DEFB106A


DEFB106A
ベータディフェンシン106は、ヒトではDEFB106A遺伝子によってコードされるタンパク質です。 DEFB106A 利用可能な構造 PDB 人間のUniProt検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 2LWL 識別子
エイリアス
DEFB106A、BD-6、DEFB-6、DEFB106、ディフェンシンベータ106A
外部ID
HomoloGene:134659 GeneCards:DEFB106A
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 8番染色体(ヒト)
バンド 8p23.1 始める
7,825,139 bp
終わり
7,829,053 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
膀胱
多細胞生物 膵臓 肝臓 血液
膵臓の体
脚の筋肉
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
リポ多糖結合
ヘパリン結合
GO:0001948タンパク質結合
CCR2ケモカイン受容体結合
細胞成分
細胞外領域 核 細胞表面
膜の外因性成分
微小胞 膜 生物学的プロセス
防衛対応
細菌に対する防御反応
自然免疫応答
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez 245909
該当なしEnsembl ENSG00000186579 ENSG00000285617
該当なしUniProt Q8N104
該当なし
RefSeq(mRNA) NM_152251 該当なし
RefSeq(タンパク質) NP_689464 該当なし
場所(UCSC)
Chr 8:7.83 – 7.83 Mb
該当なし
PubMed検索
該当なし
ウィキデータ

人間の表示/
ディフェンシンは、好中球によって作られる殺菌性および細胞毒性ペプチドのファミリーを形成します。ディフェンシンは、構造によってアルファディフェンシン、ベータディフェンシン、シータディフェンシンの3つのグループに分類される短い処理済みペプチド分子です。すべてのベータディフェンシン遺伝子は、4〜5個のシンテニー染色体領域に密集しています。染色体8p23には、複製されたベータディフェンシンクラスターのコピーが少なくとも2つ含まれています。この重複により、ディフェンシンの2つの同一のコピー、ベータ106、DEFB106AおよびDEFB106Bが、頭と頭の向きになります。この遺伝子DEFB106Aは、よりセントロメアのコピーを表しています。

関数
精製されたDEFB106は、大腸菌、カンジダアルビカンス、黄色ブドウ球菌に対して抗菌活性を示しました。

参考文献
^ ENSG00000285617 GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000186579、ENSG00000285617 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Schutte BC、Mitros JP、Bartlett JA、Walters JD、Jia HP、Welsh MJ、Casavant TL、McCray PB Jr。「計算検索戦略を使用した5つの保存されたベータディフェンシン遺伝子クラスターの発見」。Proc Natl Acad SciUSA。99(4):2129–33。土井:10.1073 /pnas.042692699。PMC122330。_ PMID11854508。_    ^ “Entrez Gene:DEFB106Aディフェンシン、ベータ106A”。
^ Xin A。「ヒトβ-ディフェンシン6の可溶性融合発現、特性評価および局在化…」Mol MedRep。9(1):149–55。土井:10.3892 /mmr.2013.1768。PMID24189797。_
 

参考文献
山口恭子、長瀬毅、牧田亮他 (2002)。「ヒトおよびマウスにおける複数の新規精巣上体特異的ベータディフェンシンアイソフォームの同定」。J.Immunol。169(5):2516–23。土井:10.4049 /jimmunol.169.5.2516。PMID12193721 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。(2003)。「15,000を超える完全長のヒトおよびマウスのcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99(26):16899–903。土井:10.1073 /pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
花王CY、陳Y、趙YH、呉R(2003)。「気道上皮細胞特異的新規ヒトβ-ディフェンシン遺伝子のORFeomeベースの検索」。午前。J.呼吸。セルモル。Biol。29(1):71–80。CiteSeerX10.1.1.108.7808 。_ 土井:10.1165 /rcmb.2002-0205OC。PMID12600824 。_
Semple CA、Rolfe M、Dorin JR(2003)。「霊長類のベータディフェンシン遺伝子の進化における重複と選択」。ゲノムバイオロジー。4(5):R31。土井:10.1186 / gb-2003-4-5-r31。PMC156587 。_ PMID12734011 。_
Hollox EJ、Armor JA、Barber JC(2003)。「ベータディフェンシン抗菌遺伝子クラスターの広範な正常コピー数多型」。午前。J.ハム。Genet。73(3):591–600。土井:10.1086 / 378157。PMC1180683 。_ PMID12916016 。_
Gerhard DS、Wagner L、FeingoldEAなど。(2004)。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」。GenomeRes。14(10B):2121–7。土井:10.1101 /gr.2596504。PMC528928 。_ PMID15489334 。_
Taudien S、Galgoczy P、Huse K、他。(2006)。「8p23.1での多型セグメント重複は、個々のディフェンシン遺伝子レパートリーの決定と隣接するヒト参照配列の組み立てに挑戦します」。BMCゲノミクス。5(1):92。doi:10.1186 / 1471-2164-5-92。PMC544879 。_ PMID15588320 。_
Boniotto M、Ventura M、Eskdale J、他 (2005)。「染色体領域8p22-23におけるヒトディフェンシン遺伝子DEFB4の重複の証拠およびSNP対立遺伝子分布の分析への影響」。ジェネット。テスト。8(3):325–7。土井:10.1089 /gte.2004.8.325。PMID15727258 。_
Patil AA、Cai Y、Sang Y、他 (2006)。「哺乳類のベータディフェンシン遺伝子ファミリーの異種間分析:シンテニー遺伝子クラスターの存在と男性の生殖管における優先的発現」。生理。ゲノミクス。23(1):5–17。土井:10.1152 /physiolgenomics.00104.2005。PMID16033865 。_
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