KDM3A


KDM3A
リジンデメチラーゼ3Aは、ヒトではKDM3A遺伝子によってコードされるタンパク質です。 KDM3A 識別子
エイリアス
KDM3A、JHDM2A、JHMD2A、JMJD1、JMJD1A、TSGA、リジンデメチラーゼ3A
外部ID
OMIM:611512 MGI:98847 HomoloGene:10196 GeneCards:KDM3A
遺伝子の位置(ヒト) Chr。 2番染色体(ヒト)
バンド 2p11.2 始める
86,440,647 bp
終わり
86,492,716 bp
遺伝子の位置(マウス) Chr。 6番染色体(マウス)
バンド
6 | 6 C1
始める
71,565,956 bp
終わり
71,609,974 bp
RNA発現パターン Bgee トップ表現
二次卵母細胞
アキレス腱
精子
腓腹神経
腹部の皮膚
右肺
神経節の卓越性
胃粘膜
小唾液腺
人間の陰茎
その他の参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能
鉄イオン結合
GO:0001131、GO:0001151、GO:0001130、GO:0001204DNA結合転写因子活性
ジオキシゲナーゼ活性
金属イオン結合
アンドロゲン受容体結合
オキシドレダクターゼ活性
ヒストンデメチラーゼ活性
GO:0000975転写シス調節領域結合
クロマチンDNA結合
ヒストンH3-メチル-リジン-9デメチラーゼ活性
GO:0001948タンパク質結合
RNAポリメラーゼIIコアプロモーター配列特異的DNA結合
細胞成分
細胞質 膜 核質 核 クロマチン
生物学的プロセス
アンドロゲン受容体シグナル伝達経路
細胞分化
転写の調節、DNAテンプレート
ヒストンH3-K9ジメチル化
幹細胞分化の調節
幹細胞集団維持の調節
転写、DNAテンプレート
転写の正の調節、DNAテンプレート
精子形成
ホルモンを介したシグナル伝達経路
ヒストンH3-K9メチル化の負の調節
遺伝子発現の調節
ホルムアルデヒド生合成プロセス
精子核の伸長
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の調節
ヒストンH3-K9脱メチル化
白血病抑制因子に対する細胞応答
クロマチン構成
寒冷誘発熱発生の正の調節
出典:Amigo / QuickGO
オーソログ
種族
人間
ねずみEntrez55818 104263 Ensembl ENSG00000115548 ENSMUSG00000053470 UniProt Q9Y4C1 Q6PCM1
RefSeq(mRNA) NM_001146688 NM_018433 NM_001038695 NM_173001 NM_001362200 NM_001362201
RefSeq(タンパク質) NP_001140160 NP_060903 NP_001033784 NP_766589 NP_001349129 NP_001349130
場所(UCSC)
Chr 2:86.44 – 86.49 Mb
Chr 6:71.57 – 71.61 Mb
PubMed検索
ウィキデータ

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関数
この遺伝子は、jumonji C(JmjC)ドメインを含むジンクフィンガータンパク質をコードしており、ホルモン依存性の転写活性化に関与している可能性が選択的スプライシングは、複数の転写変異体をもたらします。KDM3Aは、H3K9me1およびH3K9me2残基の脱メチル化を触媒します。その機能は、補因子Fe(II)とα-ケトグルタル酸の存在に依存しています。

参考文献
^ GRCh38:Ensemblリリース89:ENSG00000115548 – Ensembl、2017年5月 ^ GRCm38:Ensemblリリース89:ENSMUSG00000053470 – Ensembl、2017年5月 ^ 「HumanPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。国立バイオテクノロジー情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「Entrez遺伝子:リジンデメチラーゼ3A」。
^ 山根K、Toumazou C、塚田Y、Erdjument-Bromage H、Tempst P、Wong J、Zhang Y。「JmjCを含むH3K9デメチラーゼであるJHDM2Aは、アンドロゲン受容体による転写活性化を促進します」。セル。125(3):483–495。土井:10.1016/j.cell.2006.03.027。PMID16603237。_  

参考文献
Wellmann S、Bettkober M、Zelmer A、Seeger K、Faigle M、Eltzschig HK、BührerC。「低酸素症はHIF-1を介してヒストンデメチラーゼJMJD1Aをアップレギュレートします」。生化学的および生物物理学的研究コミュニケーション。372(4):892–897。土井:10.1016/j.bbrc.2008.05.150。PMID18538129 。_
には、パブリックドメインにある米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。
Stub
  人間の2番染色体上の遺伝子に関するこ