DEPDC7
タンパク質7を含むDEPドメイン(DEPDC7 )は、 11番染色体の33,015,863-33,033,581塩基に位置する未知の機能のタンパク質です。細胞遺伝学的位置は11p13です。 DEPDC7にはいくつかのエイリアスがあります:7を含むDEPドメイン、DJ85M6.4、新規58.3 KDAタンパク質、タンパク質TR2 / D15、およびTR2。 DEPDC7遺伝子は17,718塩基対の長さで、8つのエクソンと9つのイントロンを持っています。この遺伝子は6つの異なるmRNA転写物を作ることができます。 この遺伝子の配列内には、DEP(Dishevelled、Egl-10、およびPleckstrin)ドメインとPleckstrinの2つの機能ドメインがRhoGAPドメイン。
青で強調表示されているDEPDC7遺伝子の位置。
コンテンツ 1 mRNA 2 タンパク質
3 DEPドメイン
4 パラログ
5 参考文献
mRNA
転写により、4つの選択的スプライシングバリアントと2つの非スプライシングフォームが生成されます。 アイソフォーム1は、8つのエクソンすべてを含むすべてのバリアントの中で最も長いものです。それは511アミノ酸をコードします。 ノーザンブロット分析により、ヒトのDEPDC7転写産物は肝臓で高度に発現し、腎臓で中程度に発現していることが検出されました。 DEPDC7イントロンの1つの低メチル化は、うつ病の症状の出現に関連していました。
タンパク質
タンパク質の構造
このタンパク質は511アミノ酸の長さで、分子量は58310です。 DEPDC7は腫瘍抑制に関与している可能性が過剰発現は、肝細胞癌細胞の増殖を阻害し、 G0 / G1期からS期への細胞周期の移行を阻止し、血腫細胞の移動と浸潤を阻害します。 DEPDC7は、神経の発達と生理学を潜在的に調節し、線条体ニューロンのエピジェネティックなプロセスに関与する可能性が 11p12および11p14内のゲノム再配列は、WAGR症候群と関連していた。
DEPドメイン
DEPドメインは、最初に見つかった3つのタンパク質、Disheveled、Egl-10、およびPleckstrinにちなんで名付けられました。 Disheveledは、Wg / Wntシグナルの伝達において重要な役割を果たします。この信号は細胞表面から核に行きます。 Disheveledは、胚の分極細胞とセグメントのコヒーレントアレイを作成するために必要なセグメント極性タンパク質です。それはまた翼のない信号伝達においても役割を果たします。Egl-10は中枢神経系のGタンパク質シグナル伝達を調節します。プレクストリンは、DEPドメインに隣接する2つのPHドメインを持ち、血小板のプロテインキナーゼCの主要な基質です。 DEPDC7内のDEPドメインは、CARMA2およびCARMA3タンパク質と結合することがわかりました。
パラログ
DEPDC7にはパラログがあります:DEPDC1B、タンパク質コーディング遺伝子。
参考文献
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