DDX47
おそらくATP依存性RNAヘリカーゼDDX47は、ヒトではDDX47遺伝子によってコードされる酵素です。 DDX47 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 3BER 識別子
エイリアス
DDX47、E4-DBP、HQ0256、MSTP162、RRP3、DEADボックスヘリカーゼ47
外部ID
OMIM：615428 MGI：1915005 HomoloGene：6092 GeneCards：DDX47
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 12番染色体（ヒト）
バンド 12p13.1 始める
12，813，316 bp
終わり
12，829，981 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 6番染色体（マウス）
バンド
6 | 6 G1
始める
135，011，612 bp
終わり
135，023，776 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
骨髄
肝臓
ランゲルハンス島
膀胱
甲状腺
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
ヌクレオチド結合
GO：0001948タンパク質結合
加水分解酵素活性
ATP結合
GO：0008026ヘリカーゼ活性
核酸結合
RNA結合
細胞成分
核小体膜 核
核質
細胞質
生物学的プロセス
mRNAプロセッシング
デスドメイン受容体を介した外因性アポトーシスシグナル伝達経路
RNAの二次構造の巻き戻し
RNAスプライシング
アポトーシスプロセス
rRNAプロセッシング
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez51202 67755 Ensembl ENSG00000213782 ENSMUSG00000030204 UniProt Q9H0S4 Q9CWX9
RefSeq（mRNA）NM_201224 NM_016355 NM_026360
RefSeq（タンパク質）NP_057439 NP_957518 NP_080636
場所（UCSC）
Chr 12：12.81 – 12.83 Mb
Chr 6：135.01 – 135.02 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
この遺伝子は、DEADボックスタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。保存モチーフAsp-Glu-Ala-Asp（DEAD）を特徴とするDEADボックスタンパク質は、推定上のRNAヘリカーゼです。それらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライセオソームの集合など、RNAの二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関係しています。それらの分布パターンに基づいて、この家族のいくつかのメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、核と細胞質の間を往復することができ、RNAに依存しないATPase活性を持っています。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシングされた転写変異体が見つかっています。
参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000213782 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000030204 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ “Entrez Gene：DDX47 DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）ボックスポリペプチド47″。
参考文献
丸山K、菅野S（1994）。「オリゴキャッピング：真核生物のmRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドに置き換える簡単な方法」。遺伝子。138（1–2）：171–4。土井：10.1016 / 0378-1119（94）90802-8。PMID8125298 。_
鈴木恭子、吉友・中川晃、丸山晃他 （1997）。「全長濃縮および5 ‘末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」。遺伝子。200（1–2）：149–56。土井：10.1016 / S0378-1119（97）00411-3。PMID9373149 。_
ドアバーJ、エルストンRC、ナプサインS他 （2000）。「ヒトパピローマウイルス16型のE1∧E4タンパク質は、C末端の配列を介して推定RNAヘリカーゼと結合します」。J.Virol。74（21）：10081–95。土井：10.1128 /JVI.74.21.10081-10095.2000。PMC102047 。_ PMID11024137 。_
Hartley JL、Temple GF、Brasch MA（2001）。「invitro部位特異的組換えを使用したDNAクローニング」。GenomeRes。10（11）：1788–95。土井：10.1101 /gr.143000。PMC310948 。_ PMID11076863 。_
Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 （2001）。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて：500の新規完全タンパク質コーディングヒトcDNAの配列決定および分析」。GenomeRes。11（3）：422–35。土井：10.1101 /gr.GR1547R。PMC311072 。_ PMID11230166 。_
Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、他 （2001）。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の体系的な細胞内局在」。EMBO担当者。1（3）：287–92。土井：10.1093 / embo-reports / kvd058。PMC1083732 。_ PMID11256614 。_
Scherl A、CoutéY、DéonC、他 （2003）。「ヒト核小体の機能的プロテオミクス分析」。モル。Biol。セル。13（11）：4100–9。土井：10.1091 /mbc.E02-05-0271。PMC133617 。_ PMID12429849 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。（2003）。「15，000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99（26）：16899–903。土井：10.1073 /pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
太田毅、鈴木悠、西川毅他 （2004）。「21，243個の完全長ヒトcDNAの完全な配列決定と特性評価」。ナット Genet。36（1）：40–5。土井：10.1038 / ng1285。PMID14702039 。_
よろしくJB、Scheek S、Borbiev T、他。（2004）。「Verge：新しい血管初期応答遺伝子」。J.Neurosci。24（16）：4092–103。土井：10.1523 /JNEUROSCI.4252-03.2004。PMC6729408 。_ PMID15102925 。_
Gerhard DS、Wagner L、FeingoldEAなど。（2004）。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」。GenomeRes。14（10B）：2121–7。土井：10.1101 /gr.2596504。PMC528928 。_ PMID15489334 。_
Wiemann S、Arlt D、Huber W、他 （2004）。「ORFeomeから生物学へ：機能ゲノミクスパイプライン」。GenomeRes。14（10B）：2136–44。土井：10.1101 /gr.2576704。PMC528930 。_ PMID15489336 。_
Andersen JS、Lam YW、Leung AK、他 （2005）。「核小体プロテオームダイナミクス」。自然。433（7021）：77–83。土井：10.1038 / nature03207。PMID15635413 。_ S2CID4344740 。_
Lee JH、Rho SB、Chun T（2005）。「GABAA受容体関連タンパク質（GABARAP）は、DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp / His）ボックスポリペプチド47（DDX 47）と相互作用することによりアポトーシスを誘導します」。バイオテクノロジー。Lett。27（9）：623–8。土井：10.1007 / s10529-005-3628-2。PMID15977068 。_ S2CID19960329 。_
Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、他 （2006）。「2006年のLIFEdbデータベース」。Nucleic AcidsRes。34（データベースの問題）：D415–8。土井：10.1093 / nar / gkj139。PMC1347501 。_ PMID16381901 。_
このタンパク質関連
“