Effective_number_of_codons
有効なコドン数（ ENCまたはNcと略記）は、遺伝子およびゲノムにおけるコドン使用バイアスの状態を研究するための尺度です。 ENCの計算方法は、集団遺伝学における有効個体数の計算と明らかに類似しています。 ENC値の計算は簡単ですが、この測定値は、コドン使用バイアスを示すための最良の測定値の1つであることが示されています。
ENCの最初の提案以来、何人かの研究者がこの方法を改善しようと試みましたが 、この対策を改善する余地はたくさんあるようです。
参考文献
^ ライトF.（1990）。「遺伝子で使用される「有効なコドン数」。遺伝子。87（1）：23–29。土井：10.1016 / 0378-1119（90）90491-9。PMID2110097 。_ ^ 木村、M。＆クロウ、JF（1964）。「有限の母集団で維持できる対立遺伝子の数」。遺伝学。49（4）：725–738。土井：10.1093 /遺伝学/49.4.725。PMC1210609。_ PMID14156929。_ ^ コメロンJM、アグアデM（1998）。「同義のコドン使用バイアスの測定の評価」。J.Mol。Evol。47（3）：268–274。Bibcode：1998JMolE..47..268C。土井：10.1007 / PL00006384。PMID9732453。_ S2CID21862217。_ ^ Novembre JA（2002）。「コドン使用バイアスを測定する際のバックグラウンドヌクレオチド組成の説明」。モル。Biol。Evol。19（8）：1390–1394。土井：10.1093 /oxfordjournals.molbev.a004201。PMID12140252。_ ^ Fuglsang A.（2004）。「「有効なコドン数」の再検討」。生化学。生物物理学。解像度 コミュン。317（3）：957–964。土井：10.1016 /j.bbrc.2004.03.138。PMID15081433。_ ^ マラシSA; ナジャファバディHS（2004）。「再調整の信頼性：A。Fuglsangに関する通信、「「有効なコドン数」の再検討」 ” 。Biochem。Biophys。Res。Commun。324 （ 1 ）：1–2。doi：10.1016 / j.bbrc.2004.08.213。PMID15464973。 ^ Fuglsang A.（2005）。「 『有効なコドン数』の方法論的弱点について：マラシとナジャファバディへの回答」。生化学。生物物理学。解像度 コミュン。327（1）：1–3。土井：10.1016 /j.bbrc.2004.11.133。PMID15629420。_ ^ Banerjee T。; グプタSK; Ghosh TC（2005）。「「遺伝子によって使用される有効なコドン数」の固有の方法論的弱点の解決に向けて ” 。Biochem。Biophys。Res。Commun。330 （ 4 ）：1015–8。doi：10.1016 / j.bbrc.2005.02.150。PMID15823544。 ^ Fuglsang A.（2006）。「「有効なコドン数」の推定：コドンホモ接合性を決定するライトな方法は、優れた推定につながります」。遺伝学。172（2）：1301–7。土井：10.1534 /genetics.105.049643。PMC1456227。_ PMID16299393。_ ^ Fuglsang A.（2006）。「コドン使用バイアスを測定する際のバックグラウンドヌクレオチド組成の説明：素晴らしいアイデア、実際には難しい」。モル。Biol。Evol。23（7）：1345–7。土井：10.1093 / molbev / msl009。PMID16679346。_ ^ Fuglsang A.（2008）。「遺伝子で使用されるコドンの有効数の推定に対するバイアスの不一致とアミノ酸使用の影響、およびコドン使用の選択のためのテスト」。遺伝子。410（1）：82–8。土井：10.1016 /j.gene.2007.12.001。PMID18248919。_
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