HAMPドメイン


HAMP_domain
分子生物学では、HAMPドメイン(ヒスチジンキナーゼ、アデニル酸シクラーゼ、メチル受容タンパク質、ホスファターゼに存在)は、二量体の4ヘリックスコイルドコイルを形成する約50アミノ酸のアルファヘリックス領域です。細菌センサーおよび走化性タンパク質、および真核生物のヒスチジンキナーゼに見られます。細菌タンパク質は通常、内在性膜タンパク質であり、2成分シグナル伝達経路の一部です。。HAMPドメインの1つまたは複数のコピーは、ヒスチジンキナーゼドメイン、細菌走化性感覚トランスデューサードメイン、 PASリピート、EALドメイン、GGDEFドメイン、プロテインホスファターゼ2C様ドメインなどの他のドメインと関連して見つけることができます。 、グアニル酸シクラーゼドメイン、または応答調節ドメイン。最も一般的な設定では、HAMPドメインはペリプラズムリガンド結合ドメインのコンフォメーション変化を細胞質シグナル伝達キナーゼおよびメチルアクセプタードメインに伝達し、ホモ二量体受容体のリン酸化またはメチル化活性を調節します。 ハンプ 識別子
シンボル
ハンプPfam F00672 InterPro PR003660 SCOP2
2asx / SCOPe / SUPFAM
OPMタンパク質iji CDD d06225
利用可能なタンパク質構造:
Pfam  
構造/ ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要

参考文献
^ Aravind L、ポンティングCP(1999年7月)。「受容体ヒスチジンキナーゼおよびメチル受容タンパク質の細胞質ヘリカルリンカードメインは、多くの原核生物シグナル伝達タンパク質に共通しています」。FEMS微生物学レター。176(1):111–6。土井:10.1016 / s0378-1097(99)00197-4。PMID10418137 。_ ^ Hulko M、Berndt F、Gruber M、Linder JU、Truffault V、Schultz A、Martin J、Schultz JE、Lupas AN、Coles M。「HAMPドメイン構造は、膜貫通シグナル伝達におけるヘリックス回転を意味します」。セル。126(5):929–40。土井:10.1016/j.cell.2006.06.058。PMID16959572。_ S2CID18396561。_    ^ Dunin-Horkawicz S、Lupas AN。「HAMPドメインの包括的な分析:膜貫通シグナル伝達への影響」。分子生物学ジャーナル。397(5):1156–74。土井:10.1016/j.jmb.2010.02.031。PMID20184894。_  
には、パブリックドメインの
Pfamおよび
InterProからのテキストが組み込まれています:
IPR003660