GDP-mannose_3，5-epimerase
酵素学では、GDP-マンノース3，5-エピメラーゼ（EC 5.1.3.18）は化学反応を触媒する酵素です
GDP-マンノース3，5-エピメラーゼ
識別子
EC番号
5.1.3.18
CAS番号
72162-82-4
データベース IntEnz IntEnzビュー
ブレンダ
BRENDAエントリー ExPASy NiceZymeビュー KEGG KEGGエントリー MetaCyc 代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
AmiGO / QuickGO索 PMC
記事 PubMed 記事 NCBI タンパク質
GDP-マンノース ⇌ { rightleftharpoons}
GDP-L-ガラクトース+GDP-L-グロース-初期反応の概要（2020年に更新、以下を参照）
したがって、この酵素は1つの基質、GDP-マンノース、および2つの生成物、GDP-L-ガラクトースとGDP-L-グロースを持っています。
反応混合物中にはGDP-L-グロース（GDP-D-マンノースのC5-エピマー）のみが検出されたため、酵素はC3-エピマー化の前にC5-エピマー化を行うと仮定されました。ただし、GDP-D-アルトロースが反応生成物として最近発見されました。これは、C5-prior-to-C3とC3-prior-to-C5の両方の反応経路が発生する可能性があることを意味します。これはまた、GDP-マンノース3，5-エピメラーゼが3つの反応生成物、すなわち主生成物GDP-L-ガラクトース（C3，5-エピマー）と2つの副生成物GDP-L-グロース（C5-エピマー）+ GDP-を持っていることを意味しますD-アルトロース（C3-エピマー）。
GDP-D-マンノース ⇌ { rightleftharpoons}
GDP-L-ガラクトース（C3，5-エピマー）+ GDP-L-グロース（C5-エピマー）+ GDP-D-アルトロース（C3-エピマー）-2020年の反応概要の更新
この酵素は、イソメラーゼのファミリー、特に炭水化物と誘導体に作用するラセマーゼとエピメラーゼに属しています。この酵素クラスの体系的な名前はGDP-マンノース3，5-エピメラーゼです。一般的に使用されている他の名前には、GDP-D-マンノース：GDP-L-ガラクトースエピメラーゼ、グアノシン5′-二リン酸D-マンノース：グアノシン5′-二リン酸、およびL-ガラクトースエピメラーゼが含まれます。この酵素は、アスコルビン酸とアルダレートの代謝に関与しています。
構造研究
2007年後半の時点で、このクラスの酵素について4つの構造が解決されており、PDBアクセッションコードは2C54、2C59、2C5A、および2C5Eです。
参考文献
バーバーGA、ペンシルベニア州ヘブダ（1982）。「GDP-D-マンノース：クロレラピレノイドサからのGDP-L-ガラクトースエピメラーゼ」。メソッドEnzymol。酵素学の方法。83：522–5。土井：10.1016 / 0076-6879（82）83046-2。ISBN 978-0-12-181983-5。PMID7098948 。_
ペンシルベニア州ヘブダ、ペンシルベニア州ベールマンEJ、バーバーGA（1979）「グアノシン5′-二リン酸D-マンノース：クロレラピレノイドサのグアノシン5′-二リン酸L-ガラクトースエピメラーゼ。グアノシン5′-二リン酸L-ガラクトースの化学合成および酵素とそれが触媒する反応のさらなる研究」。アーチ。生化学。生物物理学。194（2）：496–502。土井：10.1016 / 0003-9861（79）90644-1。PMID443816 。_
Gevaert O、Van Overtveldt S、Beerens K、Desmet T（2019）。「最初の細菌および熱安定性GDP-マンノース3，5-エピメラーゼの特性評価」。Int。J.Mol。科学。20（14）：E3530。土井：10.3390/ijms20143530。PMC6678494 。_ PMID31330931 。_
Gevaert O、Van Overtveldt S、Da Costa M、Beerens K、Desmet T（2020）。「GDP-マンノース3，5-エピメラーゼの新規生成物としてのGDP-アルトロース：その反応機構の再考」。Int JBiolMacromol。165（Pt B）：1862–1868。土井：10.1016/j.ijbiomac.2020.10.067。PMID33075338 。_
ポータル：
生物学
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