DDX5

DDX5
DEADボックスプロテイン5またはRNAヘリカーゼp68としても知られるATP依存性RNAヘリカーゼDDX5は、ヒトではDDX5遺伝子によってコードされる酵素である可能性が DDX5 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
3FE2、4A4D _ _
識別子
エイリアス
DDX5、G17P1、HLR1、HUMP68、p68、DEADボックスヘリカーゼ5
外部ID
OMIM：180630 MGI：105037 HomoloGene：6797 GeneCards：DDX5
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 17番染色体（ヒト）
バンド 17q23.3 始める
64，498，254 bp
終わり
64，508，199 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 11番染色体（マウス）
バンド
11 E1 | 11 70.01 cM
始める
106，780，355 bp
終わり
106，789，185 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
睾丸
脳梁
アキレス腱
脳下垂体 骨髄 右肺
下垂体前葉
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
ヌクレオチド結合
GO：0008026ヘリカーゼ活性
カルシウム依存性タンパク質結合
カルモジュリン結合
GO：0001948タンパク質結合
アンドロゲン受容体結合
核酸結合
酵素結合
プレmRNA結合
加水分解酵素活性
ATP結合
RNAヘリカーゼ活性
RNA結合
mRNA3′-UTR結合
リボ核タンパク質複合体結合
プロモーター特異的クロマチン結合
MH2ドメイン結合
SMADバインディング
R-SMADバインディング
一次miRNA結合
GO：0001104転写コレギュレーター活性
細胞成分
触媒ステップ2スプライセオソーム 膜 核小体
スプライセオソーム複合体
細胞外エクソソーム 核 GO：0005578細胞外マトリックス
核質
SMADタンパク質複合体
細胞質
リボ核タンパク質複合体
生物学的プロセス
骨格筋細胞分化の調節
転写の調節、DNAテンプレート
リズミカルなプロセス
ウイルスゲノム複製の調節
mRNAプロセッシング
mRNA転写
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の調節
転写、DNAテンプレート
細胞増殖
骨芽細胞分化の調節
RNAの二次構造の巻き戻し
p53クラスメディエーターによる内因性アポトーシスシグナル伝達経路
RNAスプライシング
アンドロゲン受容体シグナル伝達経路の調節
DNA損傷応答の正の調節、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達
スプライセオソームを介したmRNAスプライシング
スプライセオソームを介した選択的mRNAスプライシングの調節
核転写されたmRNA異化過程
スプライセオソームを介した選択的mRNAスプライシング
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
細胞内エストロゲン受容体シグナル伝達経路
アンドロゲン受容体シグナル伝達経路
上皮間葉転換
筋芽細胞の分化
RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写
BMPシグナル伝達経路
RNAポリメラーゼIIによるpri-miRNA転写の調節
miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生の正の調節
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez1655 13207 Ensembl ENSG00000108654 ENSMUSG00000020719 UniProt P17844 Q61656
RefSeq（mRNA）
NM_004396 NM_001320595 NM_001320596 NM_001320597
NM_007840 NM_001355676 NM_001355677
RefSeq（タンパク質）
NP_001307524 NP_001307525 NP_001307526 NP_004387
該当なし
場所（UCSC）
17番染色体：64.5 – 64.51 Mb
Chr 11：106.78 – 106.79 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/
マウスの表示/編集

コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献

関数
保存モチーフAsp-Glu-Ala-Asp（DEAD）を特徴とするDEADボックスタンパク質は、推定上のRNAヘリカーゼです。それらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライセオソームの集合など、RNAの二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関係しています。それらの分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子は、RNA依存性ATPaseであるDEADボックスタンパク質と、シミアンウイルス40腫瘍抗原と特異的に反応する増殖関連核抗原をコードしています。この遺伝子は13個のエクソンで構成されており、選択的スプライシングされたいくつかのイントロン配列を含む転写産物が検出されていますが、これらの転写産物によってコードされるアイソフォームは同定され

相互作用
DDX5は以下と相互作用することが示されています： AKAP8、 DDX17（p72）、
DHX9（RNAヘリカーゼA）、
エストロゲン受容体α、
フィブリラリン、 HDAC1、 核内受容体コアクチベーター1、
核内受容体コアクチベーター2、
核内受容体コアクチベーター3、 p53、 CTCF。

参考文献
^ GRCh38：Ensemblリリース89：ENSG00000108654 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38：Ensemblリリース89：ENSMUSG00000020719 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ “Entrez Gene：DDX5 DEAD（Asp-Glu-Ala-Asp）ボックスポリペプチド5″。
^ ルグラン、JMD; チャン、AL; ラ、HM; ロッセロ、FJ; Änkö、ML; フラーペース、FV; ホッブズ、RM（2019年5月23日）。「DDX5は精原細胞の維持と機能において重要な転写および転写後の役割を果たしています」。ネイチャーコミュニケーションズ。10（1）：2278。Bibcode：2019NatCo..10.2278L。土井：10.1038 / s41467-019-09972-7。PMC6533336。_ PMID31123254。_    ^ Akileswaran L、Taraska JW、Sayer JA、Gettemy JM、Coghlan VM。「A-キナーゼアンカータンパク質AKAP95は核マトリックスを標的とし、p68RNAヘリカーゼと結合します」。J.Biol。化学。276（20）：17448–54。土井：10.1074 /jbc.M101171200。PMID11279182。_   ^ Ogilvie VC、Wilson BJ、Nicol SM、Morrice NA、Saunders LR、Barber GN、Fuller-Pace FV。「関連性の高いDEADボックスRNAヘリカーゼp68およびp72は、細胞内にヘテロダイマーとして存在します」。Nucleic AcidsRes。31（5）：1470–80。土井：10.1093 / nar / gkg236。PMC149829。_ PMID12595555。_    ^ Wilson BJ、GiguèreV（2007）。「Oncomineメタアナリシスによるp68およびp72RNAヘリカーゼの新規経路パートナーの同定」。BMCゲノミクス。8：419。doi：10.1186 / 1471-2164-8-419。PMC3225811。_ PMID18005418。_    ^ 遠藤H、丸山K、増弘Y、小林Y、後藤M、太H、柳沢J、メッツガーD、橋本S、加藤S（1999年8月）。「ヒトエストロゲン受容体αの活性化機能1に特異的な転写コアクチベーターとして作用するp68RNAヘリカーゼの精製と同定」。モル。細胞。Biol。19（8）：5363–72。土井：10.1128 /MCB.19.8.5363。PMC84379。_ PMID10409727。_    ^ Rossow KL、Janknecht R。「p68RNAヘリカーゼと転写コアクチベーターCBPおよびp300の間の相乗作用」。オンコジーン。22（1）：151–6。土井：10.1038 /sj.onc.1206067。PMID12527917。_   ^ Nicol SM、Causevic M、Prescott AR、Fuller-Pace FV。「核DEADボックスRNAヘリカーゼp68は、核小体タンパク質フィブリラリンと相互作用し、終期に発生期の核小体に特異的に共局在します」。Exp。CellRes。257（2）：272–80。土井：10.1006 /excr.2000.4886。PMID10837141。_   ^ Wilson BJ、Bates GJ、Nicol SM、Gregory DJ、Perkins ND、Fuller-Pace FV。「p68およびp72DEADボックスRNAヘリカーゼはHDAC1と相互作用し、プロモーター特異的な方法で転写を抑制します」。BMCMol。Biol。5：11。doi：10.1186 / 1471-2199-5-11。PMC514542。_ PMID15298701。_    ^ 渡辺M、柳沢J、北川H、竹山K、小川S、荒尾Y、須沢M、小林Y、矢野T、吉川H、増弘Y、加藤S。「RNA結合DEADボックスタンパク質のサブファミリーは、RNAコアクチベーターSRAとのN末端活性化ドメイン（AF-1）を介してエストロゲン受容体αコアクチベーターとして機能します」。EMBOJ。20（6）：1341–52。土井：10.1093 / emboj /20.6.1341。PMC145523。_ PMID11250900。_    ^ Bates GJ、Nicol SM、Wilson BJ、Jacobs AM、Bourdon JC、Wardrop J、Gregory DJ、Lane DP、Perkins ND、Fuller-Pace FV。「DEADボックスタンパク質p68：p53腫瘍抑制因子の新規転写コアクチベーター」。EMBOJ。24（3）：543–53。土井：10.1038 /sj.emboj.7600550。PMC548656。_ PMID15660129。_    ^ Yao H、Brick K、Evrard Y、Xiao T、Camerini-Otero RD、Felsenfeld G（2010）。「DEADボックスRNA結合タンパク質p68およびステロイド受容体RNA活性化因子SRAによるCTCF転写絶縁の媒介」。GenesDev。24（22）：2543–2555。土井：10.1101 /gad.1967810。PMC2975930。_ PMID20966046。_   

参考文献
Iggo RD、Jamieson DJ、MacNeillSAなど。（1991）。「p68RNAヘリカーゼ：核小体型の同定と酵母の保存されたイントロンを含む関連遺伝子のクローニング」。モル。細胞。Biol。11（3）：1326–33。土井：10.1128 /MCB.11.3.1326。PMC369403 。_ PMID1996094 。_
Hloch P、Schiedner G、Stahl H（1990）。「ヒトp68タンパク質の完全なcDNA配列」。Nucleic AcidsRes。18（10）：3045。doi ： 10.1093 / nar /18.10.3045。PMC330836 。_ PMID2349099 。_
フォードMJ、アントンIA、レーンDP（1988）。「翻訳開始因子eIF-4Aと配列相同性のある核タンパク質」。自然。332（6166）：736–8。Bibcode：1988Natur.332..736F。土井：10.1038 / 332736a0。PMID2451786 。_ S2CID4351448 。_
Iggo R、Gough A、Xu W、他 （1989）。「ポリメラーゼ連鎖反応を用いた68kDa核抗原（p68）をコードするヒト遺伝子の染色体マッピング」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。86（16）：6211–4。Bibcode：1989PNAS … 86.6211I。土井：10.1073 /pnas.86.16.6211。PMC297807 。_ PMID2762324 。_
Buelt MK、Glidden BJ、Storm DR（1994）。「カルモジュリンとプロテインキナーゼCによるp68RNAヘリカーゼの調節」。J.Biol。化学。269（47）：29367–70。土井：10.1016 / S0021-9258（18）43885-9。PMID7525583 。_
Brody LC、Abel KJ、CastillaLHなど。（1995）。「ヒト17番染色体のBRCA1遺伝子座を取り巻く転写マップの構築」。ゲノミクス。25（1）：238–47。土井：10.1016 / 0888-7543（95）80131-5。PMID7774924 。_
遠藤秀樹、丸山健一、増弘裕一ほか （1999）。「ヒトエストロゲン受容体αの活性化機能1に特異的な転写コアクチベーターとして作用するp68RNAヘリカーゼの精製と同定」。モル。細胞。Biol。19（8）：5363–72。土井：10.1128 /MCB.19.8.5363。PMC84379 。_ PMID10409727 。_
RösslerOG、Hloch P、SchützN、他 （2000）。「ヒトp68RNAヘリカーゼ遺伝子の構造と発現」。Nucleic AcidsRes。28（4）：932–9。土井：10.1093 / nar /28.4.932。PMC102575 。_ PMID10648785 。_
Nicol SM、Causevic M、Prescott AR、Fuller-Pace FV（2000）。「核DEADボックスRNAヘリカーゼp68は、核小体タンパク質フィブリラリンと相互作用し、終期に発生期の核小体に特異的に共局在します」。Exp。CellRes。257（2）：272–80。土井：10.1006 /excr.2000.4886。PMID10837141 。_
渡辺M、柳沢J、北川H他 （2001）。「RNA結合DEADボックスタンパク質のサブファミリーは、RNAコアクチベーターSRAとのN末端活性化ドメイン（AF-1）を介してエストロゲン受容体αコアクチベーターとして機能します」。EMBOJ。20（6）：1341–52。土井：10.1093 / emboj /20.6.1341。PMC145523 。_ PMID11250900 。_
Akileswaran L、Taraska JW、Sayer JA、他 （2001）。「A-キナーゼアンカータンパク質AKAP95は核マトリックスを標的とし、p68RNAヘリカーゼと結合します」。J.Biol。化学。276（20）：17448–54。土井：10.1074 /jbc.M101171200。PMID11279182 。_
Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、他。（2002）。「ヒト核小体の指示されたプロテオミクス分析」。Curr。Biol。12（1）：1–11。土井：10.1016 / S0960-9822（01）00650-9。PMID11790298 。_ S2CID14132033 。_
Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR、他。（2002）。「三次元構造解析に適したネイティブスプライセオソームの精製と特性評価」。RNA。8（4）：426–39。土井：10.1017 / S1355838202021088。PMC1370266 。_ PMID11991638 。_
劉ZR（2002）。「p68RNAヘリカーゼは、U1 snRNA-5 ‘スプライス部位二重鎖で作用する必須のヒトスプライシング因子です」。モル。細胞。Biol。22（15）：5443–50。土井：10.1128 /MCB.22.15.5443-5450.2002。PMC133941 。_ PMID12101238 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。（2003）。「15，000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99（26）：16899–903。土井：10.1073 /pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
Rossow KL、Janknecht R（2003）。「p68RNAヘリカーゼと転写コアクチベーターCBPおよびp300の間の相乗作用」。オンコジーン。22（1）：151–6。土井：10.1038 /sj.onc.1206067。PMID12527917 。_
Guil S、Gattoni R、Carrascal M、他 （2003）。「cH-ras選択的スプライシング調節におけるhnRNPA1、SRタンパク質、およびp68ヘリカーゼの役割」。モル。細胞。Biol。23（8）：2927–41。土井：10.1128 /MCB.23.8.2927-2941.2003。PMC152554 。_ PMID12665590 。_
藤田徹、小林悠、和田修ほか （2003）。「エストロゲン受容体α活性化関数-1の完全な活性化は、乳がん細胞の増殖を誘導します」。J.Biol。化学。278（29）：26704–14。土井：10.1074 /jbc.M301031200。PMID12738788 。_
太田毅、鈴木悠、西川毅他 （2004）。「21，243個の完全長ヒトcDNAの完全な配列決定と特性評価」。ナット Genet。36（1）：40–5。土井：10.1038 / ng1285。PMID14702039 。_
ポータル：

 
生物学”