GATM_(gene)
グリシンアミジノトランスフェラーゼ、ミトコンドリアは、ヒトではGATM遺伝子によってコードされる酵素です。 GATM 利用可能な構造 PDB オーソログ検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
1JDW、1JDX、2JDW、2JDX、3JDW、4JDW、5JDW、6JDW、7JDW、8JDW、9JDW
識別子
エイリアス
GATM、AGAT、AT、CCDS3、グリシンアミジノトランスフェラーゼ、FRTS1
外部ID
OMIM:602360 MGI:1914342 HomoloGene:1136 GeneCards:GATM
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 15番染色体(ヒト)
バンド 15q21.1 始める
45,361,124 bp
終わり
45,402,327 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 2番染色体(マウス)
バンド
2 E5 | 2 60.63 cM
始める
122,424,948 bp
終わり
122,441,784 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
尿細管
腎皮質 肝臓 膵臓
十二指腸
膵臓の体
肝臓
肝臓の右葉
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
トランスフェラーゼ活性
グリシンアミジノトランスフェラーゼ活性
アミジノトランスフェラーゼ活性
細胞成分 膜 細胞質
ミトコンドリア内膜
細胞外エクソソーム
ミトコンドリア膜間腔
ミトコンドリア
生物学的プロセス
クレアチン生合成プロセス
クレアチン代謝プロセス
多細胞生物の発達
学習または記憶
筋萎縮
寒冷誘発熱発生の正の調節
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez2628 67092 Ensembl ENSG00000171766 ENSMUSG00000027199 UniProt P50440 Q9D964
RefSeq(mRNA)NM_001482 NM_001321015 NM_025961
RefSeq(タンパク質)NP_001307944 NP_001473 NP_080237
場所(UCSC)
15番染色体:45.36 – 45.4 Mb
Chr 2:122.42 – 122.44 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
この遺伝子は、アミジノトランスフェラーゼファミリーに属するミトコンドリア酵素をコードしています。この酵素はクレアチン 生合成に関与しており、 L-アルギニンからグリシンへのグアニド基の転移を触媒し、クレアチンの直接の前駆体であるグアニジノ酢酸を生成します。この遺伝子の変異は、アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼ欠損症、精神遅滞、言語障害、行動障害を特徴とするクレアチン合成の先天性エラーを引き起こします。
参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000171766 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000027199 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Humm A、Huber R、Mann K(1994年3月)。「ヒトおよびブタのL-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼのアミノ酸配列」。FEBSLett。339(1–2):101–7。土井:10.1016 / 0014-5793(94)80394-3。PMID8313955。_ ^ “Entrez Gene:GATMグリシンアミジノトランスフェラーゼ(L-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼ)”。
参考文献
Humm A、Fritsche E、Steinbacher S(1997)。「L-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼの構造と反応機構」。Biol。化学。378(3–4):193–7。土井:10.1515/bchm.1997.378.3-4.121。PMID9165070 。_
Schulze A(2003)。「クレアチン欠乏症候群」。モル。細胞。生化学。244(1–2):143–50。土井:10.1023 / A:1022443503883。PMID12701824 。_ S2CID25056424 。_
Gross MD、Eggen MA、Simon AM、Van Pilsum JF(1987)。「ヒト腎臓L-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼの精製と特性評価」。アーチ。生化学。生物物理学。251(2):747–55。土井:10.1016 / 0003-9861(86)90385-1。PMID3800397 。_
丸山K、菅野S(1994)。「オリゴキャッピング:真核生物のmRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドに置き換える簡単な方法」。遺伝子。138(1–2):171–4。土井:10.1016 / 0378-1119(94)90802-8。PMID8125298 。_
うーんA; Fritsche E; マンK; etal。(1997)。「ヒトL-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼの組換え発現および単離、ならびにその活性部位システイン残基の同定」。生化学。J。 _ 322(3):771–6。土井:10.1042/bj3220771。PMC1218254 。_ PMID9148748 。_
Humm A、Fritsche E、Steinbacher S、Huber R(1997)。「ヒトL-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼの結晶構造とメカニズム:クレアチン生合成に関与するミトコンドリア酵素」。EMBOJ。16(12):3373–85。土井:10.1093 / emboj/16.12.3373。PMC1169963 。_ PMID9218780 。_
Fritsche E、Humm A、Huber R(1997)。「L-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼによる基質結合と触媒作用-突然変異誘発と結晶学的研究」。ユーロ。J.Biochem。247(2):483–90。土井:10.1111/j.1432-1033.1997.00483.x。PMID9266688 。_
鈴木Y; よしろと-中川K; 丸山K; etal。(1997)。「全長濃縮および5’末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」。遺伝子。200(1–2):149–56。土井:10.1016 / S0378-1119(97)00411-3。PMID9373149 。_
Fritsche E、Humm A、Huber R(1999)。「ヒトL-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼのリガンド誘導性構造変化。突然変異および結晶学的研究」。J.Biol。化学。274(5):3026–32。土井:10.1074/jbc.274.5.3026。PMID9915841 。_
アイテムCB; Stöckler-IpsirogluS; ストロンバーガーC; etal。(2001)。「アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼ欠損症:ヒトにおけるクレアチン代謝の3番目の先天性エラー」。午前。J.ハム。Genet。69(5):1127–33。土井:10.1086/323765。PMC1274356 。_ PMID11555793 。_
カルドゥッチC; ビラレッリM; Leuzzi V; etal。(2002)。「生理液中のグアニジノアセテートおよびクレアチンとクレアチニンの評価:アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼおよびグアニジノアセテートメチルトランスフェラーゼ欠損症の生化学的診断のための効果的な診断ツール」。クリン。化学。48(10):1772–8。土井:10.1093 / clinchem/48.10.1772。PMID12324495 。_
バティーニR; Leuzzi V; カルドゥッチC; etal。(2003)。「AGAT欠損症の新しい症例におけるクレアチン枯渇:大血統における臨床的および遺伝的研究」。モル。ジェネット。Metab。77(4):326–31。土井:10.1016 / S1096-7192(02)00175-0。PMID12468279 。_
Strausberg RL; Feingold EA; ライチョウLH; etal。(2003)。「15,000を超える完全長のヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99(26):16899–903。土井:10.1073/pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
Verhoeven NM; Schor DS; Roos B; etal。(2003)。「安定同位体標識基質を使用してL-アルギニン:グリシンアミジノトランスフェラーゼ欠損症を検出する診断酵素アッセイ」。クリン。化学。49(5):803–5。土井:10.1373/49.5.803。PMID12709373 。_
太田T; 鈴木Y; 西川T; etal。(2004)。「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全な配列決定と特性評価」。ナット Genet。36(1):40–5。土井:10.1038/ng1285。PMID14702039 。_
Gerhard DS; ワーグナーL; Feingold EA; etal。(2004)。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」。GenomeRes。14(10B):2121–7。土井:10.1101/gr.2596504。PMC528928 。_ PMID15489334 。_
AlessandrìMG; セラティL; バティーニR; etal。(2005)。「アルギニンのガスクロマトグラフィー/質量分析アッセイ:グリシン-アミジノトランスフェラーゼ欠損症」。肛門。生化学。343(2):356–8。土井:10.1016/j.ab.2005.05.003。PMID15978539 。_
外部リンク
クレアチン欠乏症候群に関するGeneReviews/NCBI / NIH/UWエントリ
ヒト15番染色体上の遺伝子に関するこ”