DfrA-dnaX_RNA_motif
dfrA – dnaX RNAモチーフは、バイオインフォマティクスによって発見された保存されたRNA構造です。 dfrA – dnaXモチーフはParvimonasに dfrA-dnaX dfrA-dnaXRNAの
コンセンサス
二次構造と配列保存 識別子
シンボルfrA-dnaX Rfam F02952
その他のデータ
RNAタイプ
遺伝子; sRNA
それで SO：0001263 PDB構造 PDBe dfrA – dnaXRNAがシス調節エレメントとして機能するかどうかはあいまいです。dfrA – dnaX RNAは、さまざまな非相同遺伝子の5 ‘非翻訳領域（UTR）にあるようです。5’UTRに対応する可能性が低い場所ではほとんどありません（<1％）。これらのデータは、シス調節因子としての役割を示唆しています。しかし、モチーフは完全に末端ループが非常に大きいヘアピンで構成されており、モチーフはよく保存されこの保存の欠如は、モチーフを持つ生物の範囲が狭いことを考えると驚くべきことです。したがって、モチーフがRhoに依存しない転写終結など、別のより一般的な役割を果たしている可能性があることが提案されました。
参考文献
^ Weinberg Z、LünseCE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR。「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による224の候補構造化RNAの検出」。Nucleic AcidsRes。45（18）：10811–10823。土井：10.1093 / nar / gkx699。PMC5737381 。_ PMID28977401 。_