DABA-DC-AT_RNA_motif
DABA-DC-AT RNAモチーフは、バイオインフォマティクスによって発見された保存されたRNA構造です。 DABA-DC-ATモチーフはガンマプロテオバクテリアに見られますが、圧倒的にVibrionalesの順です。
DABA-DC-AT
DABA-DC-ATRNAの
コンセンサス
二次構造と配列保存 識別子
シンボル
DABA-DC-ATRfam F02951
その他のデータ
RNAタイプ Cis-reg それで SO：0005836 PDB構造 PDBe DABA-DC-ATモチーフRNAは、タンパク質をコードする遺伝子の上流に位置することから、シス調節エレメントとして機能する可能性がこれらの遺伝子には、L-2，4-ジアミノ酪酸デカルボキシラーゼ（DABA-DC）、L-2，4-ジアミノ酪酸アミノトランスフェラーゼ（DABA-AT）、およびカルボキシノルスペルミジンデカルボキシラーゼをコードする遺伝子が含まれます。DABA-DC-ATRNAを持つ生物の1つであるVibriocholeraeは、スペルミジンも合成しないことが知られており、調節された遺伝子がこの代謝物を合成する経路の一部である可能性が
構造的には、モチーフは4つのヘアピンで構成されており、そのうち1つだけが共分散の証拠によって十分にサポートされています。したがって、モチーフが生物学的RNAに対応するという強力な証拠がありますが、正確な構造は不明なままです。
参考文献
^ Weinberg Z、LünseCE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR。「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による224の候補構造化RNAの検出」。Nucleic AcidsRes。45（18）：10811–10823。土井：10.1093 / nar / gkx699。PMC5737381 。_ PMID28977401 。_