EDF1


EDF1
内皮分化関連因子1は、ヒトではEDF1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 EDF1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 1X57 識別子
エイリアス
EDF1、EDF-1、MBF1、CFAP280、内皮分化関連因子1
外部ID
OMIM:605107 MGI:1891227 HomoloGene:2809 GeneCards:EDF1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 9番染色体(ヒト)
バンド 9q34.3 始める
136,862,119 bp
終わり
136,866,308 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 2番染色体(マウス)
バンド
2 | 2 A3
始める
25,557,847 bp
終わり
25,562,082 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
膵臓
前立腺
下垂体前葉
脳下垂体
ブロードマンの脳地図9
甲状腺
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性
配列特異的DNA結合
DNA結合
GO:0001131、GO:0001151、GO:0001130、GO:0001204DNA結合転写因子活性
GO:0001105転写コアクチベーター活性
カルモジュリン結合
ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性
GO:0001948タンパク質結合
RNA結合
TFIIDクラスの転写因子複合体結合
細胞成分
細胞質
転写因子TFIID複合体
細胞内解剖学的構造
核小体
細胞外エクソソーム 核 サイトゾル
生物学的プロセス
細胞分化
転写の調節、DNAテンプレート
転写、DNAテンプレート
多細胞生物の発達
転写の正の調節、DNAテンプレート
脂質代謝過程の調節
内皮細胞の分化
DNA結合の正の調節
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez8721 59022 Ensembl ENSG00000107223 ENSMUSG00000015092 UniProt O60869 Q9JMG1
RefSeq(mRNA)
NM_153200 NM_001281297 NM_001281298 NM_001281299 NM_003792 NM_021519 RefSeq(タンパク質)
NP_001268226 NP_001268227 NP_001268228 NP_003783 NP_694880 NP_067494 場所(UCSC)
Chr 9:136.86 – 136.87 Mb
Chr 2:25.56 – 25.56 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

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コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献

関数
この遺伝子は、内皮細胞の分化を調節する可能性のあるタンパク質をコードしています。このタンパク質は、調節タンパク質と基本的な転写機構を相互接続する架橋分子として機能し、それによって内皮分化に関与する遺伝子の転写を調節すると仮定されています。このタンパク質は、一般的な転写因子TATAエレメント結合タンパク質(TBP)と遺伝子特異的活性化因子を相互接続することにより、転写コアクチベーターとして機能することもわかっています。この遺伝子には、異なるタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写産物が見つかっています。

相互作用
EDF1は以下と相互作用することが示されています:
肝臓X受容体アルファ、
ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマ、および
TATA結合タンパク質。

参考文献
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参考文献
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