Categories: 未分類

KCNA4

KCNA4
カリウム電位依存性チャネルサブファミリーKv1.4としても知られるメンバー4は、ヒトではKCNA4遺伝子によってコードされるタンパク質です 。 心臓の活動電位の再分極相1に寄与する主な電流である、心臓の一過性の外向きカリウム電流(I to1)に寄与します。 KCNA4 識別子
エイリアス
KCNA4、HBK4、HK1、HPCN2、HUKII、KCNA4L、KCNA8、KV1.4、PCN2、カリウム電位依存性チャネルサブファミリーAメンバー4、MCIDDS
外部ID
OMIM:176266 MGI:96661 HomoloGene:20514 GeneCards:KCNA4
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 11番染色体(ヒト)
バンド 11p14.1 始める
30,009,730 bp
終わり
30,017,030 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 2番染色体(マウス)
バンド
2 E3 | 2 56.12 cM
始める
107,120,984 bp
終わり
107,128,847 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
側坐核
二次卵母細胞
尾状核
被殻
前頭前皮質
右副腎
中前頭回 胚上皮 前頭極
背外側前頭前野
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
カリウムチャネル活性
カリウムイオン結合
電位依存性イオンチャネル活性
イオンチャネル活性
GO:0001948タンパク質結合
電位依存性カリウムチャネル活性
遅延整流カリウムチャネル活性
細胞成分
膜の不可欠なコンポーネント
細胞投射 膜 電位依存性カリウムチャネル複合体
原形質膜
アクソン
原形質膜の不可欠なコンポーネント
樹状突起棘
生物学的プロセス
イオン膜貫通輸送の調節
イオン輸送
カリウムイオン輸送
膜貫通輸送
カリウムイオン膜貫通輸送
タンパク質のホモオリゴマー化
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez3739 16492 Ensembl ENSG00000182255 ENSMUSG00000042604 UniProt P22459 Q61423
RefSeq(mRNA)NM_002233 NM_021275
RefSeq(タンパク質)NP_002224 NP_067250
場所(UCSC)
Chr 11:30.01 – 30.02 Mb
Chr 2:107.12 – 107.13 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/

マウスの表示/
カリウムチャネルKv1.4タンデム不活化ドメイン
カリウムチャネルrck4(kv1.4)のタンデム不活性化ドメイン(残基1-75)の溶液構造
識別子
シンボル_channel_TID Pfam F07941 InterPro PR012897 SCOP2
1kn7 / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
Pfam  
構造/ ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum 構造の概要

コンテンツ
1 説明
2 相互作用
3 も参照してください
4 参考文献
5 参考文献
6 外部リンク

説明
カリウムチャネルは、機能的および構造的観点の両方から、電位依存性イオンチャネルの最も複雑なクラスを表しています。それらの多様な機能には、神経伝達物質の放出、心拍数、インスリン分泌、神経細胞の興奮性、上皮電解質輸送、平滑筋収縮、および細胞体積の調節が含まれます。ショウジョウバエでは、4つの配列関連カリウムチャネル遺伝子(シェーカー、ショー、シャブ、およびシャル)が同定されており、それぞれがヒト相同体を有することが示されています。この遺伝子は、カリウムチャネルのメンバーである電位依存性シェーカー関連サブファミリーをコードしています。このメンバーには、4番目のセグメントにシェーカータイプのリピートを持つ6つの膜貫通ドメインが含まれています。それはA型カリウム電流クラスに属し、そのメンバーは心臓の活動電位の高速再分極相の調節に重要である可能性があり、したがって心臓活動電位の持続時間に影響を与える可能性がこの遺伝子のコード領域はイントロンレスであり、この遺伝子は、ヒトの第1染色体上の遺伝子KCNA3およびKCNA10とクラスター化されています。
KCNA4(Kv1.4)には、N末端にタンデム不活性化ドメインが含まれています。2つのサブドメインで構成されています。不活性化ドメイン1(ID1、残基1〜38)は、5ターンのらせんに固定された柔軟なN末端で構成され、古典的なボールドメインの場合と同様に、イオン経路を閉塞することによって機能すると考えられています。不活性化ドメイン2(ID2、残基40-50)は、疎水性残基の割合が高い2.5ターンのらせんであり、おそらくID1をチャネルの細胞質面に付着させる働きをします。このようにして、開水路の受容体部位へのID1の迅速なアクセスを促進することができます。ID1とID2は一緒に機能して、Kv1.4チャネルの迅速な不活性化をもたらします。これは、短期間の可塑性におけるチャネルの役割にとって重要です。

相互作用
KCNA4は、 DLG4、 KCNA2 およびDLG1と相互作用することが示されています。

も参照してください
電位依存性カリウムチャネル
電位依存性カリウムチャネルKv1.4IRES

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000182255 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000042604 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ Philipson LH、Schaefer K、LaMendola J、Bell GI、Steiner DF(1990年12月)。「RCK4に関連するヒト胎児骨格筋カリウムチャネルcDNAの配列」。核酸研究。18(23):7160 . doi:10.1093 / nar/18.23.7160。PMC332806。_ PMID2263489。_    ^ Gutman GA、Chandy KG、Grissmer S、Lazdunski M、McKinnon D、PardoLAなど。。「国際薬理学連合。LIII。電位依存性カリウムチャネルの命名法と分子関係」。薬理学的レビュー。57(4):473–508。土井:10.1124/pr.57.4.10。PMID16382104。_ S2CID219195192。_    ^ “Entrez Gene:KCNA4カリウム電圧ゲートチャネル、シェーカー関連サブファミリー、メンバー4″。
^ Oudit GY、Kassiri Z、Sah R、Ramirez RJ、Zobel C、Backx PH。「正常および罹患した心筋における心臓の一過性外向きカリウム電流(I(to))の分子生理学」。Journal of Molecular andCellularCardiology。33(5):851–72。土井:10.1006/jmcc.2001.1376。PMID11343410。_ S2CID829154。_    ^ Wissmann R、Bildl W、Oliver D、Beyermann M、Kalbitzer HR、Bentrop D、Fakler B。「ニューロンのA型カリウムチャネルKv1.4の「タンデム不活性化ドメイン」の溶液構造と機能」。Journal ofBiologicalChemistry。278(18):16142–50。土井:10.1074/jbc.M210191200。PMID12590144。_   ^ 稲野部A、藤田A、伊藤M、友池H、稲毛田K、倉知Y。「内向き整流カリウムチャネルKir2.3は、興奮性シナプスのシナプス後膜に局在しています」。American JournalofPhysiology。細胞生理学。282(6):C1396-403。土井:10.1152/ajpcell.00615.2001。PMID11997254。_   ^ Niethammer M、Valtschanoff JG、Kapoor TM、Allison DW、Weinberg RJ、Craig AM、Sheng M(1998年4月)。「CRIPT、PSD-95/SAP90の3番目のPDZドメインに結合する新しいシナプス後タンパク質」。Neuron。20(4):693–707。土井:10.1016 / S0896-6273(00)81009-0。PMID9581762。_ S2CID16068361。_    ^ Kim E、Sheng M(1996)。「PSD-95およびSAP97、2つの関連する膜関連推定グアニル酸キナーゼの異なるK+チャネルクラスタリング活性」。神経薬理学。35(7):993–1000。土井:10.1016 / 0028-3908(96)00093-7。PMID8938729。_ S2CID23755452。_    ^ Eldstrom J、Doerksen KW、Steele DF、Fedida D。「Kv1カリウムチャネルのN末端PDZ結合ドメイン」。FEBSレター。531(3):529–37。土井:10.1016 / S0014-5793(02)03572-X。PMID12435606。_ S2CID40689829。_    ^ Coleman SK、Newcombe J、Pryke J、Dolly JO(1999年8月)。「ヒトCNSにおけるKv1チャネルのサブユニット構成」。神経化学ジャーナル。73(2):849–58。土井:10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x。PMID10428084。_ S2CID20632070。_    ^ Eldstrom J、Choi WS、Steele DF、Fedida D。「SAP97は間接的なN末端メカニズムを介してKv1.5電流を増加させます」。FEBSレター。547(1–3):205–11。土井:10.1016 / S0014-5793(03)00668-9。PMID12860415。_ S2CID34857270。_   

参考文献
Scott HS、Litjens T、Hopwood JJ、Morris CP(1992年11月)。「α-L-イズロニダーゼ(IDUA)遺伝子のエクソンIにおける2つのRFLPのPCR検出」。人間遺伝学。90(3):327 . doi:10.1007/bf00220095。PMID1362562 。_ S2CID22700269 。_
Gessler M、Grupe A、Grzeschik KH、Pongs O(1992年11月)。「カリウムチャネル遺伝子HK1は、FSHB遺伝子に近いヒト染色体11p14.1にマッピングされます」。人間遺伝学。90(3):319–21。土井:10.1007/bf00220091。PMID1487251 。_ S2CID10237322 。_
Philipson LH、Hice RE、Schaefer K、LaMendola J、Bell GI、Nelson DJ、Steiner DF(1991年1月)。「ヒトインスリノーマおよび膵島カリウムチャネルのアフリカツメガエル卵母細胞における配列および機能的発現」。アメリカ合衆国科学アカデミー紀要。88(1):53–7。Bibcode:1991PNAS … 88…53P。土井:10.1073/pnas.88.1.53。PMC50746 。_ PMID1986382 。_
Tamkun MM、Knoth KM、Walbridge JA、Kroemer H、Roden DM、Glover DM(1991年3月)。「ヒト心室からの2つの電位依存性K+チャネルcDNAの分子クローニングと特性評価」。FASEBJournal。5(3):331–7。土井:10.1096/fasebj.5.3.2001794。PMID2001794 。_ S2CID23737559 。_
キムE、ニートハンマーM、ロスチャイルドA、ヤンYN、シェンM(1995年11月)。「膜関連グアニル酸キナーゼのファミリーとの相互作用によるシェーカー型K+チャネルのクラスター化」。自然。378(6552):85–8。Bibcode:1995Natur.378…85K。土井:10.1038/378085a0。PMID7477295 。_ S2CID4362906 。_
Klocke R、Roberds SL、Tamkun MM、Gronemeier M、Augustin A、AlbrechtBなど。(1993年12月)。「4つのシェーカー様サブファミリーShaker、Shab、Shaw、およびShalを表す8つのK(+)チャネル遺伝子のマウスにおける染色体マッピング」。ゲノミクス。18(3):568–74。土井:10.1016 / S0888-7543(05)80358-1。PMID7905852 。_
Philipson LH、Eddy RL、Shows TB、Bell GI(1993年2月)。「ヒトカリウムチャネル遺伝子KCNA4(Kv1.4、PCN2)の染色体11q13.4->q14.1への割り当て。」ゲノミクス。15(2):463–4。土井:10.1006/geno.1993.1094。PMID8449523 。_
Niethammer M、Kim E、Sheng M(1996年4月)。「NMDA受容体サブユニットのC末端と膜結合型グアニル酸キナーゼのPSD-95ファミリーの複数のメンバーとの間の相互作用」。ジャーナルオブニューロサイエンス。16(7):2157–63。土井:10.1523/JNEUROSCI.16-07-02157.1996。PMC6578538 。_ PMID8601796 。_
キムE、シェンM(1997)。「PSD-95およびSAP97、2つの関連する膜関連推定グアニル酸キナーゼの異なるK+チャネルクラスタリング活性」。神経薬理学。35(7):993–1000。土井:10.1016 / 0028-3908(96)00093-7。PMID8938729 。_ S2CID23755452 。_
Kim E、Naisbitt S、Hsueh YP、Rao A、Rothschild A、Craig AM、Sheng M(1997年2月)。「GKAP、チャネルクラスタリング分子のPSD-95/SAP90ファミリーのグアニル酸キナーゼ様ドメインと相互作用する新しいシナプスタンパク質」。細胞生物学ジャーナル。136(3):669–78。土井:10.1083/jcb.136.3.669。PMC2134290 。_ PMID9024696 。_
Niethammer M、Valtschanoff JG、Kapoor TM、Allison DW、Weinberg RJ、Craig AM、Sheng M(1998年4月)。「CRIPT、PSD-95/SAP90の3番目のPDZドメインに結合する新しいシナプス後タンパク質」。Neuron。20(4):693–707。土井:10.1016 / S0896-6273(00)81009-0。PMID9581762 。_ S2CID16068361 。_
ブレンマンJE、トピンカJR、クーパーEC、マギーAW、ローゼンJ、ミルロイT他 (1998年11月)。「シナプス後肥厚-93の樹状突起微小管への局在化および微小管関連タンパク質1Aとの相互作用」。ジャーナルオブニューロサイエンス。18(21):8805–13。土井:10.1523/JNEUROSCI.18-21-08805.1998。PMC6793550 。_ PMID9786987 。_
Coleman SK、Newcombe J、Pryke J、Dolly JO(1999年8月)。「ヒトCNSにおけるKv1チャネルのサブユニット構成」。神経化学ジャーナル。73(2):849–58。土井:10.1046/j.1471-4159.1999.0730849.x。PMID10428084 。_ S2CID20632070 。_
D’Adamo MC、Imbrici P、Sponcichetti F、Pessia M(1999年8月)。「周期性失調症1型症候群に関連するKCNA1遺伝子の変異は、ヘテロマー電位依存性K(+)チャネル機能を損なう」。FASEBJournal。13(11):1335–45。土井:10.1096/fasebj.13.11.1335。PMID10428758 。_ S2CID12876970 。_
Hogan A、Shepherd L、Chabot J、Quenneville S、Prescott SM、Topham MK、Gee SH。「ガンマ1-シントロフィンとジアシルグリセロールキナーゼ-ゼータとの相互作用。PDZ相互作用による核局在化の調節」。Journal ofBiologicalChemistry。276(28):26526–33。土井:10.1074/jbc.M104156200。PMID11352924 。_
Cukovic D、Lu GW、Wible B、Steele DF、Fedida D。「Kv1.5およびKv1.4カリウムチャネルの個別のアミノ末端ドメインは、α-アクチニン-2のスペクトリンリピートと相互作用します」。FEBSレター。498(1):87–92。土井:10.1016 / S0014-5793(01)02505-4。PMID11389904 。_ S2CID20622483 。_
今村F、前田S、土井T、藤吉Y。「2番目のPDZドメインのリガンド結合は、PSD-95とKv1.4カリウムチャネルのクラスター化を調節します」。Journal ofBiologicalChemistry。277(5):3640–6。土井:10.1074/jbc.M106940200。PMID11723117 。_
Piserchio A、Pellegrini M、Mehta S、Blackman SM、Garcia EP、Marshall J、Mierke DF。「SAP90のPDZ1ドメイン。構造と結合の特性評価」。Journal ofBiologicalChemistry。277(9):6967–73。土井:10.1074/jbc.M109453200。PMID11747424 。_

外部リンク
米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のKv1.4+カリウム+チャネル
KCNA4 +タンパク質、+米国国立医学図書館の医学主題見出し(MeSH)のヒト
UniProtのPDBで利用可能なすべての構造情報の概要: PDBe -KBのP15385(ラットカリウム電位依存性チャネルサブファミリーAメンバー4)。
には、パブリックドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
には、パブリックドメインの Pfamと InterProからのテキストが組み込まれています:
IPR012897

admin

Share
Published by
admin

Recent Posts

KV Dhanesh

K._V._Dhanesh D…

2か月 ago

KV Chowdary

K._V._Chowdary …

2か月 ago

KVBプラムマンダル

K._V._B._Puram_…

2か月 ago

KVアヌープ

K._V._Anoop  「K…

2か月 ago

KVアナンド

K._V._Anand Kar…

2か月 ago

KVアクシャラ

K._V._Akshara  …

2か月 ago