DDX20

DDX20
おそらくATP依存性RNAヘリカーゼDDX20は、 DEADボックスヘリカーゼ20およびgem関連タンパク質3（GEMIN3）とも呼ばれ、ヒトではDDX20遺伝子によってコードされる酵素です。 DDX20 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 2OXC、3B7G 識別子
エイリアス
DDX20、DP103、GEMIN3、DEADボックスヘリカーゼ20
外部ID
OMIM：606168 MGI：1858415 HomoloGene：5214 GeneCards：DDX20
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 1番染色体（ヒト）
バンド 1p13.2 始める
111，754，832 bp
終わり
111，775，602 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 3番染色体（マウス）
バンド
3 | 3 F2.2
始める
105，678，270 bp
終わり
105，687，574 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
睾丸
腓腹筋
大腿四頭筋
アキレス腱
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
DNA結合
タンパク質-高分子アダプター活性
ヌクレオチド結合
GO：0008026ヘリカーゼ活性
タンパク質ドメイン特異的結合
ヒストンデアセチラーゼ結合
GO：0001948タンパク質結合
核酸結合
加水分解酵素活性
ATP結合
細胞成分
SMN-Smタンパク質複合体
サイトゾル 膜 転写リプレッサー複合体
核質
SMNコンプレックス
RNAポリメラーゼII転写リプレッサー複合体
細胞骨格 核 コイル状体のジェミニ
細胞質
核体
核小体
生物学的プロセス
RNAプロセッシング
スプライセオソームtri-snRNP複合体アセンブリ
mRNAプロセッシング
ステロイド生合成プロセスの調節
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節
卵形成
スプライセオソームsnRNPアセンブリ
RNAの二次構造の巻き戻し
RNAスプライシング
アポトーシスプロセスの正の調節
転写の負の調節、DNAテンプレート
細胞集団増殖の負の調節
ニュークリアスにインポート
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez11218 53975 Ensembl ENSG00000064703 ENSMUSG00000027905 UniProt Q9UHI6 Q9JJY4
RefSeq（mRNA）NM_007204 NM_017397
RefSeq（タンパク質）NP_009135 NP_059093
場所（UCSC）
Chr 1：111.75 – 111.78 Mb
Chr 3：105.68 – 105.69 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

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コンテンツ
1 関数
2 生物学的意味
3 相互作用
4 参考文献
5 参考文献

関数
保存モチーフAsp-Glu-Ala-Asp（DEAD）を特徴とするDEADボックスタンパク質は、推定上のRNAヘリカーゼです。それらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライセオソームの集合など、RNAの二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関係しています。それらの分布パターンに基づいて、この家族のいくつかのメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は、ATPase活性を持ち、運動ニューロン（SMN）複合体の生存の構成要素であるDEADボックスタンパク質をコードします。 SMNは脊髄性筋萎縮症の遺伝子産物であり、RNP上のSMN複合体の機能において触媒的な役割を果たす可能性が

生物学的意味
以前の研究では、DDX20が肝細胞癌の腫瘍抑制因子として、また乳癌の腫瘍促進因子として作用する可能性があることが明らかになっています。DDX20欠損症は、マイクロRNAのNF-κB抑制作用を損なうことによってNF-κB活性を増強し、マイクロRNA機構の構成要素の調​​節不全もさまざまなヒトの疾患の病因に関与している可能性があることを示唆しています。肝腫瘍抑制因子として作用するmiRNA-140など、DDX20の欠損により、miRNA-140の機能が損なわれ、その後のmiRNAの機能障害が肝発癌につながる可能性が同様に、 DDX20は、NF-κB経路を介して前立腺がん（PCa）の進行を促進する可能性が臨床ベースの研究では、陽性のDP103 /NF-κBフィードバックループが浸潤性乳がんの構成的NF-κB活性化を促進し、この経路の活性化ががんの進行と化学療法抵抗性の獲得に関連していることが観察されています。DP103は乳がん治療の治療標的としての可能性を秘めています。

相互作用
DDX20は、以下と相互作用することが示されています。
EIF2C2、
GEMIN4、
GEMIN5、 LSM2、 SMN1、 SNRPB、 SNRPD3 およびNRPG、 NRPD1、 NRPD2、 NRPE、
SNRPF、および
SIP1。

参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000064703 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000027905 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Grundhoff AT、Kremmer E、TüreciO、Glieden A、Gindorf C、Atz J、Mueller-Lantzsch N、Schubach WH、GrässerFA（1999年7月）。「エプスタインバーウイルス核タンパク質EBNA2およびEBNA3Cに結合する新規DEADボックスタンパク質であるDP103の特性評価」。J BiolChem。274（27）：19136–44。土井：10.1074 /jbc.274.27.19136。PMID10383418。_   ^ “Entrez Gene：DDX20 DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）ボックスポリペプチド20″。
^ タカタ、明美; 大塚、元行; 吉川武; 岸川隆宏; 工藤陽太郎; 後藤正; 吉田晴彦; 小池和彦（2012-04-13）。「miRNA機械コンポーネントDDX20はmicroRNA-140機能を介してNF-κBを制御します」。生化学的および生物物理学的研究コミュニケーション。420（3）：564–569。土井：10.1016 /j.bbrc.2012.03.034。ISSN1090-2104。_ PMID22445758。_    ^ タカタ、明美; 大塚、元行; 吉川武; 岸川隆宏; ひきば、陽子; 帯、俊太郎; 後藤正; カン、ヨンジュン; 前田真。「MicroRNA-140は、DNAメチルトランスフェラーゼ1（Dnmt1）の発現を直接標的とすることにより、NF-κB活性を制御することにより、肝腫瘍抑制因子として機能します」。肝臓学。57（1）：162–170。土井：10.1002 /hep.26011。ISSN1527-3350。_ PMC3521841。_ PMID22898998。_     ^ Chen、Weiguo; 周鵬; Li、Xiaowei。「DDX20の高発現は、NF-κB経路を介して前立腺癌細胞の増殖と転移の可能性を高めます」。分子医学の国際ジャーナル。37（6）：1551–1557。土井：10.3892 /ijmm.2016.2575。ISSN1791-244X。_ PMC4866965。_ PMID27121695。_     ^ シン、ウンミョン; ヘイ、ホイシン; イ・ムニ; ゴー、ジェンニー; タン、トゥアンゼア; セン、インピン; リム、ウィーを参照してYousef、Einas M。; オン、フーイティン。「DEADボックスヘリカーゼDP103は、ヒト乳がんの転移の可能性を定義します」。臨床調査ジャーナル。124（9）：3807–3824。土井：10.1172 / JCI73451。ISSN1558-8238。_ PMC4151228。_ PMID25083991。_     ^ Mourelatos Z、Dostie J、Paushkin S、Sharma A、Charroux B、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G。「miRNPs：多数のマイクロRNAを含む新しいクラスのリボ核タンパク質」。GenesDev。16（6）：720–8。土井：10.1101 /gad.974702。PMC15536​​5。_ PMID11914277。_    ^ Nelson PT、Hatzigeorgiou AG、Mourelatos Z。「ヒト神経細胞株のポリソームにおけるmiRNP：mRNAの会合」。RNA。10（3）：387–94。土井：10.1261 /rna.5181104。PMC1370934。_ PMID14970384。_    ^ Carnegie GK、Sleeman JE、Morrice N、Hastie CJ、Peggie MW、Philp A、Lamond AI、Cohen PT。「プロテインホスファターゼ4は、生存運動ニューロン複合体と相互作用し、snRNPの時間的局在を増強します」。J. CellSci。116（Pt 10）：1905–13。土井：10.1242 /jcs.00409。PMID12668731。_   ^ Charroux B、Pellizzoni L、Perkinson RA、Yong J、Shevchenko A、Mann M、Dreyfuss G。「Gemin4。宝石と核小体の両方に見られるSMN複合体の新しい成分」。J. CellBiol。148（6）：1177–86。土井：10.1083 /jcb.148.6.1177。PMC2174312。_ PMID10725331。_    ^ Gubitz AK、Mourelatos Z、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G。「Gemin5、Smタンパク質に結合するSMN複合体の新しいWDリピートタンパク質成分」。J.Biol。化学。277（7）：5631–6。土井：10.1074 /jbc.M109448200。PMID11714716。_   ^ Charroux B、Pellizzoni L、Perkinson RA、Shevchenko A、Mann M、Dreyfuss G（1999年12月）。「Gemin3：脊髄性筋萎縮症の遺伝子産物であるSMNと相互作用し、宝石の成分である新しいDEADボックスタンパク質」。J. CellBiol。147（6）：1181–94。土井：10.1083 /jcb.147.6.1181。PMC2168095。_ PMID10601333。_    ^ Meister G、BühlerD、Laggerbauer B、Zobawa M、Lottspeich F、Fischer U。「運動ニューロン（SMN）タンパク質とスプライセオソームSmタンパク質の特定のサブセットの生存を含む核20S複合体の特性評価」。ハム。モル。Genet。9（13）：1977–86。土井：10.1093 / hmg /9.13.1977。PMID10942426。_  

参考文献
Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W、Gibbs RA（1996）。「ショットガンライブラリ構築を改善するための「ダブルアダプタ」方式」。肛門。生化学。236（1）：107–13。土井：10.1006 /abio.1996.0138。PMID8619474 。_
Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W、Ricafrente JY、Wentland MA、Lennon G、Gibbs RA（1997）。「大規模な連結cDNAシーケンシング」。GenomeRes。7（4）：353–8。土井：10.1101 /gr.7.4.353。PMC139146 。_ PMID9110174 。_
Charroux B、Pellizzoni L、Perkinson RA、Shevchenko A、Mann M、Dreyfuss G（2000）。「Gemin3：脊髄性筋萎縮症の遺伝子産物であるSMNと相互作用し、宝石の成分である新しいDEADボックスタンパク質」。J. CellBiol。147（6）：1181–94。土井：10.1083 /jcb.147.6.1181。PMC2168095 。_ PMID10601333 。_
Charroux B、Pellizzoni L、Perkinson RA、Yong J、Shevchenko A、Mann M、Dreyfuss G（2000）。「Gemin4。宝石と核小体の両方に見られるSMN複合体の新しい成分」。J. CellBiol。148（6）：1177–86。土井：10.1083 /jcb.148.6.1177。PMC2174312 。_ PMID10725331 。_
Meister G、BühlerD、Laggerbauer B、Zobawa M、Lottspeich F、Fischer U（2000）。「運動ニューロン（SMN）タンパク質とスプライセオソームSmタンパク質の特定のサブセットの生存を含む核20S複合体の特性評価」。ハム。モル。Genet。9（13）：1977–86。土井：10.1093 / hmg /9.13.1977。PMID10942426 。_
Pellizzoni L、Charroux B、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2001）。「生存運動ニューロン複合体とRNAポリメラーゼIIの間の機能的相互作用」。J. CellBiol。152（1）：75–85。土井：10.1083 /jcb.152.1.75。PMC2193649 。_ PMID11149922 。_
Friesen WJ、Paushkin S、Wyce A、Massenet S、Pesiridis GS、Van Duyne G、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2001）。「メチロソーム、JBP1とpIClnを含む20S複合体は、ジメチルアルギニン修飾Smタンパク質を生成します」。モル。細胞。Biol。21（24）：8289–300。土井：10.1128 /MCB.21.24.8289-8300.2001。PMC99994 。_ PMID11713266 。_
Gubitz AK、Mourelatos Z、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2002）。「Gemin5、Smタンパク質に結合するSMN複合体の新しいWDリピートタンパク質成分」。J.Biol。化学。277（7）：5631–6。土井：10.1074 /jbc.M109448200。PMID11714716 。_
Pellizzoni L、Baccon J、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2002）。「運動ニューロン複合体の本来の生存の精製および新規成分としてのGemin6の同定」。J.Biol。化学。277（9）：7540–5。土井：10.1074 /jbc.M110141200。PMID11748230 。_
Mourelatos Z、Dostie J、Paushkin S、Sharma A、Charroux B、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2002）。「miRNPs：多数のマイクロRNAを含む新しいクラスのリボ核タンパク質」。GenesDev。16（6）：720–8。土井：10.1101 /gad.974702。PMC15536​​5 。_ PMID11914277 。_
Klappacher GW、Lunyak VV、Sykes DB、Sawka-Verhelle D、Sage J、Brard G、Ngo SD、Gangadharan D、Jacks T、Kamps MP、Rose DW、Rosenfeld MG、Glass CK（2002）「誘導されたEtsリプレッサー複合体は、最終的なマクロファージ分化中の成長停止を調節します」。セル。109（2）：169–80。土井：10.1016 / S0092-8674（02）00714-6。PMID12007404 。_ S2CID16359491 。_
Baccon J、Pellizzoni L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G（2002）。「運動ニューロン複合体の生存の新規成分であるGemin7の同定と特性評価」。J.Biol。化学。277（35）：31957–62。土井：10.1074 /jbc.M203478200。PMID12065586 。_
Narayanan U、Ospina JK、Frey MR、Hebert MD、Matera AG（2003）。「脊髄性筋萎縮症タンパク質であるSMNは、スヌールポルチン1およびインポーチンベータと輸入前のsnRNP複合体を形成します」。ハム。モル。Genet。11（15）：1785–95。土井：10.1093 / hmg /11.15.1785。PMC1630493 。_ PMID12095920 。_
Carnegie GK、Sleeman JE、Morrice N、Hastie CJ、Peggie MW、Philp A、Lamond AI、Cohen PT（2004）。「プロテインホスファターゼ4は、生存運動ニューロン複合体と相互作用し、snRNPの時間的局在を増強します」。J. CellSci。116（Pt 10）：1905–13。土井：10.1242 /jcs.00409。PMID12668731 。_
Lehner B、Semple JI、Brown SE、Counsell D、Campbell RD、Sanderson CM（2004）。「ハイスループット酵母ツーハイブリッドシステムの分析と、ヒトMHCクラスIII領域内にコードされている細胞内タンパク質の機能を予測するためのその使用」。ゲノミクス。83（1）：153–67。土井：10.1016 / S0888-7543（03）00235-0。PMID14667819 。_
Nelson PT、Hatzigeorgiou AG、Mourelatos Z（2004）。「ヒト神経細胞株のポリソームにおけるmiRNP：mRNAの会合」。RNA。10（3）：387–94。土井：10.1261 /rna.5181104。PMC1370934 。_ PMID14970384 。_
Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、VillénJ、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP（2004）。「HeLa細胞の核リンタンパク質の大規模な特性評価」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。101（33）：12130–5。Bibcode：2004PNAS..10112130B。土井：10.1073 /pnas.0404720101。PMC514446 。_ PMID15302935 。_