DCP2


DCP2

は遺伝子とコードされたタンパク質についてです。発展途上国における疾病管理の優先順位報告書(第2版)に疾病管理の優先順位プロジェクトを参照して
mRNAデキャッピング酵素2は、ヒトではDCP2遺伝子によってコードされるタンパク質です。 DCP2 識別子
エイリアス
DCP2、NUDT20、mRNA2のデキャッピング
外部ID
OMIM:609844 MGI:1917890 HomoloGene:13968 GeneCards:DCP2
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 5番染色体(ヒト)
バンド 5q22.2 始める
112,976,702 bp
終わり
113,022,195 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 18番染色体(マウス)
バンド
18 | 18 B3
始める
44,380,502 bp
終わり
44,424,969 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
骨髄 血液 肝臓
卵巣胃 肺
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
m7G(5 ‘)pppNジホスファターゼ活性
マンガンイオン結合
金属イオン結合
GO:0001948タンパク質結合
エキソリボヌクレアーゼ活性、5′-ホスホモノエステルの生成
RNA結合
加水分解酵素活性
5′-3 ‘エキソリボヌクレアーゼ活性
テロメラーゼRNA結合
細胞成分
細胞質
RISC複合体
サイトゾル
Pボディ
核質
細胞結合 核 細胞質リボヌクレオプロテイン顆粒
生物学的プロセス
mRNAカタボリックプロセス
mRNAの安定性の調節
核転写されたmRNAのデデニル化依存性デキャッピング
脱デニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ異化作用
ヒストンmRNA異化過程
RNAホスホジエステル結合の加水分解、エキソヌクレアーゼ
核転写されたmRNA異化過程、ナンセンス変異依存性崩壊
テロメラーゼを介したテロメラーゼ維持の負の調節
カハール体へのテロメラーゼRNA局在の調節
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez167227 70640 Ensembl ENSG00000172795 ENSMUSG00000024472 UniProt Q8IU60 Q9CYC6
RefSeq(mRNA)NM_001242377 NM_152624 NM_027490
RefSeq(タンパク質)NP_001229306 NP_689837 NP_081766
場所(UCSC)
Chr 5:112.98 – 113.02 Mb
18番染色体:44.38 – 44.42 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/
DCP2は、5プライムエンドから分解する前にmRNAから5プライムキャップを除去するために必要なmRNAデキャッピング複合体の重要なコンポーネントです(Fenger-Gron et al。、2005)。

相互作用
DCP2は、DCP1A およびUPF1と相互作用することが示されています。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000172795 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000024472 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Wang Z、Jiao X、Carr-Schmid A、Kiledjian M。「hDcp2タンパク質は哺乳類のmRNA脱キャップ酵素プロカラチンです」。Proc Natl Acad SciUSA。99(20):12663–8。Bibcode:2002PNAS … 9912663W。土井:10.1073 /pnas.192445599。PMC130517。_ PMID12218187。_    ^ Lykke-Andersen J。「ナンセンス変異依存性崩壊におけるhUpfタンパク質に関連するヒト脱キャップ複合体の同定」。Mol CellBiol。22(23):8114–21。土井:10.1128 /MCB.22.23.8114-8121.2002。PMC134073。_ PMID12417715。_    ^ “Entrez Gene:DCP2 DCP2デキャッピング酵素ホモログ(S. cerevisiae)”。
^ Lykke-Andersen、イェンス。「ナンセンス変異依存性崩壊におけるhUpfタンパク質に関連するヒト脱キャップ複合体の同定」。モル。細胞。Biol。22(23):8114–21。土井:10.1128 /MCB.22.23.8114-8121.2002。ISSN0270-7306。_ PMC134073。_ PMID12417715。_     ^ Lejeune、Fabrice; Li Xiaojie; Maquat Lynne E。「哺乳類細胞におけるナンセンス変異依存mRNA分解には、脱キャップ、脱アデニル化、およびエキソヌクレアーゼ活性が含まれます」。モル。セル。12(3):675–87。土井:10.1016 / S1097-2765(03)00349-6。ISSN1097-2765。_ PMID14527413。_   

参考文献
上野K、熊谷T、木島T他 (1998)。「進行性肺癌で頻繁に削除される染色体5q21-22からのcDNAのクローニングと組織発現」。ハム。Genet。102(1):63–8。土井:10.1007 / s004390050655。PMID9490301 。_ S2CID36201527 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。(2003)。「15,000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99(26):16899–903。Bibcode:2002PNAS … 9916899M。土井:10.1073 /pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
ヴァンダイクE、クーゴットN、マイヤーS、他 (2004)。「ヒトDcp2:特定の細胞質構造に位置する触媒活性のあるmRNA脱キャップ酵素」。EMBOJ。21(24):6915–24。土井:10.1093 / emboj / cdf678。PMC139098 。_ PMID12486012 。_
Ingelfinger D、Arndt-Jovin DJ、LührmannR、Achsel T(2003)。「ヒトLSm1-7タンパク質は、異なる細胞質病巣において、mRNA分解酵素Dcp1 / 2およびXrnlと共局在します」。RNA。8(12):1489–501。doi:10.1017 / S1355838202021726(2021年10月31日非アクティブ)。PMC1370355 。_ PMID12515382 。_CS1 maint:2021年10月の時点でDOIは非アクティブです(リンク)
Grzymski EC(2003)。「mRNA破壊ラインの視覚化」。ナット 構造体。Biol。10(6):416。doi:10.1038 / nsb0603-416。PMID12768200 。_ S2CID40900780 。_
Piccirillo C、Khanna R、Kiledjian M(2003)。「哺乳類のmRNA脱キャップ酵素hDcp2の機能的特徴」。RNA。9(9):1138–47。土井:10.1261 /rna.5690503。PMC1370477 。_ PMID12923261 。_
Lejeune F、Li X、Maquat LE(2003)。「哺乳類細胞におけるナンセンス変異依存mRNA分解には、脱キャップ、脱アデニル化、およびエキソヌクレアーゼ活性が含まれます」。モル。セル。12(3):675–87。土井:10.1016 / S1097-2765(03)00349-6。PMID14527413 。_
太田毅、鈴木悠、西川毅他 (2004)。「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全な配列決定と特性評価」。ナット Genet。36(1):40–5。土井:10.1038 / ng1285。PMID14702039 。_
Cougot N、Babajko S、SéraphinB(2004)。「細胞質病巣は、ヒト細胞におけるmRNA崩壊の部位です」。J. CellBiol。165(1):31–40。土井:10.1083 /jcb.200309008。PMC2172085 。_ PMID15067023 。_
レーナーB、サンダーソンCM(2004)。「ヒトmRNA分解のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。GenomeRes。14(7):1315–23。土井:10.1101 /gr.2122004。PMC442147 。_ PMID15231747 。_
Liu SW、Jiao X、Liu H、etal。(2004)。「mRNAスカベンジャーデキャッピング酵素の機能分析」。RNA。10(9):1412–22。土井:10.1261 /rna.7660804。PMC1370627 。_ PMID15273322 。_
Gerhard DS、Wagner L、FeingoldEAなど。(2004)。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」。GenomeRes。14(10B):2121–7。土井:10.1101 /gr.2596504。PMC528928 。_ PMID15489334 。_
Liu J、Valencia-Sanchez MA、Hannon GJ、Parker R(2005)。「哺乳類のP-bodyへの標的mRNAのマイクロRNA依存性局在」。ナット CellBiol。7(7):719–23。土井:10.1038 / ncb1274。PMC1855297 。_ PMID15937477 。_
Fenger-GrønM、Fillman C、Norrild B、Lykke-Andersen J(2006)。「複数のプロセシングボディファクターとARE結合タンパク質TTPがmRNAデキャッピングを活性化します」。モル。セル。20(6):905–15。土井:10.1016 /j.molcel.2005.10.031。PMID16364915 。_
Wichroski MJ、Robb GB、Rana TM(2006)。「ヒトレトロウイルス宿主制限因子APOBEC3GおよびAPOBEC3FはmRNAプロセシングボディに局在します」。PLOSPathog。2(5):e41。土井:10.1371 /journal.ppat.0020041。PMC1458959 。_ PMID16699599 。_
Chu CY、Rana TM(2006)。「マイクロRNA誘導遺伝子サイレンシングによるヒト細胞の翻訳抑制にはRCK / p54が必要です」。PLOSBiol。4(7):e210。土井:10.1371 /journal.pbio.0040210。PMC1475773 。_ PMID16756390 。_
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、他 (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおけるグローバル、インビボ、および部位特異的リン酸化ダイナミクス」。セル。127(3):635–48。土井:10.1016 /j.cell.2006.09.026。PMID17081983 。_ S2CID7827573 。_
Stub
  ヒト5番染色体上の遺伝子に関するこ”