GDP-mannose_4，6-dehydratase
酵素学では、GDP-マンノース4，6-デヒドラターゼ（EC 4.2.1.47）は化学反応を触媒する酵素です
GDP-マンノース4，6-デヒドラターゼ
識別子
EC番号
4.2.1.47
CAS番号
37211-59-9
データベース IntEnz IntEnzビュー
ブレンダ
BRENDAエントリー ExPASy NiceZymeビュー KEGG KEGGエントリー MetaCyc 代謝経路
プリアモス
プロフィール
PDB構造
RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー
AmiGO / QuickGO索 PMC
記事 PubMed 記事 NCBI タンパク質
GDP-マンノース ⇌ { rightleftharpoons}
GDP-4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノース+ H2 O したがって、この酵素は1つの基質であるGDP-マンノースと、2つの生成物であるGDP – 4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノースとH2Oを持っています。
この酵素は、炭素-酸素結合を切断するリアーゼ、特にヒドロリアーゼのファミリーに属しています。この酵素クラスの体系的な名前は、 GDP-マンノース4，6-ヒドロリアーゼ（GDP-4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノース形成）です。一般的に使用される他の名前には、グアノシン5′-二リン酸-D-マンノースオキシドレダクターゼ、グアノシンジホスホマンノースオキシドレダクターゼ、グアノシンジホスホマンノース4，6-デヒドラターゼ、 GDP-D-マンノースデヒドラターゼ、GDP-D-マンノース4，6-デヒドラターゼ、Gmd、およびが含まれます。 GDP-マンノース4，6-ヒドロリアーゼ。この酵素は、フルクトースとマンノースの代謝に関与しています。1つの補因子NAD+を使用します。
コンテンツ
1 GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼ反応
2 反応の要因
3 GDP-フコース生合成経路
3.1 GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼ構造
4 構造研究
5 参考文献
GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼ反応
酵素GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼは、リアーゼファミリーの酵素、特にヒドロリアーゼに含まれています。使用されている他の名前には、グアノシン5′-二リン酸-D-マンノースオキシドレダクターゼ、グアノシンジホスホマンノースオキシドレダクターゼ、グアノシンジホスホマンノース4，6-デヒドラターゼ、GDP-D-マンノースデヒドラターゼ、GDP-D-マンノース4，6-デヒドラターゼ、GMD、およびGDPが含まれます。 -マンノース4，6-ヒドロリアーゼ。この酵素はGDP-フコースデノボ合成経路の一部であり、フコース糖の移動に不可欠なGDP-フコースを与えるプロセスの最初のステップを触媒します。その一次構造には372個のアミノ酸が含まれています。これは、フコースが細胞性免疫とシグナル伝達において主要な役割を果たすという点で不可欠な酵素です。現在、GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼは利用可能な薬剤の標的ではありませんが、グアノシン-5′-二リン酸という薬剤で実験的に標的にされています。GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼの化学反応は次のとおりです。
GDP-マンノース↔GDP-4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノース+ H2 O
反応の要因
酵素が作用している酵素基質は、GDP-マンノース物質です。他の基質はこの酵素を反応に使用し
酵素がその触媒プロセスを経るとき、主な生成物は、GDP-マンノースをGDP-4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノースに変換し、その後、体が処理するために重要なGDP-フコースに変換されるときです。正しく。これは、GDP-マンノースとGDP-フコースの間の中間ステップとして機能します。
酵素が使用する反応では、活性化に必要な化合物であるNADP（+）という1つの補因子のみが必要ですが、この化合物が本当に酵素を活性化するかどうかは不明です。
GDP-フコースは酵素のアロステリック阻害剤です。
これは、GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼ酵素の構造全体のpymolビューです。
GDP-フコース生合成経路
酵素GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼは、私たちが知っている1つの経路にのみ存在します。この経路はGDP-マンノース依存性のdenovo経路であり、ほとんどの体にGDP-フコースを提供しますが、少量は体内でのフコースの回収に由来します。
ここでは、GDP酵素の完全な結晶構造を見ることができます。このリンクを使用して、酵素のサブユニットを検索し
ますhttp://www.rcsb.org/pdb/explore/jmol.do?structureId=1RPN&opt=3 PDB 1rpn
この経路では、酵素はGDP-マンノースをGDP-4-デヒドロ-6-デオキシ-D-マンノースに変換する中間段階にあり、GDP-フコースは体にとって絶対に重要です。この経路の産物はフコシルトランスフェラーゼであり、これは別の経路で使用され、体内の細胞シグナル伝達と免疫に使用されるフコース化グリカンを生成します。フコースは、多種多様な生物に存在するデオキシヘキソースです。ほとんどの哺乳動物では、フコース含有グリカンは、輸血反応、セレクチンを介した白血球-内皮接着、宿主-微生物相互作用、および多数の個体発生イベントにおいて重要な役割を果たします。それらに加えて、体は細胞のシグナル伝達枝として、また免疫における識別システムとしてフコースを使用します。しかし、酵素は通常の体の状態の下でそのトップレベルでのみ機能します。pHや熱が上昇すると、タンパク質が著しく変性し、酵素が機能不全になる可能性が
GDP-マンノース4、6-デヒドラターゼ構造
酵素には4つの異なるサブユニットが含まれています。酵素の3Dビューへのリンクは次のとおりですhttp://www.rcsb.org/pdb/explore/jmol.do?structureId=1RPN&bionumber=1
構造研究
2007年後半の時点で、このクラスの酵素について5つの構造が解決されており、 PDBアクセッションコードは1DB3、1N7G、1N7H、1RPN、および1T2Aです。
参考文献
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ポータル：
生物学”