COG3610-DE_RNA_motif
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紹介提案について
。（ 2021年12月）
「COG3610-DE RNA モチーフ」 （ 2021年11月）
COG3610 -DE RNA モチーフは、バイオインフォマティクスによって発見された保存されたRNA構造です。 COG3610-DE モチーフは、バシロタ門の一部である乳酸桿菌属に見られます。 COG3610-DE COG3610-DE RNAの
コンセンサス
二次構造と配列保存 識別子
シンボル COG3610-DE ラファム RF03066 その他のデータ RNA型 遺伝子; sRNA
それで SO:0001263 PDB構造 PDBe COG3610-DE RNA は一貫してタンパク質コード遺伝子の下流に位置しているため、おそらく 3’非翻訳領域(3′ UTR) にあると考えられます。これは、それらがシス調節要素として機能することを示唆している可能性がありますが、細菌では5′ UTRからのシス調節がはるかに一般的ですが、3′ UTRからのものです. COG3610-DE がトランスで機能する可能性もあり、それらが遺伝子転写産物の下流に位置するのは偶然です。COG3610-DE RNA がシス調節性である場合、その生物学的機能は不明です。上流遺伝子の生物学的役割はほとんど知られていないため、RNA の機能に関する手がかりはほとんどありません。ただし、遺伝子はパーミアーゼ活性を持っていると予測される場合が
参考文献
^ Weinberg Z、Lünse CE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR （2017 年 10月）. 「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による 224 の候補構造化 RNA の検出」 . 核酸解像度。45 (18): 10811–10823。ドイ: 10.1093/nar/gkx699 . PMC 5737381 . PMID 28977401。