D12-メチルRNAモチーフ

D12-methyl_RNA_motif
D12メチルRNAモチーフは、保存されたRNAた構造バイオインフォマティクスによって発見します。 D12-メチルモチーフはメタゲノム DNAサンプルに見られ、分類された生物にはまだ見られません。
D12-メチル
D12-メチルRNAの
コンセンサス
二次構造と
配列保存
識別子
シンボル
D12-メチル Rfam RF02950
その他のデータ
RNAタイプ
遺伝子; sRNA
そう SO:0001263 PDB構造 PDBe D12-メチルRNAがシス調節エレメントとして機能するのか、それともトランスで機能するのかはあいまいです。一方では、それらはさまざまなタイプのタンパク質をコードする遺伝子の上流に位置しています。この事実は、D12-メチルRNAがシスで機能することを示唆している可能性がただし、関連する遺伝子の多くは、プロファージにある遺伝子の典型です。ファージゲノムは少数の大きなオペロンで構成されることが多いため、D12-メチルRNAは長いファージ転写ユニットの遺伝的要素の1つにすぎない可能性が
参考文献
^ Weinberg Z、LünseCE、Corbino KA、Ames TD、Nelson JW、Roth A、Perkins KR、Sherlock ME、Breaker RR。「遺伝子間領域の特定のサブセットの比較分析による224の候補構造化RNAの検出」。Nucleic AcidsRes。45(18):10811–10823。土井:10.1093 / nar / gkx699。PMC  5737381。PMID  28977401。

投稿日:
カテゴリー: D