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GelGreen

GelGreen

GelGreenは、アガロースゲルDNA電気泳動の分子遺伝学で使用される挿入型 核酸 染色剤です。GelGreenは、線形酸素化スペーサーによってブリッジされた2つのアクリジンオレンジサブユニットで構成されています。 GelGreen 名前
優先IUPAC名
10,10′-(6,22-ジオキソ-11,14,17-トリオキサ-7,21-ジアザヘプタコサン-1,27-ジイル)ビス[3,6-ビス(ジメチルアミノ)アクリジン-10-イウム]ジヨージド
他の名前
染料No.20、 AOAO-13 識別子
3Dモデル(JSmol)
インタラクティブ画像ChemSpider 10032003 Y PubChem CID 11857532 InChI
InChI = 1S / C56H78N8O5.2HI / c1-59(2)47-23-19-43-37-44-20-24-48(60(3)4)40-52(44)63(51(43) 39-47)29-13-9-11-17-55(65)57-27-15-31-67-33-35-69-36-34-68-32-16-28-58-56( 66)18-12-10-14-30-64-53-41-49(61(5)6)25-21-45(53)38-46-22-26-50(62(7)8) 42-54(46)64 ;; / h19-26,37-42H、9-18,27-36H2,1-8H3; 2 * 1H
キー:TWYVVGMYFLAQMU-UHFFFAOYSA-N
InChI = 1 / C56H78N8O5.2HI / c1-59(2)47-23-19-43-37-44-20-24-48(60(3)4)40-52(44)63(51(43) 39-47)29-13-9-11-17-55(65)57-27-15-31-67-33-35-69-36-34-68-32-16-28-58-56( 66)18-12-10-14-30-64-53-41-49(61(5)6)25-21-45(53)38-46-22-26-50(62(7)8) 42-54(46)64 ;; / h19-26,37-42H、9-18,27-36H2,1-8H3; 2 * 1H
キー:TWYVVGMYFLAQMU-UHFFFAOYAG SMILES O = C(NCCCOCCOCCOCCCNC(CCCCC 1 = C2C(C = CC(N(C)C)= C2)= CC3 = C1C = C(N(C)C)C = C3)= O)CCCCC 4 = C5C(C = CC(N(C)C)= C5)= CC6 = C4C = C(N(C)C)C=C6。。
プロパティ
化学式
C 56 H 80 I 2 N 8 O 5
モル質量 1198.43 g / mol
ハザード
NFPA 704(ファイアダイヤモンド) 0 0
引火点 > 100°C(212°F; 373 K)
安全データシート(SDS)
水中10,000倍、Biotium Inc.
特に明記されていない限り、データは
標準状態(25°C 、100 kPa)の材料について示されています。
インフォボックスの参照
そのフルオロフォア、したがってその光学特性は、他のN-アルキルアクリジニウムオレンジ色素のものと本質的に同一です。紫外線にさらされると、 DNAに結合した後に強く強くなる緑がかった色で蛍光を発します。この物質は、臭化エチジウムに代わる毒性が低く、感度が高いものとして販売されています。 GelGreenは、DMSOまたは水のいずれかの溶液として販売されています。

も参照してください
臭化エチジウム GelRed SYBRグリーンI
アガロースゲル電気泳動および核酸のゲル電気泳動
アクリジンオレンジ

参考文献
^ 米国出願2010323453、Mao、Fei&Leung、Wai-Yee、「核酸の染色または検出および関連技術に関連して染料を使用する方法」 
^ GelRed&GelGreen (PDF)、Biotium Inc.、2012年8月21日、2012年12月4日取得
^ GelRedおよびGelGreen:EtBrを置き換えるための環境的に安全で超高感度の核酸ゲル染色剤、Biotium Inc. 、 2012年12月4日取得

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