KDM1B


KDM1B
リジン(K)特異的デメチラーゼ1Bは、ヒトではKDM1B遺伝子によってコードされるタンパク質です。 KDM1B 利用可能な構造 PDB 人間のUniProt検索:PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
4FWE、4FWF、4FWJ、4GU0、4GU1、4GUR、4GUS、4GUT、4GUU、4HSU _ _ _ _
識別子
エイリアス
KDM1B、AOF1、C6orf193、LSD2、bA204B7.3、dJ298J15.2、リジンデメチラーゼ1B
外部ID
OMIM:613081 HomoloGene:131158 GeneCards:KDM1B
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 6番染色体(ヒト)
バンド 6p22.3 始める
18,155,329 bp
終わり
18,223,854 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
二次卵母細胞
単球
気管支上皮細胞
ランゲルハンス島
骨髄
神経節の卓越性
甲状腺の右葉
骨髄細胞
甲状腺の左葉
直腸
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
金属イオン結合
DNA結合
オキシドレダクターゼ活性
フラビンアデニンジヌクレオチド結合
ヒストンデメチラーゼ活性
GO:0001948タンパク質結合
亜鉛イオン結合
ヒストンバインディング
FADバインディング
細胞成分 核 核質
ヌクレオソーム
生物学的プロセス
多細胞生物の発達
転写の調節、DNAテンプレート
遺伝子刷り込みによる遺伝子発現の調節
DNAメチル化の調節
転写、DNAテンプレート
配偶子の生成に関与するDNAメチル化
タンパク質の脱ユビキチン化
ヒストンH3-K4脱メチル化
クロマチン構成
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez 221656
該当なしEnsembl ENSG00000165097
該当なしUniProt Q8NB78
該当なし
RefSeq(mRNA) NM_153042 NM_001364614 該当なし
RefSeq(タンパク質) NP_694587 NP_001351543 該当なし
場所(UCSC)
Chr 6:18.16 – 18.22 Mb
該当なし
PubMed検索
該当なし
ウィキデータ
人間の表示/編集

関数
KDM1Bなどのフラビン依存性ヒストンデメチラーゼは、遺伝子発現とクロマチン機能を調節するエピジェネティックマークであるヒストンリジンメチル化を調節します。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000165097 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
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参考文献
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には、パブリックドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
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  人間の第6染色体上の遺伝子に関するこ