GDB_Human_Genome_Database
GDB Human Genome Databaseは、コミュニティが厳選したヒトゲノムデータのコレクションでした。これは、ヒトゲノムプロジェクト の主要なデータベースであり、1989年から2008年まで使用されていました。
GDBヒトゲノムデータベース
コンテンツ
キャプチャされたデータ型
遺伝地図データ
生物
ホモサピエンス
連絡先
研究センター
ハワードヒューズ医学研究所
ジョンズホプキンス大学医学部
一次引用
PMID 2041809
発売日
1989年
歴史
1989年、ハワードヒューズ医学研究所は、人間の遺伝地図データの中央リポジトリを確立するための資金を提供しました。このプロジェクトにより、最終的に1990年9月にGDBヒトゲノムデータベースが作成されました。 高度な品質を確保するために、GDB内のレコードは、HUGOを含むヒト遺伝学の専門家によるキュレーションプロセスを受けました。遺伝子命名委員会。
PeterPearsonとDickLucierのリーダーシップの下で設立された GDBは、米国エネルギー省と国立衛生研究所から財政的支援を受けました。ジョンズホプキンス大学医学部にあるGDBは、オンラインと多数の印刷物の両方で利用できる高品質のマッピングデータのソースになりました。このプロジェクトは、EU、日本、その他の国々から国際的に支援されました。
GDBには当時数人のディレクターがいました。Peter Pearson、David T. Kingsbury、Stantley Letovsky、Peter Li、およびA.JamieCuticchia。
1998年、ヒトゲノムプロジェクトの焦点が変わったことで、以前はGDBで利用可能だった米国エネルギー省の資金がリダイレクトされました。しかし、その同じ年、A。Jamie Cuticchiaは、GDBの運用を継続するために、カナダの公的および私的情報源から資金を調達しました。ジョンズホプキンスでデータキュレーションが引き続き実行されている間、GDBの中央業務はカナダのオンタリオ州トロントにあるThe Hospital for Sick Children(HSC)に移されました。 2001年11月、GDB Webサイトのドメイン名をめぐる論争により、HSCはCuticchiaを解雇しました。
2003年、 RTI InternationalはGDBの新しいホストとなり、パブリックリソースとして維持され続けました。プロジェクトの管理がジョンズホプキンスに戻った後、GDBは2008年に閉鎖されました。
参考文献
^ 「ヒトゲノムニュース、1995年9月から12月:7(3-4):15」。web.ornl.gov。
^ ガイアー、MS; コリンズ、FS(1995年11月21日)。「ヒトゲノムプロジェクトはどのように進んでいますか、そして私たちはこれまでに何を学びましたか?」。国立科学アカデミーの議事録。92(24):10841–10848。Bibcode:1995PNAS…9210841G。土井:10.1073/pnas.92.24.10841。PMC40527。_ PMID7479895。_ ^ Cuticchia、A.Jamie; ファスマン、ケネスH .; キングズベリー、デビッドT .; ロビンズ、ロバートJ .; ピアソン、ピーターL.(1993)。「GDBTMヒトゲノムデータベースanno1993」。核酸研究。21(13):3003〜3006。土井:10.1093 / nar/21.13.3003。PMC309725。_ PMID8332522。_ ^ Cuticchia、AJ(1999年12月27日)。「GDBヒトゲノムデータベースの将来のビジョン」。人間の突然変異。15(1):62–67。土井:10.1002 /(SICI)1098-1004(200001)15:1 3.0.CO;2-R。PMID10612824。_ ^ Letovsky、S.(1998年1月1日)。「GDB:ヒトゲノムデータベース」。核酸研究。26(1):94–99。土井:10.1093 / nar/26.1.94。PMC147203。_ PMID9399808。_ ^ ピアソン、PL(1991年4月25日)。「ゲノムデータベース(GDB)-人間の遺伝子マッピングリポジトリ」。核酸研究。19(suppl):2237–2239。土井:10.1093 / nar/19.suppl.2237。PMC331357。_ PMID2041809。_ ^ Bonetta、Laura。「解任は遺伝子データベースを困惑させる」。自然。414(6862) : 384。Bibcode:2001Natur.414..384B。土井:10.1038/35106703。PMID11719765。_ ^ 「ヒトゲノムニュースVol.10、No.1-2、1999年2月」。web.ornl.gov 。
^ Seewald、AK(2004)。「BioMinTのランキング:パフォーマンス、ローカル検索、同音異義語認識の調査」。ライフサイエンス情報学における知識探索に関するシンポジウムの議事録(KELSI 2004)。CiteSeerX10.1.1.117.8840。_ 土井:10.1007/978-3-540-30478-4_10。 ^ ガルペリン、MY; コクラン、GR(2009年1月1日)。「2009年の核酸研究年次データベース問題とNARオンライン分子生物学データベースコレクション」。核酸研究。37(データベース):D1–D4。土井:10.1093 / nar/gkn942。PMC2686608。_ PMID19033364。_
外部リンク
https://web.archive.org/web/199 70605132915/http: //www.gdb.org/アーカイブバージョンのGDBWebサイト(1997)