KARS_(gene)
リシルtRNAシンテターゼは、ヒトではKARS遺伝子によってコードされる酵素です。 KARS1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
3BJU、4DPG、4YCU、4YCW
識別子
エイリアス
KARS1、CMTRIB、DFNB89、KARS2、KRS、リシル-tRNAシンテターゼ、KARS、リシル-tRNAシンテターゼ1、LEPID、DEAPLE
外部ID
OMIM：601421 MGI：1934754 HomoloGene：4053 GeneCards：KARS1
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 16番染色体（ヒト）
バンド 16q23.1 始める
75，627，474 bp
終わり
75，648，643 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 8番染色体（マウス）
バンド
8 E1 | 8 58.27 cM
始める
112，720，075 bp
終わり
112，737，955 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
壁側胸膜
内臓胸膜
耳下腺
内皮細胞
前脛骨筋
三角筋
脛骨
口の空洞
ブロードマンの脳地図23
眼瞼結膜
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
アミノアシル-tRNAリガーゼ活性
ヌクレオチド結合
アミノ酸結合
tRNA結合
リジン-tRNAリガーゼ活性
リガーゼ活性
GO：0001948タンパク質結合
核酸結合
ATP結合
ATPアデニリルトランスフェラーゼ活性
タンパク質ホモ二量体化活性
トランスフェラーゼ活性
同一のタンパク質結合
細胞成分 膜 原形質膜
細胞外領域
ミトコンドリアマトリックス
ミトコンドリア
細胞外空間
アミノアシル-tRNAシンテターゼ多酵素複合体 核 細胞質
サイトゾル
生物学的プロセス
タンパク質生合成
tRNAプロセッシング
タンパク質翻訳のためのtRNAアミノアシル化
リシル-tRNAアミノアシル化
GO：0022415ウイルスプロセス
免疫応答に関与する好塩基球の活性化
細胞集団増殖の負の調節
マクロファージ走化性の正の調節
腫瘍壊死因子を介したシグナル伝達経路
マクロファージ活性化の正の調節
転写の正の調節、DNAテンプレート
ERK1およびERK2カスケード
ERK1およびERK2カスケードの正の調節
炎症反応に関与するサイトカイン産生の正の調節
p38MAPKカスケードの正の調節
メタロペプチダーゼ活性の正の調節
ジアデノシンテトラホスフェート生合成プロセス
X線への応答
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez3735 85305 Ensembl ENSG00000065427 ENSMUSG00000031948 UniProt Q15046 Q99MN1
RefSeq（mRNA）
NM_005548 NM_001130089 NM_001378148
NM_001130868 NM_001286384 NM_053092 NM_001363429 NM_001363430
RefSeq（タンパク質）
NP_001123561 NP_005539 NP_001365077
NP_001124340 NP_001273313 NP_444322 NP_001350358 NP_001350359
場所（UCSC）
16番染色体：75.63 – 75.65 Mb
Chr 8：112.72 – 112.74 Mb
PubMed検索
ウィキデータ
人間の表示/
マウスの表示/編集
コンテンツ
1 関数
2 相互作用
3 参考文献
4 参考文献
関数
アミノアシルtRNAシンテターゼは、同族のアミノ酸でtRNAを充電する酵素のクラスです。リシルtRNAシンテターゼは、細胞質に局在するホモ二量体であり、tRNAシンテターゼのクラスIIファミリーに属します。ヒトの自己免疫疾患、多発性筋炎または皮膚筋炎における自己抗体の標的であることが示されています。
翻訳におけるその役割に加えて、リシル-tRNAシンテターゼは遺伝子活性化につながるシグナル伝達経路に関与しています。さまざまな細胞の生理学的刺激に続いて、リシルtRNAシンテターゼは転写因子MITF およびUSF2 に結合し、それらの転写活性に影響を与える可能性がこのような生理学的刺激には肥満細胞の免疫学的活性化が含まれるため、この経路はアレルギー反応に関連している可能性が
相互作用
KARS（遺伝子）は、マルチシンテターゼ複合体補助成分p38と相互作用することが示されています。 免疫学的活性化などの生理学的トリガーにより、セリン残基のLysRSがリン酸化されます。マルチシンテターゼ複合体から分離し、Ap4Aの産生を開始します。
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