HBV_RNA_encapsidation_signal_epsilon
HBV RNAキャプシド形成シグナルイプシロン(HBV_epsilon )は、HBVウイルス複製に不可欠な要素です。
HBVRNAキャプシド形成シグナルイプシロンHBV_epsilonの 測
される二次構造と配列保存 識別子
シンボル HBV_epsilon Alt。記号BV Rfam F01047
その他のデータ
RNAタイプ Cis-reg ドメイン
ウイルス
行く GO:0019079 それで SO:0005836 PDB構造 PDBe これは、 HBVプレゲノムRNAの5’末端近くに位置するRNA構造です。構造は、下部ステム、バルジ領域、上部ステム、およびトライループで構成されています。構造は、酵素プロービングとNMR分光法によって決定および改良されました。トライループの閉鎖は、RNA構造予測プログラムでは予測されませんでしたが、NMR構造で観察されました。ウイルスのライフサイクルにおけるRNAのキャプシド形成に重要であることが示されている領域は、HBVウイルスポリメラーゼの末端タンパク質ドメインと相互作用するバルジ、上部ステム、およびトリループです。
も参照してください
ヘロンHBVRNAキャプシド形成シグナルイプシロン
アヒルHBVRNAキャプシド形成シグナルイプシロン
B型肝炎ウイルスPREアルファ
B型肝炎ウイルスPREベータ
B型肝炎ウイルスPRE1151–1410
参考文献
^ Beck J、Nassal M。「B型肝炎ウイルスの複製」。ワールドJ.ガストロエンテロール。13(1):48–64。土井:10.3748/wjg.v13.i1.48。PMC4065876 。_ PMID17206754 。_ 2007年3月20日にオリジナルからアーカイブされました。
^ Flodell S、Schleucher J、Cromsigt J、Ippel H、Kidd-Ljunggren K、Wijmenga S。「B型肝炎ウイルスのキャプシド形成シグナルの頂端ステムループは、2つの下にあるピリミジンバルジを持つ安定したトリループに折りたたまれます」。NucleicAcidsRes。30(21):4803–4811。土井:10.1093 / nar/gkf603。PMC135823。_ PMID12409471。_
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外部リンク
RfamでのHBVRNAキャプシド形成シグナルイプシロンのページ
HBVRegDB B型肝炎ウイルスHBV調節配列データベース(HBVRegDB)
この分子または細胞生物学
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