GCM1
絨毛膜特異的転写因子GCMaは、ヒトではGCM1遺伝子によってコードされるタンパク質です。 GCM1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト 1ODH 識別子
エイリアス
GCM1、GCMA、hGCMa、ホモログ1が欠落しているグリア細胞、転写因子1が欠落しているグリア細胞
外部ID
OMIM:603715 MGI:108045 HomoloGene:2702 GeneCards:GCM1
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 6番染色体(ヒト)
バンド 6p12.1 始める
53,126,961 bp
終わり
53,148,841 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 9番染色体(マウス)
バンド
9 E1 | 9 43.49 cM
始める
77,959,206 bp
終わり
77,972,906 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
肝臓 血液 副腎
ランゲルハンス島
子宮筋層 腎皮質 尿細管
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
DNA結合
GO:0001131、GO:0001151、GO:0001130、GO:0001204DNA結合転写因子活性
亜鉛イオン結合
GO:00001077、GO:0001212、GO:0001213、GO:0001211、GO:0001205 DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
転写因子の結合
ヒストンデアセチラーゼ結合
金属イオン結合
GO:0000980RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
GO:0001948タンパク質結合
GO:0001200、GO:0001133、GO:0001201 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分
転写調節因子複合体 核 生物学的プロセス
転写の調節、DNAテンプレート
解剖学的構造の形態形成
原形質膜融合によるシンシチウム形成の正の調節
RNAポリメラーゼIIによる転写
転写、DNAテンプレート
多細胞生物の発達
迷路層の形態形成に関与する分岐
星状細胞の運命のコミットメント
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節
神経膠形成
胚性胎盤の発達に関与する細胞分化の調節
胚性胎盤の発達に関与する細胞分化
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez8521 14531 Ensembl ENSG00000137270 ENSMUSG00000023333 UniProt Q9NP62 P70348
RefSeq(mRNA)NM_003643 NM_008103
RefSeq(タンパク質)NP_003634 NP_032129
場所(UCSC)
Chr 6:53.13 – 53.15 Mb
Chr 9:77.96 – 77.97 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/
この遺伝子は、gcmモチーフ(グリア細胞欠損モチーフ)を持つDNA結合タンパク質をコードしています。コードされたタンパク質は、ショウジョウバエのグリア細胞に遺伝子がない(gcm)ホモログです。このタンパク質は、GCMモチーフ(A / G)CCCGCATに結合します。これは、DNA結合タンパク質の既知のターゲットの中で新しい配列です。N末端のDNA結合ドメインは、このタンパク質のユニークなDNA結合活性をもたらします。
参考文献
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人間の第6染色体上の遺伝子に関するこ”