C-type_lectin

C型レクチン(CLECは)炭水化物結合のタイプであるタンパク質ドメインとして知られているレクチン。 Cタイプの指定は、結合のためのカルシウムの要件に由来します。 C型レクチンドメインを含むタンパク質は、細胞間接着、病原体に対する免疫応答、アポトーシスなど、さまざまな機能を持っています。
レクチンC型ドメイン
ガラクトース結合性レクチンであるガラガラヘビ毒レクチンの五量体構造
識別子
シンボル
レクチン_C Pfam PF00059 InterPro IPR001304
スマート
CLECT PROSITE PS50041 SCOP2 2msb / SCOPe / SUPFAM CDD cd00037
メンブラノーム 52 利用可能なタンパク質構造:
Pfam  
構造/ ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
分類
Drickamer etal。各タンパク質のさまざまなタンパク質ドメインの順序に基づいて、C型レクチンを7つのサブグループ(IからVII)に分類しました。この分類はその後2002年に更新され、7つの追加グループ(VIIIからXIV)になりました。最近、さらに3つのサブグループが追加されました(XVからXVII)。
グループ
名前
関連するドメイン 私 レクティカン
EGF、寿司、Igおよびリンクドメイン II アシアロ糖タンパク質とDC受容体
無し III Collectins
無し IV セレクチン
寿司とEGFドメイン V NK-細胞受容体
無し VI マルチCTLDエンドサイトーシス受容体
FnIIおよびリシンドメイン VII 登録グループ
無し VIII コンドロ、Layilin
無し IX テトラネクチン
無しX
ポリシスチン
WSC、REJ、PKDドメイン XI アトラクチン(ATRN)
PSI、EGFおよびCUBドメイン XII 好酸球主要塩基性タンパク質(EMBP)
無し XIII DGCR2
無し XIV トロンボモジュリン、CD93、CD248、CLEC14A
EGFドメイン XV Bimlec
無し XVI SEEC
SCPおよびEGFドメイン XVII CBCP / Frem1 / QBRICK
CSPGリピートとCalX-betaドメイン
CLECには次のものが含まれます。 CLEC1A、CLEC1B CLEC2A、CLEC2B、CD69(CLEC2C)、CLEC2D、CLEC2L CLEC3A、CLEC3B CLEC4A、CLEC4C、CLEC4D、CLEC4E、CLEC4F、CLEC4G、ASGR1(CLEC4H1)、ASGR2(CLEC4H2)、FCER2(CLEC4J)、CD207(CLEC4K)、CD209(CLEC4L)、CLEC4M CLEC5A CLEC6A CLEC7A OLR1(CLEC8A) CLEC9A CLEC10A CLEC11A CLEC12A、CLEC12B
CD302(CLEC13A)、LY75(CLEC13B)、PLA2R1(CLEC13C)、MRC1(CLEC13D)、MRC2(CLEC13E) CLEC14A CLEC16A CLEC17A 「NK細胞レクチン様受容体」は非常に密接に関連したグループです: KLRA1 KLRB1(CLEC5B)
KLRC1、KLRC2、KLRC3、KLRC4 KLRD1 KLRF1(CLEC5C)
KLRG1(CLEC15A)、KLRG2(CLEC15B) KLRK1 このドメインを含む追加のタンパク質は次のとおりです。
AGC1 ; ATRNL1 BCAN CD248 ; CD72 ; CD93 ; CHODL ; CL-K1-Ia ; CL-K1-Ib ; CL-K1-Ic ; CLECSF5 ; COLEC10 ; COLEC11 ; COLEC12 ; CSPG3
FCER2 ; FREM1 ; HBXBP ;
LAYN ; LOC348174 ; LOC728276
MAFA ; MBL2 ; MGC34761 ; MICL ; MRC1L1 OLR1 PAP ; PKD1 ; PKD1L2 ; PLA2R1 ; PRG2 ; PRG3
REG1A ; REG1B ; REG3A ; REG3G ; REG4
SELE ; 販売; SELP ; SFTPA1 ; SFTPA2 ; SFTPA2B ; SFTPD ; SRCL THBD VCAN
参考文献
^ Walker JR、Nagar B、Young NM、Hirama T、Rini JM。「新規の十量体四次構造を有するガラクトース特異的C型レクチンのX線結晶構造」。生化学。43(13):3783–92。土井:10.1021 / bi035871a。PMID  15049685。 ^ Mahla RS、Reddy MC、Prasad DV、Kumar H。「SweetenPAMPs:自然免疫およびワクチン生物学における糖複合体化PAMPの役割」。免疫学のフロンティア。4:248 DOI:10.3389 / fimmu.2013.00248。PMC 3759294。PMID 24032031。    ^ a b Zelensky AN、Gready JE。「C型レクチン様ドメインスーパーファミリー」。FEBSJ。272(24):6179–217。土井:10.1111 /j.1742-4658.2005.05031.x。PMID 16336259。   ^ 米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のCタイプ+レクチン ^ Drickamer K(1999年10月)。「C型レクチン様ドメイン」。Curr。意見。構造体。Biol。9(5):585–90。土井:10.1016 / S0959-440X(99)00009-3。PMID 10508765。   ^ Cambi A、Figdor C。「壊死:C型レクチンは細胞死を感知する」。Curr。Biol。19(9):R375–8。土井:10.1016 /j.cub.2009.03.032。PMID 19439262。S2CID 17409821。    ^ Drickamer K(1993)。「Ca(2+)依存性動物レクチンの進化」。Prog。核酸解像度。モル。Biol。核酸研究と分子生物学の進歩。45:207–32。土井:10.1016 / S0079-6603(08)60870-3。ISBN  978-0-12-540045-9。PMID  8341801。 ^ Drickamer K、Fadden AJ(2002)。「C型レクチンのゲノム解析」。生化学。Soc。症状。69(69):59–72。土井:10.1042 / bss0690059。PMID 12655774。   ^ カーン、KA; マクマレー、JL; モハメッド、F。; ビックネル、R。(2019)。「血管生物学、癌および炎症におけるC型レクチンドメイングループ14タンパク質」。FEBSジャーナル。286(17):3299–3332。土井:10.1111 /febs.14985。PMC 6852297。PMID 31287944。    ^ 米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のNK +細胞+レクチン様+受容体
外部リンク
機能グライコミクスゲートウェイとの間のコラボレーション機能グライコミクスのためのコンソーシアムとネイチャー・パブリッシング・グループ

投稿日:
カテゴリー: C