DDX1
ATP依存性RNAヘリカーゼDDX1は、ヒトではDDX1遺伝子によってコードされる酵素です。 DDX1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 4XW3 識別子
エイリアス
DDX1、DBP-RB、UKVH5d、DEAD / H-boxヘリカーゼ1、DEAD-boxヘリカーゼ1
外部ID
OMIM：601257 MGI：2144727 HomoloGene：3627 GeneCards：DDX1
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 2番染色体（ヒト）
バンド 2p24.3 始める
15，591，178 bp
終わり
15，634，346 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現 腱 心筋
上腕二頭筋
中側頭回
三角筋
外側広筋
肝臓
右心室
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
RNAヘリカーゼ活性
DNA結合
ヌクレオチド結合
GO：0008026ヘリカーゼ活性
ポリ（A）バインディング
クロマチン結合
GO：0001104転写コレギュレーター活性
DNA / RNAヘリカーゼ活性
GO：0001948タンパク質結合
核酸結合
ヌクレアーゼ活性
二本鎖RNA結合
エキソヌクレアーゼ活性
加水分解酵素活性
ATP結合
RNA結合
細胞成分
細胞質 膜 核質
tRNAスプライシングリガーゼ複合体
細胞質ストレス顆粒
胸の谷間 核 サイトゾル
核小体
ミトコンドリア
リボ核タンパク質複合体
生物学的プロセス
転写の調節、DNAテンプレート
外因性dsRNAへの応答
mRNAプロセッシング
ウイルスへの反応
細胞質ストレス顆粒へのタンパク質の局在
転写、DNAテンプレート
多細胞生物の発達
スプライセオソーム複合体アセンブリ
DNAデュプレックス巻き戻し
二本鎖切断修理
RNAの二次構造の巻き戻し
翻訳開始の調節
エンドヌクレアーゼによる切断とライゲーションによるtRNAスプライシング
tRNAプロセッシング
核酸ホスホジエステル結合の加水分解
免疫システムプロセス
骨髄樹状細胞サイトカイン産生の正の調節
I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の正の調節
自然免疫応答
ウイルスに対する防御反応
核酸テンプレート転写の調節
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez1653 104721 Ensembl ENSG00000079785 ENSMUSG00000037149 UniProt Q92499 Q91VR5
RefSeq（mRNA）NM_004939 NM_134040
RefSeq（タンパク質）NP_004930 NP_598801
場所（UCSC）
Chr 2：15.59 – 15.63 Mb
該当なし
PubMed検索
ウィキデータ
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コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献
関数
保存モチーフAsp-Glu-Ala-Asp（DEAD）を特徴とするDEADボックスタンパク質は、推定上のRNAヘリカーゼです。それらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライセオソームの集合など、RNAの二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関係しています。それらの分布パターンに基づいて、この家族のいくつかのメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は、機能不明のDEADボックスタンパク質をコードしています。これは、2つの網膜芽細胞腫細胞株および神経外胚葉起源の組織で高い転写レベルを示します。
相互作用
DDX1はHNRPKと相互作用することが示されています。 DDX1は、mRNA翻訳を活性化するキャップ結合複合体においてhCLE / C14orf166 / RTRAFおよびHSPC117と相互作用することも暫定的に示されています。
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ヒト2番染色体上の遺伝子に関するこ
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