DCPS_(gene)
スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素DcpSは、ヒトではDCPS遺伝子によってコードされるタンパク質です。 DCPS 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
1ST0、1ST4、1XML、1XMM、3BL7、3BL9、3BLA、4QDE、4QDV、4QEB _ _ _ _ _ _ _ _
識別子
エイリアス
DCPS、DCS1、HINT-5、HINT5、HSL1、ARS、HSPC015、脱キャップ酵素、スカベンジャー
外部ID
OMIM：610534 MGI：1916555 HomoloGene：32202 GeneCards：DCPS
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 11番染色体（ヒト）
バンド 11q24.2 始める
126，304，060 bp
終わり
126，350，005 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 9番染色体（マウス）
バンド
9 | 9 A4
始める
35，124，408 bp
終わり
35，176，061 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
肝臓の右葉
腎皮質 肝臓 肝臓 胸腺 脾臓 血液
リンパ節
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
m7G（5 ‘）pppNジホスファターゼ活性
GO：0001948タンパク質結合
加水分解酵素活性
RNA7-メチルグアノシンキャップ結合
エキソリボヌクレアーゼ活性
細胞成分
細胞質
ミトコンドリア 核 核質
Pボディ
サイトゾル
生物学的プロセス
スプライセオソームを介したmRNAシススプライシング
プログラムされた細胞死の負の調節
mRNAプロセッシング
核転写されたmRNA異化過程、脱アデニル化依存性崩壊
メナジオンに対する細胞応答
RNAスプライシング
脱デニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ異化作用
RNAホスホジエステル結合の加水分解、エキソヌクレアーゼ
核転写されたmRNAのデデニル化依存性デキャッピング
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez28960 69305 Ensembl ENSG00000110063 ENSMUSG00000032040 UniProt Q96C86 Q9DAR7
RefSeq（mRNA）NM_014026 NM_001350236 NM_027030
RefSeq（タンパク質）NP_054745 NP_001337165 NP_081306
場所（UCSC）
Chr 11：126.3 – 126.35 Mb
Chr 9：35.12 – 35.18 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素（DcpS）のN末端
分解能1.83でのハツカネズミからのmrna脱キャップ酵素（dcps）の結晶構造
識別子
シンボルcpS Pfam F05652 InterPro PR008594 SCOP2
1st4 / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素C-term結合
識別子
シンボルcpS_C Pfam F11969
Pfam氏族L0265 SCOP2
1st4 / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
スカベンジャーmRNAデキャッピング酵素にはDcp2とDcpSが含まれます。DcpSは、3 ‘から5’のmRNA分解に続いて残留キャップ構造を加水分解するスカベンジャーピロホスファターゼです。DcpSはキャップジヌクレオチドまたはキャップ付きオリゴヌクレオチドを基質として使用してm（7）GMP（N7-メチルGMP）を放出し、Dcp2はキャップを加水分解してm（7）GDP（N7-メチルGDP）を放出するためにキャップ付きmRNAを基質として使用します。 DcpSと3 ‘から5’のエキソヌクレアーゼエキソソーム成分との関連は、これら2つの活性が関連しており、結合したエキソヌクレアーゼによる崩壊依存性の脱キャップ経路があることを示唆しています。このファミリーには、C末端ドメインにヒスチジントライアド（HIT）配列が含まれており、3つのヒスチジンが疎水性残基で分離されています。 DcpS HITモチーフ内の中央のヒスチジンはデキャッピング活性に重要であり、HITモチーフを新しいmRNAデキャッピングドメインとして定義し、DcpSを定義された生物学的機能を持つタンパク質のHITファミリーの最初のメンバーにします。
コンテンツ
1 も参照してください
2 参考文献
3 参考文献
4 外部リンク
も参照してください
Al-Raqad症候群
参考文献
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外部リンク
PDBe-KBは、PDB for Human m7GpppX diphosphatase（DCPS）で利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。
には、パブリックドメインの
Pfamおよび
InterProからのテキストが組み込まれています： IPR008594
ヒト11番染色体上の遺伝子に関するこ”