KDM2A

KDM2A
Fボックスおよびロイシンリッチリピートタンパク質11（FBXL11）としても知られるリジン特異的デメチラーゼ2A （KDM2A）は、ヒトではKDM2A遺伝子によってコードされる酵素です。 KDM2Aは、ヘム鉄を含まないタンパク質であるα-ケトグルタル酸依存性ヒドロキシラーゼのスーパーファミリーのメンバーです。 KDM2A 利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB
PDBIDコードのリスト
2YU1、2YU2、4BBQ _ _ _ _
識別子
エイリアス
KDM2A、CXXC8、FBL11、FBL7、FBXL11、JHDM1A、LILINA、リジンデメチラーゼ2A
外部ID
OMIM：605657 MGI：1354736 HomoloGene：56564 GeneCards：KDM2A
遺伝子の位置（ヒト） Chr。 11番染色体（ヒト）
バンド 11q13.2 始める
67，119，263 bp
終わり
67，258，082 bp
遺伝子の位置（マウス） Chr。 19番染色体（マウス）
バンド
19 | 19 A
始める
4，364，447 bp
終わり
4，448，313 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
羊水
胚上皮
脛骨
腓腹神経
乳首
内臓胸膜
壁側胸膜
骨髄細胞 胸腺 幽門
その他の参照発現データ BioGPS その他の参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能
DNA結合
オキシドレダクターゼ活性
亜鉛イオン結合
ジオキシゲナーゼ活性
金属イオン結合
ヒストンデメチラーゼ活性
GO：0001948タンパク質結合
ヒストンH3-メチル-リジン-36デメチラーゼ活性
GO：0001200、GO：0001133、GO：0001201 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分
核質 核 生物学的プロセス
非相同端結合による二本鎖切断修復
転写の調節、DNAテンプレート
ヒストンH3-K36脱メチル化
転写、DNAテンプレート
クロマチン構成
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
競合的プロモーター結合による転写の負の調節
遺伝子発現の概日調節
概日リズムの調節
リズミカルなプロセス
出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez22992 225876 Ensembl ENSG00000173120 ENSMUSG00000054611 UniProt Q9Y2K7 P59997
RefSeq（mRNA）NM_001256405 NM_012308 NM_001001984
RefSeq（タンパク質）NP_001243334 NP_036440 NP_001001984
場所（UCSC）
Chr 11：67.12 – 67.26 Mb
19番染色体：4.36 – 4.45 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

人間の表示/
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関数
この遺伝子は、約40アミノ酸のモチーフであるF-boxを特徴とするF-boxタンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。F-boxタンパク質は、リン酸化依存性ユビキチン化で機能するSCF（SKP1- cullin -F-box）と呼ばれるユビキチンタンパク質リガーゼ複合体の4つのサブユニットの1つを構成します。F-boxタンパク質は、 WD-40ドメインを含むFbw、ロイシンリッチリピートを含むFbl、および異なるタンパク質間相互作用モジュールを含むか、認識可能なモチーフを含まないFbxの3つのクラスに分類されます。この遺伝子によってコードされるタンパク質はFblsクラスに属し、Fボックスに加えて、少なくとも6つの高度に変性したロイシンリッチリピートを含みます。
FBXL11 / KDM2Aは、ヒストンH3リジン36デメチラーゼ酵素です。FBXL11 / KDM2Aの酵素活性は、タンパク質のN末端にある保存されたJmjCドメインに依存しており、鉄とアルファケトグルタレートを調整して、ヒドロキシル化ベースのメカニズムを介して脱メチル化を触媒します。最近、FBXL11 /KDM2A内のZF-CxxCDNA結合ドメインが非メチル化DNAと相互作用する能力を持ち、このドメインがFBXL11/KDM2AをゲノムのCpGアイランド領域に向けてヒストンH3を特異的に除去することが実証されました。リジン36のメチル化。このメカニズムは、CpGアイランドにクロマチン環境を作り出すように作用し、これらの調節要素を強調し、大規模で複雑な哺乳類ゲノムの非調節領域と区別します。マウス肝細胞での研究では、この遺伝子が肝臓の糖新生を調節することが示されました。

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