KDEL_(amino_acid_sequence)
KDELは、タンパク質のアミノ酸構造のC末端に位置する哺乳類および植物の標的ペプチド配列です 。KDEL配列は、タンパク質が小胞体（ER）から分泌されるのを防ぎ、誤ってエクスポートされた場合のタンパク質の戻りを容易にします。
機能的なKDELモチーフを持つタンパク質は、ER内腔への逆行性輸送によってゴルジ装置から回収されます。また、他の場所（細胞質など）からERへのタンパク質を標的とします。タンパク質は、この配列が切断された後にのみERを離れることができます。
略語KDELは、各アミノ酸に対応する文字で構成されます。この文字体系は1983年にIUPACとIUBMBによって定義され、次のとおりです。
K —リジン
D —アスパラギン酸
E —グルタミン酸
L —ロイシン
したがって、3文字のコードのKDELシーケンスは次のとおりです。Lys – Asp – Glu – Leu。
可溶性の常在タンパク質は、タンパク質のC末端にKDELシグナル配列が含まれている限り、ERに残ります。しかし、小胞の出芽はそのような動的なプロセスであり、小胞体には高濃度の可溶性タンパク質が存在するため、可溶性タンパク質は、COPIIでコーティングされた小胞を介して誤ってシスゴルジに輸送されます。KDELシグナル配列を含むタンパク質の輸送メカニズムは、COPIIおよびCOPIベシクルに付着したKDEL受容体によって促進されます。
コンテンツ
1 KDEL受容体
2 酵母や植物に相当
3 も参照してください
4 参考文献
KDEL受容体
上記は、160μg/mlのeGFP-RTAで処理されたHeLa細胞のビデオです。ビデオは毒素治療の30分後、45フレーム/時間で始まります。
KDEL受容体は、タンパク質がゴルジ体からERに輸送されるメカニズムを開始します。これらのタンパク質は元々小胞体に由来し、シスゴルジに逃げ込んだ。 KDELシグナル配列は、シスゴルジ、リソソーム、および分泌小胞に一般的に存在するKDEL受容体によって認識されます。これらの受容体は、各輸送サイクル中にリサイクルされます。KDEL受容体の結合はpHに依存し、リガンド（標的タンパク質）は独特の低いpHのためにシスゴルジの受容体に強く結合します（6、invitro実験ではpH5が最も強い結合を示します） cis-Golgiネットワークの生化学的環境の特徴。KDEL受容体を含む小胞がERに到達すると、ERのpHが高い（7.2-7.4） ため、受容体は不活性になり、標的タンパク質/リガンドが放出されます。
ベッカーらによって行われた研究。実験とシミュレーションを通じて、細胞表面でのKDEL受容体/貨物のクラスター化は、細胞膜との間の貨物同期受容体の輸送によって引き起こされることが実証されました。右のビデオは、ベッカーらによって行われた実験を示しています。開始から終了までの完全な実験（60分）を使用して、KDEL受容体クラスタリングの時間依存性のダイナミクスを示します。論文の中で、著者らは、標的治療薬の設計に使用する潜在的な理解のために、受容体クラスター化と動的再編成の作用機序を理解することの重要性に注目しています。
酵母や植物に相当
同様の配列HDELは酵母でも同じ機能を果たしますが、植物はKDELとHDELの両方のシグナル伝達配列を利用することが知られています。
略語HDELは、KDELと同じ表記法に従います。
H —ヒスチジン
D —アスパラギン酸
E —グルタミン酸
L —ロイシン
3文字のコードは次のとおりです。His — Asp — Glu — Leu。
も参照してください
ER保持
KKXX（アミノ酸配列）
小胞体タンパク質保持受容体KDELR1 KDELR2
KDELR3
参考文献
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