KCTD7


KCTD7
7を含むカリウムチャネル四量体化ドメインは、KCTD7遺伝子によってコードされるヒトのタンパク質です。選択的スプライシングは、複数の転写変異体をもたらします。 KCTD7 識別子
エイリアス
KCTD7、CLN14、EPM3、7を含むカリウムチャネル四量体化ドメイン
外部ID
OMIM:611725 MGI:2442265 HomoloGene:17687 GeneCards:KCTD7
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 7番染色体(ヒト)
バンド 7q11.21 始める
66,628,881 bp
終わり
66,649,067 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
神経節の卓越性
中前頭回
子宮内膜の間質細胞
黒質
ブロードマンの脳地図10
側坐核
迷走神経の下神経節 前頭極 扁桃体
脳回を帯状にする
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
GO:0001948タンパク質結合
細胞成分 膜 サイトゾル
細胞質
原形質膜
生物学的プロセス
タンパク質のホモオリゴマー化
翻訳後タンパク質修飾
細胞のカリウムイオン恒常性
トランスポーター活動の積極的な規制
膜の過分極
グルタミン酸ホメオスタシス
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez154881 212919 Ensembl ENSG00000243335
該当なしUniProt Q96MP8 Q8BJK1
RefSeq(mRNA)NM_153033 NM_001167961 NM_172509
RefSeq(タンパク質)
NP_001161433 NP_694578 NP_694578.1 NP_766097 場所(UCSC)
Chr 7:66.63 – 66.65 Mb
該当なし
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ウィキデータ

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コンテンツ
1 説明
2 関数
3 臨床的な意義
4 参考文献
5 参考文献

説明
KCTD7遺伝子は、カリウムチャネル四量体化ドメインを含むタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。ファミリーメンバーは構造に基づいて識別され、電位依存性カリウムチャネルに存在するT1ドメインと同様のアミノ末端ドメインを含みます。 KCTD7は、細胞質内局在を示す一次配列と水治療法プロファイルを表示します。ESTデータベース分析は、KCTD7がヒトとマウスの脳で発現していることを示しました。

関数
KCTD7の発現は、細胞膜を過分極させ、パッチクランプ実験でトランスフェクトされたニューロンの興奮性を低下させます。 KCTD7 mRNAおよびタンパク質は、insituハイブリダイゼーションおよび免疫組織化学実験によって示されるように、海馬ニューロン、大脳皮質の深層、およびマウス脳のプルキンエ細胞で発現されます。免疫沈降アッセイは、KCTD7がプルドホマリーを行い、ユビキチンリガーゼ複合体の成分であるカリン-3( CUL3 )と直接相互作用することを示しています。これらの相互作用は、KCTD7のBTB/POZドメインを介して媒介されると考えられています。ただし、KCTD7は相互作用cullin-1( CUL1 )を示しません。免疫沈降アッセイはまた、KCTD7がユビキチンフラグと相互作用しないことを示しており、それ自体がユビキチン化を受けることなく、ユビキチンリガーゼ複合体におけるKCTD7の潜在的な役割を示唆しています。免疫蛍光顕微鏡は、トランスフェクトされたCOS-7細胞における組換えGFP – KCTD7タンパク質の細胞質ゾル発現を示しています。
考えられる仮説の1つは、KCTD7がカリウムチャネルの膜発現レベルを間接的に調節しているというものです。カリン-3ユビキチンリガーゼ複合体と結合することにより、KCTD7はカリウムチャネルの負の調節因子の発現レベルを調節する可能性がしたがって、ニューロンにおけるKCTD7の過剰発現は、パッチクランプ実験で観察されるように、その調節分子の分解を増加させ、細胞膜を通るカリウム電流の増加をもたらします。
培養されたマウス海馬細胞では、発現は細胞体、発達中のニューロン伸長に沿った神経突起静脈瘤、および神経突起成長円錐で見られますが、核では見られません。 Kctd7は、皮質ニューロン、海馬の顆粒状および錐体細胞層、小脳プルキンエ細胞など、無傷のマウス脳全体のニューロンで広く発現しています。ただし、すべての神経細胞がKctd7に対して免疫陽性であるわけではなく、アストロサイトやミクログリア細胞では発現が見られません。小脳溶解物では、発現はP5から2ヶ月まで一定です。内因性KCTD7を発現しないHeLaおよびCOS-1細胞でのKCTD7の過剰発現は、エンドソーム、ER、ゴルジ、リソソーム、または細胞骨格のマーカーとの共局在化を伴わずに、びまん性の細胞質ゾル局在化を示します。
KCTD7のBTB/POZドメインに加えて、他の残基がcullin-3との適切な相互作用に重要です。さらに、全長31kDKctd7アイソフォームがマウスの脳で発現しています。他の主要な免疫反応性バンドには、脾臓、肝臓、腎臓の28 kD種、腎臓の37 kD種、および安定した二量体に対応する可能性が最も高い62kDの形態が含まれていました。複数のバンドの存在は、選択的スプライシングおよび組織特異的調節と一致していました。

臨床的な意義
進行性ミオクローヌスてんかん-3の血族の大規模なモロッコ人家族の3人の罹患メンバーにおいて、KCTD7遺伝子(R99X)のホモ接合ナンセンス変異が同定されています。
進行性ミオクローヌスてんかんの乳児期発症および複数の細胞型における神経セロイドリポフスチン症の病理学的所見を有する2人のメキシコ人兄弟において、KCTD7遺伝子(R184C)のホモ接合変異が同定された。突然変異は全エクソームシーケンシングによって特定され、サンガーシーケンシングによって確認された。この表現型はCLN14として識別されています。KCTD7変異は、32の追加のCLNサンプルでは見つかりませんでした。

参考文献
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参考文献
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には、パブリックドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。