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DEPドメイン

DEP_domain

分子生物学では、DEPドメイン(D ishevelled、E gl-10、およびP leckstrinドメイン)は、 Gタンパク質シグナル伝達経路に関与する50を超えるタンパク質に見られる約80アミノ酸の球状タンパク質ドメインです。それは最初に発見された3つのタンパク質にちなんで名付けられました:
Disheveled (DshおよびDvl)。これは、細胞表面から核へのWg / Wntシグナル伝達において重要な役割を果たします。これは、胚の分極細胞とセグメントのコヒーレントアレイを確立するために必要なセグメント極性タンパク質であり、翼のないシグナル伝達において役割を果たします。
Egl-10は、RGS9の中枢神経系のGタンパク質シグナル伝達を調節します。
Dishevelled、Egl-10、およびPleckstrin(DEP)で見つかったドメイン
wntシグナル伝達経路における乱れたdepドメインの認識の構造的基礎
識別子
シンボルEP Pfam F00610 InterPro PR000591 CDD d04371
利用可能なタンパク質構造:
Pfam  
構造/ ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
血小板中のプロテインキナーゼCの主要な基質であるプレクストリン; プレクストリンには、DEPドメインに隣接する2つのPHドメインが含まれています。
Gタンパク質シグナル伝達の哺乳類調節因子もこれらのドメインを含み、 Gタンパク質アルファサブユニットのGTPase活性を増加させることによってシグナル伝達を調節し、それによってそれらを不活性なGDP結合型に駆動します。DEPドメインは、DEPドメインを含むタンパク質を特定の細胞内膜部位、おそらく特定のGタンパク質共役シグナル伝達経路に標的化する際に選択的な役割を果たす可能性があるます。 核磁気共鳴分光法により、DEPドメインは3ヘリックスバンドル、C末端領域に2つのベータストランドと2つの短いベータストランドで構成されるベータヘアピン「アーム」を含むことが明らかになりました。

参考文献
^ 増穂、私。若杉-増穂、H。; Posokhova、EN; パットン、JR; マルテミャノフ、KA(2011)。「タイプ5Gタンパク質サブユニット(G 5)は、Gタンパク質シグナル伝達9(RGS9)のレギュレーターと膜アンカーとの相互作用を制御します」。Journal of BiologicalChemistry。286(24):21806–21813。土井:10.1074 /jbc.M111.241513。PMC3122235 。_ PMID21511947 。_ ^ Burchett SA。「Gタンパク質シグナル伝達の調節因子:モジュラータンパク質結合ドメインの動物寓話」。J.Neurochem。75(4):1335–51。土井:10.1046 /j.1471-4159.2000.0751335.x。PMID10987813。_   ^ Wong HC、Mao J、Nguyen JT、Srinivas S、Zhang W、Liu B、Li L、Wu D、Zheng J。「Wntシグナル伝達経路における乱れたDEPドメインの認識の構造的基礎」。ナット 構造体。Biol。7(12):1178–84。土井:10.1038 / 82047。PMC4381838。_ PMID11101902。_   
には、パブリックドメインの
Pfamおよび
InterProからのテキストが組み込まれています:
IPR000591

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