより高いC12orf66の同じ成人器官における発現。
タンパク質
予測されるヒトC12orf66タンパク質構造
ヒトC12orf66タンパク質は長さが446アミノ酸で、分子量は50kdalです。 C12orf66には、アミノ酸10〜444の未知機能2003（DUF2003）のドメインが含まれています。 DUF2003は、一連のアルファヘリックスとベータシートが特徴です。
予測された二次構造と翻訳後修飾部位を持つヒトC12orf66遺伝子によってコードされるタンパク質の視覚的表現
C12orf66タンパク質
財産 予測
等電点 9.2
セルラーロケーション 細胞質
リン酸化部位 T236、T282、S417
N-ミリストイル化サイト G75、G442
関数
C12orf66は、KICSTORと呼ばれるより大きなタンパク質複合体の一部です。KICSTORは、遺伝子KPTN、ITFG2、C12orf66、およびSZT2によってコードされる4つのタンパク質の複合体です。 KICSTOR複合体は、mTORC1シグナル伝達を調節する役割を果たします。mTORC1は、細胞に十分な量のアミノ酸とエネルギーがある場合にタンパク質の翻訳を活性化します。これにより、理想的な細胞環境で細胞の成長と増殖が確実に起こります。 KICSTORは、mTORC1の負の調節因子であるタンパク質複合体GATOR1を、mTORC1シグナル伝達が発生するリソソーム上の正しい位置に動員します。 GATOR1のリソソームへの局在化に加えて、KICSTORはアミノ酸またはグルコース欠乏によるmTORC1シグナル伝達の調節にも必要です。通常、アミノ酸またはグルコースの欠乏は、mTORC1シグナル伝達を阻害します。ただし、4つのタンパク質KICSTOR複合体のいずれか1つのタンパク質が失われると、アミノ酸またはグルコースの欠乏によるmTORC1の阻害が欠如し、mTORC1シグナル伝達が増加しました。したがって、KICSTORはmTORC1シグナル伝達の負の調節因子であり、GATOR1をリソソーム表面に局在化させるとともに、アミノ酸またはグルコースの欠乏期間中にmTORC1を阻害することによって機能します。 KICSTOR複合体がmTORC1を直接阻害し、アミノ酸またはグルコースの欠乏を感知する方法はまだ解明され
臨床的な意義
遺伝子コードするヒトタンパク質が含まれているゲノム遺伝子座12q14の損失C12orf66は、発達の遅れや、大頭など神経発達障害の数にリンクされています。 さらに、ある研究では、C12orf66の発現レベルが結腸直腸癌でダウンレギュレーションされていることがわかりました。この研究では、C12orf66のダウンレギュレーションの量と、他の多くの遺伝子の発現が、結腸直腸癌患者の臨床転帰の正確な指標として使用されました。したがって、C12orf66遺伝子発現のレベルはこれらの患者の生存可能性を反映していた。
タンパク質間相互作用
C12orf66は、遺伝子KPTN、ITFG2、SZT2、およびGATOR1によってコードされるKICSTOR複合体の3つのタンパク質と相互作用します。さらに、C12orf66はKRAS、DEPDC5、およびC7orf60と相互作用すると予測されています。これらの相互作用は、ハイスループットアフィニティーキャプチャークロマトグラフィーによって検出されました。
同族体
C12orf66は高度に保存されたタンパク質であり、多数のオルソログがあり、既知のパラログはありません。C12orf66オルソログのリストには、哺乳類、鳥、爬虫類、両生類、魚、海の虫、軟体動物、昆虫、菌類が含まれます。
C12orf66タンパク質オルソログ
属と種 一般名 最後の共通祖先からの時間（百万年前）
アクセッション番号（タンパク質）
シーケンスの長さ シーケンスアイデンティティ（ALIGN） 配列類似性（EMBOSSニードル）
ホモサピエンス 人間 0 mya NP_001287869.1 468 aa 100％ 100％
ハツカネズミ ハツカネズミ 88 mya NP_766610.2 445 aa 94.5％ 91.7％
ヤケイ 鶏 320 mya XP_416063.1 446 aa 93.3％ 92.3％
ガーターヘビ ガーダースネーク 320 mya XP_013927488.1 446 aa 89.8％ 90.8％
アフリカツメガエル アフリカツメガエル 353 mya XP_018111484.1 478 aa 84.3％ 80.9％
ダニオレリオ ゼブラフィッシュ 432 mya NP_001025261.3 449 aa 77.5％ 83.2％
Nematostella vectensis スターレットイソギンチャク 685 mya XP_001634917.1 440 aa 46.8％ 63.9％
Branchiostoma belcheri ナメクジウオ 699 mya XP_019643671.1 450 aa 48.9％ 66.7％
Stegodyphus mimosarum クモ 758 mya KFM75667.1 492 aa 40.7％ 52.2％
ミドリシャミセンガイ シャミセンガイ 758 mya XP_013389803.1 438 aa 45.5％ 62.0％
Saccoglossus kowalevskii どんぐり虫 758 mya XP_006818351.1 421 aa 45.9％ 60.8％
Priapulus caudatus マリンワーム 758 mya XP_014664498.1 442 aa 43.6％ 59.2％
マガキ パシフィックオイスター 758 mya XP_011430560.1 451 aa 42.2％ 59.2％
タコbimaculoides カリフォルニアの2スポットタコ 758 mya XP_014782952.1 504aa 37.6％ 47.6％
オオミジンコ ミジンコ 758 mya JAN84465.1 430 aa 39.1％ 56.7％
オオミツバチ ジャイアントミツバチ 758 mya XP_006624940.1 428 aa 34.9％ 54.0％
アシナガバチ属 ヨーロッパアシナガバチ 758 mya XP_015181516.1 434 aa 33.5％ 53.1％
タバココナジラミ シルバーリーフコナジラミ 758 mya XP_018895945.1 418 aa 34.6％ 52.1％
コクヌストモドキ コクヌストモドキ 758 mya KYB27801.1 551 aa 34.3％ 40.8％
Lichtheimiacorymbifera Lichtheimia 1150 CDH55915.1 450 aa 23.4％ 38.5％
参考文献
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