異種リボ核タンパク質粒子


Heterogeneous_ribonucleoprotein_particle
異種核リボ核タンパク質( hnRNP ) は、遺伝子転写中の細胞核に存在するRNAとタンパク質の複合体であり、その後、新たに合成された RNA (プレ mRNA) の転写後修飾が行われます。mRNA前駆体分子に結合したタンパク質の存在は、mRNA前駆体がまだ完全に処理されておらず、したがって細胞質への輸出の準備ができていないというシグナルとして機能します。ほとんどの成熟 RNA は比較的迅速に核から排出されるため、ほとんどのRNA 結合タンパク質は、核内では不均一なリボ核タンパク質粒子として存在します。スプライシングが発生した後、タンパク質はスプライシングされたイントロンに結合したままになり、分解の標的になります。
hnRNPはリボソームの40sサブユニットにも組み込まれているため、細胞質でのmRNAの翻訳に重要です。ただし、hnRNP は独自の核局在配列(NLS) も持っているため、主に核内に見られます。少数の hnRNP が細胞質と核の間を行き来することが知られていますが、hnRNP 特異的抗体を用いた免疫蛍光顕微鏡検査では、核小体または細胞質での染色がほとんどなく、これらのタンパク質の核質への局在が示されます。これは、新しく転写された RNA への結合における主要な役割によるものと考えられます。高分解能免疫電子顕微鏡法は、hnRNP が主にクロマチンの境界領域に局在し、そこでこれらの新生 RNA にアクセスできることを示しています。
hnRNP 複合体に関与するタンパク質は、異種リボ核タンパク質として総称されます。それらには、プロテインKおよびポリピリミジントラクト結合タンパク質(PTB)が含まれます。これは、プロテインキナーゼAによって触媒されるリン酸化によって調節され、スプライセオソームのポリピリミジントラクトへのアクセスをブロックすることにより、特定のエクソンでのRNAスプライシングの抑制に関与しています 。 : 326  hnRNP は、スプライソソームが多かれ少なかれアクセスできるようにすることで、スプライス部位を強化および阻害する役割も果たします。接続された hnRNP 間の協調的な相互作用は、特定のスプライシングの組み合わせを促進する一方で、他の組み合わせを阻害する可能性が

コンテンツ
1 細胞周期と DNA 損傷における役割
1.1 BRCA1 1.2 HER2 1.3 p53
2 機能
2.1 CD44 規制 2.2 テロメア
3 例
4 こちらもご覧ください
5 参考文献
6 参考文献

細胞周期と DNA 損傷における役割
hnRNP は、特定の細胞周期制御タンパク質を動員、スプライシング、および共制御することにより、細胞周期のいくつかの側面に影響を与えます。細胞周期制御に対する hnRNP の重要性の多くは、その機能の喪失がさまざまな一般的な癌を引き起こす癌遺伝子としての役割によって証明されています。多くの場合、hnRNP による誤制御はスプライシング エラーが原因ですが、一部の hnRNP は、発生期の RNA に対処するだけでなく、タンパク質自体の動員と誘導にも関与しています。

BRCA1
hnRNP Cは、BRCA1およびBRCA2遺伝子の重要な調節因子です。電離放射線に応答して、hnRNP C は部分的に DNA 損傷部位に局在し、枯渇すると、細胞のS 期進行が損なわれます。さらに、hnRNP C が失われると、BRCA1 および BRCA2 のレベルが低下します。BRCA1 と BRCA2 は、変異すると乳がんに強く関与する重要な腫瘍抑制遺伝子です。特に BRCA1 は、 CHEK1シグナル伝達カスケードを介した DNA 損傷に応答して、 G2/M細胞周期停止を引き起こします。 hnRNP C は、RAD51 や BRIP1 などの他の腫瘍抑制遺伝子の適切な発現にも重要です。これらの遺伝子を介して、hnRNP は、電離放射線による DNA 損傷に応答して細胞周期停止を誘導するために必要です 。

HER2
HER2は乳がんの 20 ~ 30% で過剰発現しており、一般的に予後不良と関連しています。したがって、異なるスプライシングバリアントが異なる機能を持つことが示されている癌遺伝子です。hnRNP H1をノックダウンすると、発癌性バリアント Δ16HER2 の量が増加することが示されました。 HER2 はサイクリン D1 および p27 の上流調節因子であり、その過剰発現はG1/Sチェックポイントの調節解除につながります。

p53
hnRNP は、 p53と協調して DNA 損傷応答においても役割を果たします。hnRNP Kは、電離放射線による DNA 損傷後に急速に誘導されます。p53 と協力して p53 標的遺伝子の活性化を誘導し、細胞周期チェックポイントを活性化します。 p53自体は、 「ゲノムの守護者」という別名で知られる重要な腫瘍抑制遺伝子です。hnRNP K と p53 との密接な関係は、DNA 損傷制御におけるその重要性を示しています。
p53 は、大きな遺伝子間非コード RNA ( lincRNA )と呼ばれる、タンパク質に翻訳されない RNA の大きなグループを調節します。遺伝子の p53 抑制は多くの場合、これらの lincRNA の多くによって実行され、これらの lincRNA は hnRNP K を介して作用することが示されています。これらの分子との物理的相互作用を通じて、hnRNP K は遺伝子を標的とし、p53 制御を伝達し、鍵として機能します。 p53依存性転写経路内のリプレッサー。

機能
hnRNP は細胞内でさまざまなプロセスに関与しており、その一部には以下が含まれます。
他のタンパク質との相互作用を阻害する可能性のある二次構造へのプレmRNAの折り畳みを防ぎます。
スプライシング装置との関連の可能性。
核外へのmRNAの輸送。
mRNA前駆体分子とhnRNP粒子との結合は、相補領域の塩基対形成に依存する短い二次構造の形成を防ぎ、それによってmRNA前駆体が他のタンパク質との相互作用にアクセスできるようにします。

CD44 規制
hnRNP は、スプライシング機構を通じて細胞表面糖タンパク質であるCD44を調節することが示されています。CD44 は細胞間相互作用に関与し、細胞の接着と移動に役割を果たします。CD44 のスプライシングと結果として生じるアイソフォームの機能は乳癌細胞では異なり、ノックダウンすると、hnRNP は細胞の生存率と侵襲性の両方を低下させました。

テロメア
いくつかの hnRNP はテロメアと相互作用します。テロメアは、染色体の末端を劣化から保護し、しばしば細胞の寿命に関連しています。hnRNP Dはテロメアの G リッチ リピート領域と結合し、テロメアの複製を阻害する二次構造から領域を安定化させる可能性が
hnRNPは、テロメアの伸長に関与するタンパク質であるテロメラーゼと相互作用し、その分解を防ぐことも示されています。hnRNP C1 および C2 は、テロメラーゼの RNA 成分と結合し、テロメアにアクセスする能力を向上させます。


異種の核リボ核タンパク質をコードするヒト遺伝子には、次のものが
HNRNPA0、HNRNPA1、HNRNPA1L1、HNRNPA1L2、HNRNPA3、HNRNPA2B1HNRNPAB HNRNPB1 HNRNPC、HNRNPCL1
HNRNPD (AUF1)、HNRPDL HNRNPF HNRNPG (RBMX)
HNRNPH1、HNRNPH2、HNRNPH3
HNRNPI (PTB)HNRNPK HNRNPL、HNRPLL HNRNPM
HNRNPP2 (FUS/TLS) HNRNPR HNRNPQ (SYNCRIP)
HNRNPU、HNRNPUL1、HNRNPUL2、HNRNPUL3
FMR1

こちらもご覧ください
Messenger RNP : 核内に存在する mRNA とタンパク質の複合体

参考文献
^ AJ キニバーグ。Martin、TE (1976-08-01)。「核30Sリボ核タンパク質サブコンプレックスにおけるmRNA配列の検出」 . 米国科学アカデミーの議事録。73 (8): 2725–2729。ビブコード: 1976PNAS…73.2725K . ドイ: 10.1073/pnas.73.8.2725 . ISSN  0027-8424。PMC  430721 . PMID  1066686。
^Beyer、Ann L.; クリステンセン、マークE。ウォーカー、バーバラ・W。LeStourgeon、Wallace M. (1977)。「コア 40S hnRNP 粒子のパッケージングタンパク質の同定と特徴付け」。セル。11 (1): 127–138. ドイ:10.1016/0092-8674(77)90323-3 . PMID  872217。S2CID  41245800 . ^
ドレフュス、ギデオン。Matunis、マイケル J.; ピノールローマ、セラフィン。Burd、Christopher G. (1993-06-01)。「hnRNPタンパク質とmRNAの生合成」。生化学の年次レビュー。62 (1): 289–321. ドイ: 10.1146/annurev.bi.62.070193.001445 . ISSN  0066-4154 . PMID  8352591。
^Fakan、S。レーサー、G.; Martin、TE (1984 年 1 月)。「薄切片の免疫細胞化学によって可視化された核リボ核タンパク質の超微細構造分布」 . 細胞生物学のジャーナル。98 (1): 358–363. ドイ: 10.1083/jcb.98.1.358 . ISSN  0021-9525 . PMC  2113018 . PMID  6231300。
^松平 PT、Lodish HF、Berk A、Kaiser C、Krieger M、Scott MP、Bretscher A、Ploegh H (2008). 分子細胞生物学。サンフランシスコ:WHフリーマン。ISBN 978-0-7167-7601-7. ^
Matlin、Arianne J.; クラーク、フランシス。スミス、クリストファー WJ (2005)。「オルタナティブ スプライシングを理解する: セルラー コードに向けて」. ネイチャーレビュー分子細胞生物学。6 (5): 386–398. ドイ: 10.1038/nrm1645 . ISSN  1471-0080 . PMID  15956978。S2CID  14883495 . ^
マルティネス・コントレラス、レベッカ。クルーティエ、フィリップ。シュクレタ、ルルジム。フィゼット、ジャン・フランソワ。悪魔、ティモシー。シャボー、ブノワ (2007)。hnRNP タンパク質とスプライシング制御。実験医学と生物学の進歩。巻。623. pp.  123–147 . ドイ: 10.1007/978-0-387-77374-2_8 . ISBN 978-0-387-77373-5. ISSN  0065-2598。PMID  18380344。
^アナンサ、レイチェル・W。Alcivar、アレン L.; 馬、江林; カイ、ホン。Simhadri、Srilatha; Ule、Jernej。ケーニッヒ、ジュリアン。夏、ビング (2013-04-09)。「BRCA遺伝子発現および相同組換えのための異種核リボヌクレオプロテインCの要件」。プロスワン。8 (4): e61368。ビブコード: 2013PLoSO…861368A . ドイ: 10.1371/journal.pone.0061368 . ISSN  1932-6203。PMC  3621867 . PMID  23585894。
^吉田、清次。三木良雄 (2004 年 11 月). 「DNA 損傷に応答した DNA 修復、転写、および細胞周期の調節因子としての BRCA1 および BRCA2 の役割」 . がん科学。95 (11): 866–871. ドイ: 10.1111/j.1349-7006.2004.tb02195.x . ISSN  1347-9032。PMID  15546503。S2CID  24297965 . ^
ゴートレー、ハンナ。ジャクソン、クレア。ディトリッヒ、アンナ・レナ。ブローウェル、デビッド。レナード、トーマス。Tyson-Capper、アリソン (2015-10-03)。「SRSF3 と hnRNP H1 は、乳癌細胞の HER2 のスプライシング ホットスポットを制御します」 . RNA生物学。12 (10): 1139–1151。ドイ: 10.1080/15476286.2015.1076610 . ISSN  1547-6286。PMC  4829299 . PMID  26367347。
^Moasser、MM (2007)。「がん遺伝子 HER2: そのシグナル伝達および変換機能と、ヒトがんの病因におけるその役割」 . がん遺伝子。26 (45): 6469–6487. ドイ: 10.1038/sj.onc.1210477 . ISSN  1476-5594。PMC  3021475 . PMID  17471238。
^モウメン、アブデラディム。マスターソン、フィリップ。オコナー、マーク J.; ジャクソン、スティーブン P. (2005)。「hnRNP K: HDM2 ターゲットと DNA 損傷に応答して p53 の転写コアクチベーター」 . セル。123 (6): 1065–1078。ドイ: 10.1016/j.cell.2005.09.032 . PMID  16360036。S2CID  16756766 . ^
Huarte、マイテ。グットマン、ミッチェル。フェルダー、デビッド。ガーバー、マヌエル。Koziol、Magdalena J.; ケンゼルマン・ブロズ、ダニエラ。ハリル、アフマド・M。ズック、または; 井戸阿弥陀(2010)。「p53 によって誘導される大きな遺伝子間ノンコーディング RNA は、p53 応答におけるグローバルな遺伝子抑制を仲介します」 . セル。142 (3): 409–419. ドイ: 10.1016/j.cell.2010.06.040 . PMC  2956184 . PMID  20673990 . ^
サン、シンホイ; アリ、モハメド・シャム・シハブディーン・ハイダー。モラン、マシュー (2017-09-01)。「細胞機能の調節における長いノンコーディングRNAと異種核リボ核タンパク質の相互作用の役割」 . 生化学ジャーナル。474 (17): 2925–2935。ドイ: 10.1042/bcj20170280 . ISSN  0264-6021 . PMC  5553131 . PMID  28801479。
^Loh、Tiing Jen; ムン、ヒギム; チョ・ソンヒ; チャン、ハナ; 劉永チャオ; タイ、ホンメイ; チョン・ダウン; ウィリアムズ、ダレン R.; キム・ヘイラン (2015 年 9 月)。「CD44 オルタナティブ スプライシングと hnRNP A1 発現は、乳がんの転移と関連しています」 . 腫瘍学レポート。34 (3): 1231–1238。doi : 10.3892/or.2015.4110 . ISSN  1791-2431。PMID  26151392。
^エバーソール、A。Maizels, N. (2000 年 8 月)。「保存された哺乳類タンパク質hnRNP Dのin vitro特性は、テロメア維持における役割を示唆している」 . 分子および細胞生物学。20 (15): 5425–5432。ドイ: 10.1128/mcb.20.15.5425-5432.2000。ISSN  0270-7306 . PMC  85994 . PMID  10891483。
^フォード、LP。スー、JM; ライト、WE; シェイ、JW (2000 年 12 月)。「異種核リボ核タンパク質C1およびC2は、ヒトテロメラーゼのRNA成分と関連しています」 . 分子および細胞生物学。20 (23): 9084–9091. ドイ: 10.1128/mcb.20.23.9084-9091.2000 . ISSN  0270-7306 . PMC  86561 . PMID  11074006 . ^
フォード、ランス・P。ライト、ウッドリングE。シェイ、ジェリー W. (2002-01-21)。「テロメアおよびテロメラーゼ調節における異種核リボ核タンパク質のモデル」 . がん遺伝子。21 (4): 580–583. ドイ: 10.1038/sj.onc.1205086 . ISSN  0950-9232。PMID  11850782。
^Görlach、M.; Burd、CG。Dreyfuss, G. (1994-09-16)。「不均一な核リボヌクレオプロテイン C タンパク質の RNA 結合特異性の決定要因」 . 生物化学ジャーナル。269 (37): 23074–23078. ドイ:10.1016/S0021-9258(17)31621-6 . ISSN  0021-9258 . PMID  8083209。
^ディチャテフ、アレクサンダー。El-Husseini、アラア (2006-11-24)。シナプス形成の分子メカニズム。ISBN 9780387325620.

参考文献
Xie J、Lee JA、Kress TL、Mowry KL、Black DL (2003 年 7 月)。「プロテインキナーゼAのリン酸化は、ポリピリミジントラクト結合タンパク質の輸送を調節する」 . 議事録 国立 アカデミー。科学。米国。100 (15): 8776–81。ビブコード: 2003PNAS..100.8776X . ドイ: 10.1073/pnas.1432696100 . PMC  166389 . PMID  12851456。
Geuens T、Delphine B、Timmerman V (2016 年 8 月)。「hnRNPファミリー:健康と病気における役割への洞察」 . ヒト遺伝学。135 (8): 851–67. ドイ: 10.1007/s00439-016-1683-5 . PMC  4947485 . PMID  27215579。
瀧本美智子、朝長T、Matunis M、他 (1993 年 8 月)。「異種リボ核タンパク質粒子タンパク質 K のヒト c-myc プロモーターへの in vitro での特異的結合」 . J.Biol.化学。268 (24): 18249–58. ドイ:10.1016/S0021-9258(17)46837-2 . PMID  8349701。2019-09-15のオリジナルからのアーカイブ。2009 年3 月 8日閲覧。
ワトソン、ジェームズ D. (2004)。遺伝子の分子生物学。サンフランシスコ:ピアソン/ベンジャミン・カミングス。pp.ch。9 と10.ISBN 978-0-8053-4635-0.