GCM_transcription_factors
分子生物学では、GCM転写因子はGCMモチーフを含むタンパク質ファミリーです。GCMモチーフは、キイロショウジョウバエGCMとその哺乳類の相同体（ヒトGCM1およびGCM2 ）を含む基本的な発達過程に関与する転写調節因子のファミリーに属するタンパク質で同定されたドメインです。 GCM転写因子では、N末端部分にDNAが含まれています-150アミノ酸の結合ドメイン。配列保存はこのGCMドメインで最も高くなります。対照的に、C末端部分は1つまたは2つのトランス活性化領域を含み、保存が不十分です。 GCM DNAにバインドされたgcmドメインの構造
識別子
シンボルCM Pfam F03615
Pfam氏族L0274 InterPro PR003902 PROSITE S50807 SCOP2
1odh / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造：
Pfam
構造/ ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要
GCMモチーフは、非パリンドローム八量体5′-ATGCGGGT-3’を優先的に認識するDNA結合ドメインであることが示されています。 GCMモチーフには、多くの保存された塩基性アミノ酸残基、7つのシステイン残基、および4つのヒスチジン残基が含まれています。保存されたシステインは、ドメインの全体的なコンフォメーションの形成、DNA結合のプロセス、およびDNA結合の酸化還元調節に関与しています。他のDNA結合ドメインとの類似性のない新しいクラスのZn含有DNA結合ドメインとしてのGCMドメイン。 GCMドメインは、構造内に存在する2つのZnイオンの1つによってつながれた大小のドメインで構成されています。大きいドメインと小さいドメインは、それぞれ5本鎖と3本鎖のベータシートで構成され、2つのベータシートの同じ側に3つの小さならせんセグメントが詰め込まれています。GCMドメインは、5本鎖のベータプリーツシートがDNAの主溝に挿入される、配列特異的なDNA認識の新しいモードを実行します。ベータプリーツシートのエッジストランドから突き出た残基とそれに続くループとストランドは、両方のDNAストランドの塩基とバックボーンに接触し、そのDNA標的部位に特異性を提供します。
参考文献
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には、パブリックドメインの Pfamと InterProからのテキストが組み込まれています：
IPR003902