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C14orf93

C14orf93
C14orf93は、C14orf93遺伝子によってヒトにコードされているタンパク質です。これは、核に局在する保存されたC末端を持つ球状タンパク質です。神経組織を除くすべての組織で比較的高く発現していますが、T細胞やその他の免疫組織で特に高く発現しています。 C14orf93 識別子
エイリアス
C14orf93、第14染色体オープンリーディングフレーム93、RTFC
外部ID
MGI:1921609 HomoloGene:11078 GeneCards:C14orf93
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 14番染色体(ヒト)
バンド 14q11.2 始める
22,985,894 bp
終わり
23,010,166 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 14番染色体(マウス)
バンド
14 | 14 C2
始める
54,583,663 bp
終わり
54,605,993 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
血液
前立腺
左心室 胃 胃体
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez60686 74359 Ensembl ENSG00000100802 ENSMUSG00000022179 UniProt Q9H972 Q8K2W9
RefSeq(mRNA)
NM_001130706 NM_001130708 NM_001282968 NM_001282969 NM_001282970NM_021944 NM_028890
RefSeq(タンパク質)
NP_001124178 NP_001124180 NP_001269897 NP_001269898 NP_001269899NP_068763 NP_083166
場所(UCSC)
Chr 14:22.99 – 23.01 Mb
Chr 14:54.58 – 54.61 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/
マウスの表示/編集

コンテンツ
1 遺伝子
2 タンパク質
2.1 特徴 2.2 翻訳後修飾 2.3 細胞内局在
3 表現
4 相互作用するタンパク質
5 相同性
6 参考文献

遺伝子
c14orf93は、14番染色体(14q11.2)の短腕に c14orf93のアクセッション番号は021944であり、そのエイリアスはFLJ12154とLOC60686です。この遺伝子は2430bpと7つのエクソンを持っています。
タンパク質編集

特徴
c14orf93タンパク質には9つのアイソフォームがは最も一般的で最大のアイソフォームは、538個のAAを有する分子量58.7 kdalの、と理論等電点5.7。このタンパク質は球状で、保存されたC末端、371から399の混合電荷クラスター、28から58の高スコアの非荷電セグメントを備えています。 SDSC PELEコンセンサスデータは、15個のアルファヘリックスと8個のベータストランドを予測します。

翻訳後修飾
c14orf93の翻訳後修飾には、リン酸化、N-アセチル化、およびSUMO化が含まれます。セリンリン酸化部位は23残基、スレオニンは6残基、チロシンは2残基と予測されています。残基285および428に2つの実験的に確認されたセリンリン酸化部位があり、これらは活性化または非活性化の部位として機能する可能性がN-アセチル化は2番目の残基を前提としています。この変更は、安定性とローカリゼーションに影響します。 SUMO化の可能性が高い6つのモチーフが SUMO(小さなユビキチン様修飾因子)は、タンパク質の安定性、核細胞質ゾル輸送、および転写調節に関与するカスケードを開始するユビキチンのような小さなタンパク質です。

細胞内局在
PSORTIIデータは、c14orf93が核に局在していることを予測しています。残基298-301に核局在化シグナルが残基451-459と479-487にも2つのペルオキシソームターゲティングシグナルが

表現
c14orf93は、すべての組織の平均遺伝子より2.7倍高く発現しています。神経組織を除くすべての組織で比較的高度に発現しています。 T細胞で見られる発現は著しく高く、骨髄、脾臓、リンパ節などの他の免疫組織で見られる発現パターンはわずかに高くなっています。

相互作用するタンパク質
C14orf93は、PTP1、MRFAP1、Set、APP、およびMOV10と物理的に相互作用することが示されています。 これらの相互作用を以下の表に示します。生物の列は、物理的な相互作用を示す実験でタンパク質がどこから供給されたかを示しています。
タンパク質 生命体
PTP1 Saccharomyces cerevisiae S288c
MRFAP1 ホモサピエンス
セットする ハツカネズミ
アプリ ホモサピエンス
MOV10 ホモサピエンス
これらの5つの相互作用のうち、PTP1、MRFAP1、およびSETが最も多くの検証を通過しました。PTP1、チロシンプロテインホスファターゼ1は酵母に見られるタンパク質ですが、ヒトにはオルソログが PTP1は、そのホスファターゼ活性と核周辺の位置により、c14orf93の活性化/非活性化に関与している可能性がMRFAP1、MORF4ファミリー関連タンパク質1は、MORF4 / MRGファミリーのメンバーおよび腫瘍抑制因子Rbと相互作用するヒトタンパク質です。このタンパク質は、老化、細胞増殖、および不死化に関与している可能性がマウスSetタンパク質(ホスファターゼ2A阻害剤またはI2PP2A)に対するヒトオルソログがあり、核に局在しています。セットは、ニューロンのアポトーシス過程と転写を負に調節するためにDNAに結合し、癌遺伝子として機能します。

相同性
ホモサピエンスから硬骨魚までのすべての脊椎動物にc14orf93のオルソログが c14orf93のパラログはありません。C14orf93はDUF4616ファミリーの一部です。このファミリーは、C末端ドメインの未知の機能のドメインによってマークされています。DUF4616タンパク質は、長さが166〜538アミノ酸であり、sI21231スーパーファミリーの一部です。最後の200残基のC末端は、439〜456の17残基のパターンで高度に保存されており、すべてのオルソログで特に保存されています。この領域は、c14orf93の機能において主要な役割を果たしている可能性が

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000100802 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000022179 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「NCBI遺伝子:c14orf93」。NCBI。
^ “NCBIヌクレオチド:c14orf93″。NCBI。
^ “Aceview:c14orf93″。NCBI。
^ 「NCBIタンパク質:c14orf93」。NCBI。
^ “SDSCの生物学ワークベンチ”。SDSC。
^ 「ExPasyComputePi / MWツール」。ExPasy。
^ 「ExPasyNetPhosツール」。ExPasy。
^ 「ExPasyNetAcetツール」。ExPasy。
^ 「ExPasySUMOplot分析プログラム」。ExPasy。
^ 「PSORTII」。PSORT。
^ 「NCBIGEOプロファイル:c14orf93-複数の正常組織」。NCBI。
^ 「MenthaInteractomeBrowser」。ハッカ。
^ 「BioGRID3.4」。BioGRID。
^ 「IntAct分子相互作用データベース」。欧州バイオインフォマティクス研究所。
^ 「UniProtプロファイル:PTP1」。UniProt。
^ 「UniProtプロファイル:MRFAP1」。UniProt。
^ 「UniProtプロファイル:設定」。UniProt。
^ 「NCBIブラスト」。NCBI。

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