DDB1 – 日本の辞書

DDB1
DNA損傷結合タンパク質1は、ヒトではDDB1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 DDB1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
2B5L、2B5M、2B5N、2HYE、3E0C、3EI1、3EI2、3EI3、3EI4、3I7H、3I7K、3I7L、3I7N、3I7O、3I7P、3I89、3I7O、3I7P、3I89、4A _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ 4CI1、4CI2 _ _、4CI3、4E54、4E5Z、4TZ4、5FQD、5HXB _ _ _ _ _ _
識別子
エイリアス
DDB1、DDBA、UV-XAP1、XPCE、XPE、XPE-BF、損傷特異的DNA結合タンパク質1、WHIKERS
外部ID
OMIM：600045 MGI：1202384 HomoloGene：1448 GeneCards：DDB1
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 11番染色体（ヒト）
バンド 11q12.2 始める
61，299，451 bp
終わり
61，342，596 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 19番染色体（マウス）
バンド
19 A | 19 6.66 cM
始める
10，605，327 bp
終わり
10，629，819 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
副腎
睾丸
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
DNA結合
GO：0001948タンパク質結合
核酸結合
損傷したDNA結合
タンパク質-高分子アダプター活性
キュリンファミリータンパク質結合
WD40-リピートドメインバインディング
GO：0032403タンパク質含有複合体結合
細胞成分
細胞質
核質
Cul4A-RINGE3ユビキチンリガーゼ複合体
Cul4B-RINGE3ユビキチンリガーゼ複合体
細胞外エクソソーム核細胞外空間
Cul4-RINGE3ユビキチンリガーゼ複合体
タンパク質含有複合体
生物学的プロセス
有糸分裂細胞周期の相転移の調節
ヌクレオチド除去修復
ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識
宿主細胞におけるウイルスタンパク質レベルのウイルスによる正の調節
ヒストンH2Aモノユビキチン化
アポトーシスプロセスの負の調節
Wntシグナル伝達経路
グローバルゲノムヌクレオチド除去修復
シンビオントとの相互作用に関与する生物学的プロセス
ウイルスゲノム複製の正の調節
転写共役ヌクレオチド除去修復
GO：0022415ウイルスプロセス
ヌクレオチド除去修復、DNA切開
UVダメージ除去修復
DNA修復
プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質異化プロセス
ヌクレオチド-切除修復、DNA切開、3′-病変へ
ヌクレオチド切除修復、切開前複合体の安定化
ヌクレオチド切除修復、DNA二重巻き戻し
ヌクレオチド除去修復、切開前複合体アセンブリ
ヌクレオチド-切除修復、DNA切開、5′-病変まで
翻訳後タンパク質修飾
プロテアソームタンパク質異化プロセス
DNA損傷刺激に対する細胞応答
タンパク質のユビキチン化
タンパク質異化プロセスの正の調節
ユビキチン依存性タンパク質異化プロセス
概日リズムの調節
糖新生の正の調節
リズミカルなプロセス
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez1642 13194 Ensembl ENSG00000167986 ENSMUSG00000024740 UniProt Q16531 Q3U1J4
RefSeq（mRNA）NM_001923 NM_015735
RefSeq（タンパク質）NP_001914 NP_056550
場所（UCSC）
Chr 11：61.3 – 61.34 Mb
19番染色体：10.61 – 10.63 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

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コンテンツ
1 遺伝子
2 タンパク質
3 関数
4 相互作用
5 参考文献
6 参考文献

遺伝子
遺伝子の位置は染色体11q12-q13に

タンパク質
DDB1遺伝子は、大小の（DDB2）サブユニットで構成されるヘテロダイマーであるDNA損傷結合タンパク質の大サブユニットをコードします。DDB1には1140個のアミノ酸が含まれており、質量は127kDaになります。

関数
その名前が示すように、DDB1は当初、ヌクレオチド除去修復として知られる特定のタイプのDNA修復のプロセスに関与していました。それ以来、研究者は、DDB1が主にCUL4AおよびCUL4BベースのE3ユビキチンリガーゼ複合体のコアコンポーネントとして機能することを発見しました。DDB1は、DDB1およびCUL4関連因子（DCAF）として知られる数十のタンパク質と相互作用するブリッジまたはアダプタータンパク質として機能します。これらのDCAFはしばしばユビキチンリガーゼ基質であり、DNA修復（DDB2）、DNA複製、クロマチンリモデリング（Cdt2）などを含む細胞内の多くの重要なプロセスを調節します。

相互作用
DDB1は、転写開始タンパク質SPT3ホモログ、 GCN5L2、 DDB2、 CUL4A、 CUL4B およびP21と相互作用することが示されています。

参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000167986 – Ensembl、2017年5月
^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000024740 – Ensembl、2017年5月
^ 「HumanPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Dualan R、Brody T、Keeney S、Nichols AF、Admon A、Linn S（1996年2月）。「ヒト損傷特異的DNA結合タンパク質のp127およびp48サブユニットの遺伝子（DDB1およびDDB2）の染色体局在化およびcDNAクローニング」。ゲノミクス。29（1）：62–9。土井：10.1006 /geno.1995.1215。PMID8530102。_
^ 関N、林A、服部A、小妻S、佐々木M、鈴木Y、菅野S、村松M、斉藤T。「cDNAクローニング、組織発現、およびマウス遺伝子の染色体割り当て、XPE細胞に欠陥のある127kDaのUV損傷DNA結合タンパク質をコードする」。DNA解像度。6（5）：319–22。土井：10.1093 / dnares /6.5.319。PMID10574459。_
^ 「Entrez遺伝子：DDB1損傷特異的DNA結合タンパク質1、127kDa」。
^ Iovine、バーバラ; Iannella、Maria Luigia; Bevilacqua、Maria Assunta（2011）。「損傷特異的DNA結合タンパク質1（DDB1）：幅広い機能を持つタンパク質」。生化学および細胞生物学の国際ジャーナル。エルゼビア。43（12）：1664–1667。土井：10.1016 /j.biocel.2011.09.001。PMID21959250。_
^ Lee J（2007）。「DCAF、CUL4-DDB1ユビキチンリガーゼのミッシングリンク」。分子細胞。26（6）：775–780。土井：10.1016 /j.molcel.2007.06.001。PMID17588513。_
^ Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG。「ヒトSTAGA複合体は、invivoでプレmRNAスプライシングおよびDNA損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写コアクチベーターです」。モル。細胞。Biol。21（20）：6782–95。土井：10.1128 /MCB.21.20.6782-6795.2001。PMC99856。_ PMID11564863。_

^ Huang J、Chen J。「VprBPはマーリンを分解のためにRoc1-Cul4A-DDB1E3リガーゼ複合体に標的化します」。オンコジーン。27（29）：4056–64。土井：10.1038 /onc.2008.44。PMID18332868。_
^ Bergametti F、Sitterlin D、Transy C。「B型肝炎ウイルスXタンパク質の代謝回転は、損傷したDNA結合複合体によって調節されています」。J.Virol。76（13）：6495–501。土井：10.1128 /JVI.76.13.6495-6501.2002。PMC136256。_ PMID12050362。_

^ Guerrero-Santoro J、Kapetanaki MG、Hsieh CL、Gorbachinsky I、Levine AS、Rapić-OtrinV。「カリン4BベースのUV損傷を受けたDNA結合タンパク質リガーゼはUV損傷を受けたクロマチンに結合し、ヒストンH2Aをユビキチン化します」。CancerRes。68（13）：5014–22。土井：10.1158 /0008-5472.CAN-07-6162。PMID18593899。_
^ Abbas T、Sivaprasad U、Terai K、Amador V、Pagano M、Dutta A。「CRL4Cdt2ユビキチンリガーゼ複合体を介したp21ユビキチン化および分解のPCNA依存性調節」。GenesDev。22（18）：2496–506。土井：10.1101 /gad.1676108。PMC2546691。_ PMID18794347。_

参考文献
Chu G、Chang E（1988）。「色素性乾皮症グループE細胞は、損傷したDNAに結合する核因子を欠いています」。科学。242（4878）：564–7。土井：10.1126 /science.3175673。PMID3175673 。_
Lee TH、Elledge SJ、Butel JS（1995）。「B型肝炎ウイルスXタンパク質は、おそらく細胞のDNA修復タンパク質と相互作用します」。J.Virol。69（2）：1107–14。土井：10.1128 /JVI.69.2.1107-1114.1995。PMC188683 。_ PMID7815490 。_
Keeney S、Eker AP、Brody T、他。（1994）。「DNA損傷結合タンパク質の注入による色素性乾皮症グループEのDNA修復欠陥の修正」（PDF）。Proc。国立 Acad。科学アメリカ。91（9）：4053–6。土井：10.1073 /pnas.91.9.4053。PMC43721 。_ PMID8171034 。_
キーニーS、チャンGJ、リンS（1993）。「色素性乾皮症Eに関与するヒトDNA損傷結合タンパク質の特性評価。」 J.Biol。化学。268（28）：21293–300。土井：10.1016 / S0021-9258（19）36923-6。PMID8407967 。_
ファンBJ、リャオJC、チューG（1996）。「色素性乾皮症グループE細胞に欠陥のあるUV損傷DNA結合因子をコードするcDNAの単離」。Mutat。Res。362（1）：105–17。土井：10.1016 / 0921-8777（95）00040-2。PMID8538642 。_
Nichols AF、Ong P、Linn S（1996）。「色素性乾皮症グループEDdb-表現型に特有の突然変異」。J.Biol。化学。271（40）：24317–20。土井：10.1074 /jbc.271.40.24317。PMID8798680 。_
Liu W、Nichols AF、Graham JA、他。（2000）。「紫外線によって誘発されるヒトDDBタンパク質の核輸送」。J.Biol。化学。275（28）：21429–34。土井：10.1074 /jbc.M000961200。PMID10777491 。_
Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、etal。（2001）。「ヒトSTAGA複合体は、invivoでプレmRNAスプライシングおよびDNA損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写コアクチベーターです」。モル。細胞。Biol。21（20）：6782–95。土井：10.1128 /MCB.21.20.6782-6795.2001。PMC99856 。_ PMID11564863 。_
Chen X、Zhang Y、Douglas L、Zhou P（2002）。「UV損傷を受けたDNA結合タンパク質は、CUL-4Aを介したユビキチン化と分解の標的です」。J.Biol。化学。276（51）：48175–82。土井：10.1074 /jbc.M106808200。PMID11673459 。_
Rapić-OtrinV、McLenigan MP、BisiDCなど。（2002）。「UV照射後の初期のイベントとしてのUVDNA損傷結合因子の連続的結合とp48サブユニットの分解」。Nucleic AcidsRes。30（11）：2588–98。土井：10.1093 / nar /30.11.258。PMC117178 。_ PMID12034848 。_
ベルガメッティF、シッターリンD、トランシーC（2002）。「B型肝炎ウイルスXタンパク質の代謝回転は、損傷したDNA結合複合体によって調節されています」。J.Virol。76（13）：6495–501。土井：10.1128 /JVI.76.13.6495-6501.2002。PMC136256 。_ PMID12050362 。_
Bontron S、Lin-Marq N、Strubin M（2002）。「UV-DDB1に関連するB型肝炎ウイルスXタンパク質は、核内で細胞死を誘発し、UV-DDB2によって機能的に拮抗されます」。J.Biol。化学。277（41）：38847–54。土井：10.1074 /jbc.M205722200。PMID12151405 。_
Andrejeva J、Poole E、Young DF、他（2002）。「UV-DNA損傷修復結合タンパク質のp127サブユニット（DDB1）は、パラミクソウイルスシミアンウイルス5のVタンパク質によるSTAT1の標的分解に不可欠です」。J.Virol。76（22）：11379–86。土井：10.1128 /JVI.76.22.11379-11386.2002。PMC136798 。_ PMID12388698 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。（2003）。「15，000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学アメリカ。99（26）：16899–903。土井：10.1073 /pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
Groisman R、Polanowska J、Kuraoka I、他（2003）。「DDB2およびCSA複合体のユビキチンリガーゼ活性は、DNA損傷に応答してCOP9シグナロソームによって特異的に調節されます」。セル。113（3）：357–67。土井：10.1016 / S0092-8674（03）00316-7。PMID12732143 。_ S2CID11639677 。_
ロイピンO、ボントロンS、ストルービンM（2003）。「B型肝炎ウイルスXタンパク質とシミアンウイルス5Vタンパク質は、異なる活性を媒介するために同様のUV-DDB1結合特性を示します」。J.Virol。77（11）：6274–83。土井：10.1128 /JVI.77.11.6274-6283.2003。PMC154990 。_ PMID12743284 。_
Wertz IE、O’Rourke KM、Zhang Z、他（2004）。「HumanDe-etiolated-1は、CUL4Aユビキチンリガーゼを組み立てることによってc-Junを調節します」（PDF）。科学。303（5662）：1371–4。土井：10.1126 /science.1093549。PMID14739464 。_ S2CID40501515 。_
Bouwmeester T、Bauch A、Ruffner H、他。（2004）。「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的地図」。ナット CellBiol。6（2）：97–105。土井：10.1038 / ncb1086。PMID14743216 。_ S2CID11683986 。_