HAT_transposon
hATトランスポゾンは、植物、動物、真菌のゲノムに共通するDNAトランスポゾンまたはクラスIIトランスポゾンのスーパーファミリーです。
コンテンツ
1 命名法と分類
2 家族のメンバー
3 分布
4 家畜化
5 参考文献
命名法と分類
スーパーファミリーは、共有されたDNA配列と、同じトランスポザーゼに応答する能力によって識別されます。 hATトランスポゾンの一般的な特徴には、2.5〜5キロベースのサイズがあり、短い末端逆方向反復配列と、転位プロセス中に生成される短い隣接標的部位の重複が
hATスーパーファミリーの名前は、そのメンバーの3つに由来します。キイロショウジョウバエのホーボー要素、トウモロコシのアクティベーターまたはAc要素、キンギョソウのTam3要素です。スーパーファミリーは、バイオインフォマティクス分析に基づいて、系統発生的関係によって定義される少なくとも2つのクラスター（ AcファミリーとBusterファミリー）に分割されています。最近、Tipと呼ばれる3番目のグループが説明されました。
家族のメンバー
hATトランスポゾンスーパーファミリーには、最初に発見されたトランスポゾン、Zea mays（トウモロコシ）からのAcが含まれ、 BarbaraMcClintockによって最初に報告されました。 マクリントックは、この発見により1983年にノーベル生理学・医学賞を受賞しました。このファミリーには、スペースインベーダーまたはSPINエレメントとして知られるサブグループも含まれます。これらは、一部のゲノムで非常に高いコピー数を持ち、最も効率的な既知のトランスポゾンの1つです。現存するアクティブな例は知られていませんが、アクティブなSPIN要素の実験室で生成されたコンセンサス配列は、広範囲の種からの細胞に導入されたときに高いコピー数を生成することができます。
分布
hATトランスポゾンは真核生物の ゲノム全体に広く分布していますが、すべての生物で活性があるわけではありません。不活性なhATトランスポゾン配列は、ヒトゲノムを含む哺乳類のゲノムに存在します。それらは、祖先の脊椎動物のゲノムに存在すると考えられているトランスポゾンファミリーの1つです。哺乳類の中で、トビイロホオヒゲコウモリMyotis lucifugusのゲノムは、比較的多く、最近獲得された不活性なhATトランスポゾンの数で注目に値します。
SPIN要素の分布は斑状であり、既知の系統発生関係とはあまり関係がなく、これらの要素が遺伝子の水平伝播によって広がった可能性があるという示唆を促しています。
家畜化
トランスポゾンは、宿主ゲノムで機能的な役割を獲得したときに、外適応または「家畜化」されたと言われます。hATファミリーに進化的に関連するいくつかの配列は、ホモサピエンスを含む多様な生物に適応されています。例は、ジンクフィンガーを含む調節タンパク質のグループをコードするZBED遺伝子ファミリーです。
参考文献
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