GBP1
インターフェロン誘導グアニル酸結合タンパク質1は、ヒトではGBP1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 それは大きなGTPアーゼのダイナミンスーパーファミリーに属しています。
1ポンド
利用可能な構造 PDB 人間のUniProt検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
1DG3、1F5N、2B8W、2B92、2BC9、2D4H _ _ _ _ _ _
識別子
エイリアス
GBP1、グアニル酸結合タンパク質1
外部ID
OMIM:600411 HomoloGene:133759 GeneCards:GBP1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 1番染色体(ヒト)
バンド 1p22.2 始める
89,051,882 bp
終わり
89,065,360 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現甲状腺 心膜 血液
三叉神経節 頸部 付録
子宮筋層
肺の上葉
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
ヌクレオチド結合
Hsp90タンパク質の結合
スペクトリンバインディング
GO:0001948タンパク質結合
同一のタンパク質結合
酵素結合
アクチン結合
加水分解酵素活性
サイトカイン結合
GO:0006184GTPase活性
GTPバインディング
GDPバインディング
タンパク質ホモ二量体化活性
細胞成分
サイトゾル 膜 ゴルジ膜
原形質膜
細胞外領域
細胞質
ゴルジ体
小胞膜
アクチン細胞骨格
GO:0016023細胞質小胞
生物学的プロセス
免疫システムプロセス
インターフェロンガンマを介したシグナル伝達経路
T細胞受容体シグナル伝達経路の負の調節
原形質膜へのタンパク質局在の負の調節
ウイルスに対する防御反応
カルシウムを介したシグナル伝達の調節
ERK1およびERK2カスケードの負の調節
基質接着依存性細胞拡散の負の調節
原形質膜へのタンパク質局在の調節
タンパク質のホモオリゴマー化
インターフェロンガンマに対する細胞応答
インターロイキン-1に対する細胞応答
腫瘍壊死因子に対する細胞応答
液胞へのタンパク質の局在
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez 2633
該当なしEnsembl ENSG00000117228
該当なしUniProt P32455
該当なし
RefSeq(mRNA) NM_002053 該当なし
RefSeq(タンパク質) NP_002044 該当なし
場所(UCSC)
Chr 1:89.05 – 89.07 Mb
該当なし
PubMed検索
該当なし
ウィキデータ
人間の表示/編集
関数
グアニル酸結合タンパク質の発現は、インターフェロンによって誘導されます。グアニレート結合タンパク質は、グアニンヌクレオチド(GMP、GDP、およびGTP)に特異的に結合する能力を特徴とし、3つではなく2つの結合モチーフの存在によってGTP結合タンパク質と区別されます。
参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000117228 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Strehlow I、Lohmann-Matthes ML、Decker T(1994年8月)。「インターフェロン誘導性GBP1遺伝子:構造とヒト1番染色体へのマッピング」。遺伝子。144(2):295–9。土井:10.1016 / 0378-1119(94)90393-X。PMID7518790。_ ^ “Entrez Gene:GBP1グアニル酸結合タンパク質1、インターフェロン誘導性、67kDa”。
^ Praefcke GJ、McMahon HT。「ダイナミンスーパーファミリー:普遍的な膜細管と分裂分子?」ナット モル牧師 CellBiol。5(2):133–47。土井:10.1038/nrm1313。PMID15040446。_ S2CID6305282。_
参考文献
アンダーソンNL、アンダーソンNG(2003)。「ヒト血漿プロテオーム:歴史、性格、および診断の見通し」。モル。細胞。プロテオミクス。1(11):845–67。土井:10.1074/mcp.R200007-MCP200。PMID12488461 。_
Naschberger E、Bauer M、StürzlM(2006)。「ヒトグアニル酸結合タンパク質-1(hGBP-1)は、炎症性疾患における非血管新生内皮細胞活性化表現型を特徴づけ、確立します」。Adv。酵素レグル。45:215–27。土井:10.1016/j.advenzreg.2005.02.011。PMID16005050 。_
Cheng YS、Patterson CE、Staeheli P(1991)。「インターフェロン誘導グアノシン酸結合タンパク質は、N(T)KXDコンセンサスモチーフを欠き、GDPおよびGTPに加えてGMPに結合します」。モル。細胞。Biol。11(9):4717–25。土井:10.1128/MCB.11.9.4717。PMC361367 。_ PMID1715024 。_
Nantais DE、Schwemmle M、Stickney JT、他。(1996)。「インターフェロンガンマ誘導GTP結合タンパク質のプレニル化:ヒトグアニル酸結合タンパク質、huGBP1」。J.ロイコック。Biol。60(3):423–31。土井:10.1002/jlb.60.3.423。PMID8830800 。_ S2CID33727864 。_
Saunders NA、Smith RJ、Jetten AM(1999)。「インターフェロンガンマ処理されたヒト表皮ケラチノサイトおよび扁平上皮癌細胞におけるグアニル酸結合タンパク質発現の調節」。J.インベスト。ダーマトール。112(6):977–83。土井:10.1046/j.1523-1747.1999.00611.x。PMID10383748 。_
Prakash B、Praefcke GJ、Renault L、他 (2000)。「GTP結合タンパク質のユニークなクラスを表すヒトグアノシン酸結合タンパク質1の構造」。自然。403(6769):567–71。Bibcode:2000Natur.403..567P。土井:10.1038/35000617。PMID10676968 。_ S2CID4431592 。_
Kumar S、Li Q、Dua A、他 (2001)。「インターフェロン誘導性グアニル酸結合タンパク質1をコードするメッセンジャーリボ核酸は、着床の推定ウィンドウ内でヒト子宮内膜に誘導されます」。J.Clin。エンドクリノール。Metab。86(6):2420–7。土井:10.1210/jc.86.6.2420。PMID11397834 。_
Guenzi E、TöpoltK、Cornali E、他 (2001)。「GBP-1のヘリカルドメインは、炎症性サイトカインによる内皮細胞増殖の阻害を仲介します」。EMBOJ。20(20):5568–77。土井:10.1093 / emboj/20.20.5568。PMC125279 。_ PMID11598000 。_
Lubeseder-Martellato C、Guenzi E、JörgA、etal。(2002)。「グアニル酸結合タンパク質-1の発現は炎症性サイトカインによって選択的に誘導され、炎症性疾患中の内皮細胞の活性化マーカーです」。午前。J.Pathol。161(5):1749–59。土井:10.1016 / S0002-9440(10)64452-5。PMC1850787 。_ PMID12414522 。_
Strausberg RL、Feingold EA、GrouseLHなど。(2003)。「15,000を超える完全長のヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期分析」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。99(26):16899–903。土井:10.1073/pnas.242603899。PMC139241 。_ PMID12477932 。_
Adkins JN、Varnum SM、AuberryKJなど。(2003)。「ヒト血清プロテオームに向けて:質量分析と組み合わせた多次元分離による分析」。モル。細胞。プロテオミクス。1(12):947–55。土井:10.1074/mcp.M200066-MCP200。PMID12543931 。_
Guenzi E、TöpoltK、Lubeseder-Martellato C、他 (2003)。「グアニル酸結合タンパク質-1GTPaseは、MMP-1発現の阻害を通じて内皮細胞の浸潤性および血管新生能を制御します」。EMBOJ。22(15):3772–82。土井:10.1093 / emboj/cdg382。PMC169055 。_ PMID12881412 。_
Naschberger E、Werner T、Vicente AB、他。(2004)。「核因子-κBモチーフとインターフェロン-アルファ刺激応答エレメントは、内皮細胞の炎症性サイトカインによるグアニル酸結合タンパク質-1発現の活性化に協力します」。生化学。J。 _ 379(Pt 2):409–20。土井:10.1042/BJ20031873。PMC1224089 。_ PMID14741045 。_
Gerhard DS、Wagner L、FeingoldEAなど。(2004)。「NIH完全長cDNAプロジェクトの状況、品質、および拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」。GenomeRes。14(10B):2121–7。土井:10.1101/gr.2596504。PMC528928 。_ PMID15489334 。_
Praefcke GJ、Kloep S、Benscheid U、他。(2004)。「ヌクレオチド結合および協調的GTP加水分解に重要なヒトグアノシン酸結合タンパク質1の残基の同定」。J.Mol。Biol。344(1):257–69。土井:10.1016/j.jmb.2004.09.026。PMID15504415 。_
Modiano N、Lu YE、Cresswell P(2005)。「ヒトグアニル酸結合タンパク質-1のゴルジターゲティングには、ヌクレオチド結合、イソプレニル化、およびIFN-γ誘導性補因子が必要です」。Proc。国立 Acad。科学 アメリカ。102(24):8680–5。Bibcode:2005PNAS..102.8680M。土井:10.1073/pnas.0503227102。PMC1150846 。_ PMID15937107 。_
Ghosh A、Praefcke GJ、Renault L、他 (2006)。「グアノシン酸結合タンパク質がGTPからGMPへの集合刺激による連続的切断をどのように達成するか」。自然。440(7080):101–4。Bibcode:2006Natur.440..101G。土井:10.1038/nature04510。PMID16511497 。_ S2CID4405773 。_
人間の1番染色体上の遺伝子に関するこ”